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FFPE試料からのがん関連遺伝子のNGS解析時の精度管理試料 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68211

固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を、FFPE(パラフィン包埋ホルマリン固定)試料から抽出したDNAを用いてNGS(次世代シークエンシング)解読により解析する際に用いる精度管理試料です。FFPE試料から抽出されたDNAに見られる脱プリン、脱ピリミジン、脱アミノ、酸化、ニック、二本鎖切断などのDNA損傷が、本製品から抽出したDNAにも同様に生じます。そのため、ワークフロー全体の評価に有用です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

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特長

  • 核酸の抽出、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

含まれるがん関連遺伝子・変異体の数 17 gene、34 variants
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
SNVs(18), INDELs(10), CNVs(3), SVs(3)
製品形状 目的の変異を有する変異体DNAをGM24385細胞に導入後、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ブロックを作製し、10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-1492

■ Compromised FFPE Tumor DNA Reference Materialに含まれるがん関連遺伝子

AKT1ALKBRAFBRCA1BRCA2EGFR
ERBB2KITKRASMETMYCNRAS
PIK3CATP53CD74-ROS1EML4-ALKNCOA4-RET

変異体の完全なリストについては、価格表に掲載されている製品データシートをご確認下さい。


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関連製品:がん陰性コントロール(Wild Type、WT)

未処理のGM24385細胞から調製した製品です。がん陰性コントロールとして使用できます。
商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

品名 FFPE WT(DNA/RNA)Reference Material
Compromised
製品形状 GM24385細胞をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 1 FFPE curl/vial 1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-1710 0710-0137

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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関連した特集

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価格

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時15分現在]

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Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material, Seraseq (10μm)
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説明文
固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を,FFPE試料から抽出したDNAを用いてNGS解読により解析する際に用いる精度管理試料。FFPE試料から抽出されたDNAに見られるDNA損傷が,本製品から抽出したDNAにも同様に生じるため,ワークフロー全体の評価に有用。
法規制等
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掲載カタログ ニュース2022年12月1日号 p.5

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時15分現在]

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Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material, Seraseq (10μm)

文献数: 0

説明文 固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を,FFPE試料から抽出したDNAを用いてNGS解読により解析する際に用いる精度管理試料。FFPE試料から抽出されたDNAに見られるDNA損傷が,本製品から抽出したDNAにも同様に生じるため,ワークフロー全体の評価に有用。
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保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2022年12月1日号 p.5

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■ がん陰性コントロール(WT)

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時15分現在]

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納期 文献数
Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq
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説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
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保存条件 法規備考
掲載カタログ

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Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
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FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
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製品記事 Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
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[在庫・価格 :2025年04月25日 16時15分現在]

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Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq

文献数: 0

説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
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製品記事 Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
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FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)

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説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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