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固形腫瘍のがん関連遺伝子のNGS解析時の精度管理試料 Seraseq Tumor Mutation DNA Mix

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68210

NGS(次世代シークエンシング)解読により、固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Tri-Level-Tumor-Mutation-DNA-MixのDNA量ロット差

Seraseq Tri-Level Tumor Mutation DNA Mix(#710-0097)に含まれる変異体DNAの量についてロット毎の検証
Lot 1~3の3ロットにそれぞれ含まれている対立遺伝子頻度(AF)10%(14種)、AF7%(13種)、AF4%(12種)の合計39種の変異体DNAの量について、デジタルPCRで定量を行った。なお、製品には合計40種の変異体DNAが含まれているが、残りの1種(TP53 c.263delC)の定量はNGSベースで行っている。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

お申し込みはこちらから


特長

  • ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。
  • 実際のNGS解析で用いられる複数ドナー由来の高度に多重化された試料を模しています。
  • 対立遺伝子頻度(allele frequency:AF)が7%(#0710-0095)と10%(#0710-0094)の製品があります。Tri-Level Mix(#0710-0097)は、AFが4%、7%、10%のDNAの混合物です。

本製品にはNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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SeraseqゲノムDNA標的製品(がんおよび遺伝性疾患研究用製品)の製造について

  • 目的の変異を有する変異体DNAを合成・処理し、デジタルPCRで厳密に定量する。
  • GM24385細胞株から抽出したゲノムDNAをバックグラウンドとして、これに合成した変異体DNAを適切な対立遺伝子頻度となるように添加する。
Seraseqの製造方法

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仕様

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

シリーズ名 Tumor DNA Mix Tri-Level Tumor DNA Mix
商品コード 0710-0095(AF7%)
0710-0094(AF10%)
0710-0097
含まれるがん関連遺伝子・変異体の数 28 gene
40 variants
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
SNVs(25), INDELs(13), SVs(2)
対立遺伝子頻度(AF) 7%(0710-0095)
10%(0710-0094)
4%(13)、7%(13)、10%(14)
()は含まれる変異体の数
製品形状 GM24385細胞からゲノムDNA抽出をし、変異体DNAを添加したものをバッファーに溶解
濃 度 10 ng/μl
容 量 25 μl

■ 製品に含まれるがん関連遺伝子(赤文字は一般的ながん関連遺伝子)

AKT1APCATMBRAFCTNNB1EGFRERBB2
FGFR3FLT3FOXL2GNA11GNAQGNASIDH1
JAK2KITKRASMPLNCOA4-RETNPM1NRAS / CSDE1
PDGFRAPIK3CAPTENRETSMAD4TP53TPR-ALK

がん関連遺伝子・変異体の完全なリストについては、価格表に掲載されている製品データシートをご確認下さい。


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関連製品:がん陰性コントロール(Wild Type、WT)

未処理のGM24385細胞から調製した製品です。がん陰性コントロールとして使用できます。
TNA:Total Nucleic Acid
商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

品名 TNA WT(DNA/RNA)Mix
製品形状 GM24385細胞から抽出したゲノムDNAおよび全RNAをバッファーに溶解
容量・包装 25 ng/μl、20μl/vial
2 vials(DNA/RNA)
商品コード 0710-1580

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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価格

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

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Tumor Mutation DNA Mix v2 AF7 HC, Seraseq
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NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。DNA Mix溶液。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年3月15日号 p.5
ニュース2023年9月1日号 p.8
ニュース2024年9月1日号 p.9

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Tumor Mutation DNA Mix v2 AF10 HC, Seraseq
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NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。DNA Mix溶液。
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掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.9
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NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。3つの対立遺伝子頻度(allele frequency:AF)のDNAのMix溶液。
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[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

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Tumor Mutation DNA Mix v2 AF7 HC, Seraseq

文献数: 0

説明文 NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。DNA Mix溶液。
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説明文 NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。DNA Mix溶液。
法規制等
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掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.9
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説明文 NGS解読により,固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を解析する際に用いる精度管理試料。3つの対立遺伝子頻度(allele frequency:AF)のDNAのMix溶液。
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ニュース2023年9月1日号 p.8
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■ がん陰性コントロール(WT)

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TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)
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説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。ゲノムDNAおよび全RNAのセット。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

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Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
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TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)

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説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。ゲノムDNAおよび全RNAのセット。
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Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
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Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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