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がん関連遺伝子のコピー数多型のNGS解析時の精度管理試料 Seraseq Copy Number Variation (CNV) Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68213

NGS(次世代シークエンシング)解読により、がん関連遺伝子のコピー数多型(Copy Number Variation、CNV)を解析する際に用いる精度管理試料です。乳がん解析用と、肺がん・脳腫瘍解析用の製品があります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

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特長

  • ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。
  • 目的遺伝子を含む130 kbの合成DNAコンストラクト中に、追加コピーを組み込んでいます。
  • 精製DNAを独自のマトリックスに封入した人工血漿様の製品です。
  • 乳がん解析用と、肺がん・脳腫瘍解析用の製品があります。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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SeraseqゲノムDNA標的製品(がんおよび遺伝性疾患研究用製品)の製造について

  • 目的の変異を有する変異体DNAを合成・処理し、デジタルPCRで厳密に定量する。
  • GM24385細胞株から抽出したゲノムDNAをバックグラウンドとして、これに合成した変異体DNAを適切な対立遺伝子頻度となるように添加する。
  • 独自のマトリックスへ封入する。
Seraseqの製造方法

下図は、Reference Material(精製DNAを独自のマトリックスに封入した人工血漿様製品)の場合。

Reference Materialの製造方法


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仕様

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

シリーズ名 Breast CNV Mix Lung & Brain CNV Mix
検出遺伝子 ERBB2、FGFR3、MYC EGFR、MET、MYCN
追加コピー数 +3 +6 +12 +3 +6 +12
商品コード 0710-0411 0710-0412 0710-0413 0710-0414 0710-0415 0710-0416
Fold
Amplification
2.5 4.0 7.0 2.5 4.0 7.0
CNV
(コピー数)
5 8 14 5 8 14
製品形状 GM24385細胞からゲノムDNA抽出をし、変異体DNAを添加したものを安定化後、独自のマトリックス(Matribase)に封入したもの(人工血漿様)
濃 度 10 ng/μl
容 量 20 μl

Fold Amplification = (Copies of Target Gene)÷(Copies of Reference Genome)
CNV(コピー数)=(Fold Amplification)×2
追加コピー数 = (Fold Amplification×2)- 2



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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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価格

■ 乳がん解析用

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

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■ 肺がん・脳腫瘍解析用

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Lung & Brain CNV Mix, +3 copies, Seraseq

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Lung & Brain CNV Mix, +6 copies, Seraseq

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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