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リンパ腫関連遺伝子のNGS解析時の精度管理試料 Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material

掲載日情報:2024/12/03 現在Webページ番号:71615

リンパ腫関連遺伝子の変異を、DNA試料を用いた次世代シークエンシング(NGS)で解析する際に用いる精度管理試料です。創薬可能な変異を主とした26種類の変異を解析できます。ctDNA(血中腫瘍DNA)試料との比較に用いるctDNA Mix、精製したゲノムDNA試料との比較に用いるDNA Mutation Mix、FFPE(パラフィン包埋ホルマリン固定)試料との比較に用いるFFPE Reference Materialがあります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


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Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

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リンパ腫について

リンパ腫はリンパ系のがんであり、血液疾患全体の約3分の1を占め、また米国ではがん全体の約5%程度がリンパ腫と診断され、血液がんの中で最大の患者数です。この病気には多くの亜型がありますが、最も有名なのはホジキンリンパ腫(HL)と非ホジキンリンパ腫(NHL)で、これらは大人だけでなく子供でも発症します。


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特長

  • 核酸の抽出(FFPE Reference Materialのみ)、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。
  • 個々の遺伝子変異や融合遺伝子について、陽性な細胞株をそれぞれ用意する必要がありません。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

品名 Lymphoma ctDNA Mix
検出できる
遺伝子変異の数
リンパ腫関連遺伝子の変異、
26 variant
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
Translocation(6)、SNV(18)、Del(2)
製品形状 目的の変異を有する変異体DNAを記載の対立遺伝子頻度(AF)になるようにGM24385細胞に導入した後、ゲノムDNAを抽出し、ctDNAのサイズ(150~220 bp)に断片化、精製したものをバッファーに溶解
容量・包装 10 ng/μl、25 μl/vial
AF 1% 0710-3182
AF 0.5% 0710-3183
AF 0.1% 0710-3184
WT 0710-3181
品名 Lymphoma DNA Mutation Mix Lymphoma FFPE DNA Reference Material
検出できる
遺伝子変異の数
リンパ腫関連遺伝子の変異、
26 variant
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
Translocation(6)、SNV(18)、Del(2)
製品形状 目的の変異を有する変異体DNAをGM24385細胞に導入した後、ゲノムDNAを抽出し、バッファーに溶解 目的の変異を有する変異体DNAをGM24385細胞に導入した後、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ブロックを作製し、10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 15 ng/μl、25 μl/vial 1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-2203 0710-2202

Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Materialに含まれる変異遺伝子

■転座

5'側遺伝子3'側遺伝子
NPM1ALK
HSP90AA1BCL6
CCND1CDC42BPB
BIRC3MALT1
MYCIGH
TBL1XR1TP63

■転座以外の変異

遺伝子名核酸変異アミノ酸変異変異の種類
BCL2c.302G>Cp.G101ASNV
BRAFc.1799T>Ap.V600ESNV
DNMT3Ac.2645G>Ap.R882HSNV
EZH2c.1922A>TY641FSNV
IDH2c.515G>Ap.R172KSNV
MYD88c.794T>Cp.L265PSNV
CXCR4c.1013C>Gp.S338XSNV
CXCR4c.1013C>Ap.S338XSNV
NOTCH1c.7541_7542delp.P2514Rfs*4Del
NOTCH2c.7198C>Tp.R2400*SNV

 

遺伝子名核酸変異アミノ酸変異変異の種類
RHOAc.50G>Tp.G17VSNV
SF3B1c.2098A>Gp.K700ESNV
STAT3c.1919A>Tp.Y640FSNV
STAT3c.1982A>Tp.D661VSNV
STAT3c.1940A>Tp.N647ISNV
STAT5Bc.1994A>Tp.Y665FSNV
STAT5Bc.1924A>Cp.N642HSNV
TP53c.743G>Ap.R248QSNV
TP53c.820delp.V274Ffs*71Del
TP53c.818G>Ap.R273HSNV

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関連製品:がん陰性コントロール(Wild Type、WT)

未処理のGM24385細胞から調製した製品です。がん陰性コントロールとして使用できます。
TNA:Total Nucleic Acid
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品名 TNA WT(DNA/RNA)Mix FFPE WT(DNA/RNA)Reference Material
Compromised
製品形状 GM24385細胞から抽出したゲノムDNAおよび全RNAをバッファーに溶解 GM24385細胞をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 25 ng/μl、20μl/vial
2 vials(DNA/RNA)
1 FFPE curl/vial 1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-1580 0710-1710 0710-0137

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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価格

■ Seraseq Lymphoma ctDNA Mix

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時15分現在]

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Seraseq ctDNA Lymphoma Mix AF1%
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Seraseq ctDNA Lymphoma Mix AF05
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Seraseq ctDNA Lymphoma Mix AF1%

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Seraseq ctDNA Lymphoma Mix WT

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■ Seraseq Lymphoma DNA Mutation Mix

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Seraseq Lymphoma DNA Mutation Mix

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■ Seraseq Lymphoma FFPE DNA Reference Material

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■ がん陰性コントロール(WT)

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TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)
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NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。ゲノムDNAおよび全RNAのセット。
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製品記事 Seraseq Tumor Mutation DNA Mix
Seraseq Myeloid Mutation DNA Mix / Fusion RNA Mix
Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Inherited Cancer DNA Mix v1
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Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
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Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq
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FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)
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TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)

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Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq

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説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
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FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)

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reagent@funakoshi.co.jp

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