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TMB(腫瘍遺伝子変異量)のNGS解析時の標準物質 Seraseq TMB Genomic DNA Mix / FFPE Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68215

NGS(次世代シークエンシング)により求められるがんマーカーTMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)の解析の際に用いる標準物質です。精製DNA試料との比較に用いるGenomic DNA Mixと、FFPE(パラフィン包埋ホルマリン固定)試料との比較に用いるFFPE Reference Materialがあります。TMBは、免疫チェックポイント阻害物質の研究に有用であると考えられています。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


TMB(腫瘍遺伝子変異量)と免疫チェックポイント阻害物質について

TMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)は、がん細胞中の後天的に獲得された(蓄積された)体細胞変異の総量を示す値です。NGS(次世代シークエンシング)によりがん細胞と正常細胞の遺伝子配列を比較して、百万塩基(Mb)あたり何塩基の変異が入っているかで表されます。TMBスコアはがんの種類により異なりますが、同じがんでも疾患の経過とともに変化することも報告されています。

がん治療薬として免疫チェックポイント阻害物質の研究がさかんに行われていますが、免疫システムからブレーキを外すことによる自己免疫疾患発症という重大なリスクがあります。免疫チェックポイント阻害物質の安全性と有効性を最大化するために、その使用に反応する可能性が高い患者を特定する必要があります。

変異の入った遺伝子から発現した変異タンパク質は、非自己と認識され免疫細胞から攻撃を受けやすくなります。そのため、TMBスコアと免疫チェックポイント阻害物質の有効性にはある程度の相関性があると言われております。



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本製品の使用例

TMB-Genomic-DNAの使用例
TMB-Reference-Materialの使用例

Seraseq TMB Genomic DNA Mix / FFPE Reference Materialの使用例
複数の研究室において、A) Genomic DNA Mix、B) FFPE Reference Materialそれぞれを用いて、Targeted NGSによりTMBスコアを求めた。枠中の数字は、WES(全エクソソームシークエンシング)により求めたTMBスコア。


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特長

  • WES(全エクソソームシークエンシング)およびtargeted NGSのライブラリー調製に使用できます。
  • NGS解析の様々なステップでの標準物質として使用できます:核酸の抽出(FFPE Reference Materialのみ)、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや、標準化に有用です。
  • WES解読後、独自のバイオインフォマティクス解析により、TMBスコアを決定しています。
  • 様々なTMBスコアの製品を取りそろえています。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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TMB Genomic DNA Mix / FFPE Reference Materialの製造について

  • Genomic DNA Mix:同一ドナー由来の肺がん由来細胞株と末梢血リンパ芽球細胞(正常細胞)それぞれから抽出・精製DNAをバッファーに溶解させたもの
  • FFPE Reference Material:30%の腫瘍含有率に調整したヒト肺がん細胞株をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10μmの切片に切断したもの(curl)
TMB-Reference-Materialの製造方法


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製品一覧

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

シリーズ名 Tumor Mutational Burden (TMB)
フォーマット Genomic DNA Mix FFPE Reference Material
製品形状 同一ドナー由来の肺がん由来細胞株と末梢血リンパ芽球細胞(正常細胞)それぞれから抽出・精製DNAをバッファーに溶解させたもの 30%の腫瘍含有率に調整したヒト肺がん細胞株をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10μmの切片に切断したもの(curl)
容量・包装 50 ng/μl、10μl / vial
2 vials(がん/正常)
1 FFPE curl / vial
2 vials
Score 7 Small cell lung cancer; carcinoma (stage E) 0710-1326 0710-1310
Score 9 Lung adenocarcinoma (stage 1) 0710-1325 0710-1308
Score 13 - 0710-1586 0710-1618
Score 20 Non-small cell lung cancer; carcinoma 0710-1324 0710-1309
Score 26 Lung adenocarcinoma (stage 4) 0710-1323 0710-1307

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状②



ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV DNA Mix RM(血漿様)
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
DNAからの骨髄性がんの解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
RNAからの骨髄性がんの解析 融合遺伝子 RNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様)
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix


肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様)
NGS特集へのリンク

Seraseqシリーズ紹介の動画も上記の「NGS特集」にアップされています。


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価格

■ Seraseq Tumor Mutational Burden (TMB) Genomic DNA Mix

[在庫・価格 :2024年04月24日 20時55分現在]

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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 7, Seraseq
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NGSにより求められるがんマーカーTMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)の解析の際に用いる標準物質。DNA Mix溶液。
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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 20, Seraseq
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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 26, Seraseq
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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 7, Seraseq

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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 9, Seraseq

文献数: 0

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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 13, Seraseq

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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 20, Seraseq

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Genomic DNA Tumor Mutational Burden (TMB) Mix Score 26, Seraseq

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■ Seraseq Tumor Mutational Burden (TMB) FFPE Reference Material

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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 7, Seraseq
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NGSにより求められるがんマーカーTMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)の解析の際に用いる標準物質。ヒト肺がん細胞株をFFPE処理後に切断した切片。
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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 13, Seraseq
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NGSにより求められるがんマーカーTMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)の解析の際に用いる標準物質。ヒト肺がん細胞株をFFPE処理後に切断した切片。
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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 26, Seraseq
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NGSにより求められるがんマーカーTMB(Tumor Mutational Burden:腫瘍遺伝子変異量)の解析の際に用いる標準物質。ヒト肺がん細胞株をFFPE処理後に切断した切片。
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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 7, Seraseq

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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 9, Seraseq

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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 13, Seraseq

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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 20, Seraseq

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FFPE Tumor Mutational Burden (TMB) Reference Material Score 26, Seraseq

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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