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FFPE試料からのがん関連遺伝子のNGS解析時の標準物質 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68211

固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を、FFPE(パラフィン包埋ホルマリン固定)試料から抽出したDNAを用いてNGS(次世代シークエンシング)解読により解析する際に用いる標準物質です。FFPE試料から抽出されたDNAに見られる脱プリン、脱ピリミジン、脱アミノ、酸化、ニック、二本鎖切断などのDNA損傷が、本製品から抽出したDNAにも同様に生じます。そのため、ワークフロー全体の評価に有用です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


特長

  • NGS解析の様々なステップでの標準物質として使用できます:核酸の抽出、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや、標準化に有用です。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

含まれるがん関連遺伝子・変異体の数 17 gene、34 variants
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
SNVs(18), INDELs(10), CNVs(10), SVs(3)
製品形状 目的の変異を有する変異体DNAをGM24385細胞に導入後、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ブロックを作製し、10μmの切片に切断したもの(curl)
容量・包装 1 FFPE curl / vial
商品コード 0710-1492

■ Compromised FFPE Tumor DNA Reference Materialに含まれるがん関連遺伝子

AKT1ALKBRAFBRCA1BRCA2EGFR
ERBB2KITKRASMETMYCNRAS
PIK3CATP53CD74-ROS1EML4-ALKNCOA4-RET

変異体の完全なリストについては、価格表に掲載されている製品データシートをご確認下さい。


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がん陰性コントロール(WT)

未処理のGM24385細胞から調製した製品です。がん陰性コントロール(WT)として使用できます。
商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

製品名 FFPE WT(DNA/RNA)Reference Material
製品形状 GM24385細胞をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10μmの切片に切断したもの(curl)
容量・包装 1 FFPE curl / vial
商品コード 0710-0137

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状②



ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV DNA Mix RM(血漿様)
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
DNAからの骨髄性がんの解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
RNAからの骨髄性がんの解析 融合遺伝子 RNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様)
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix


肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様)
NGS特集へのリンク

Seraseqシリーズ紹介の動画も上記の「NGS特集」にアップされています。


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価格

[在庫・価格 :2024年04月24日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material, Seraseq (10μm)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を,FFPE試料から抽出したDNAを用いてNGS解読により解析する際に用いる標準物質。FFPE試料から抽出されたDNAに見られるDNA損傷が,本製品から抽出したDNAにも同様に生じるため,ワークフロー全体の評価に有用。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
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[在庫・価格 :2024年04月24日 20時55分現在]

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Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material, Seraseq (10μm)

文献数: 0

説明文 固形腫瘍のがん遺伝子やがん抑制遺伝子の変異を,FFPE試料から抽出したDNAを用いてNGS解読により解析する際に用いる標準物質。FFPE試料から抽出されたDNAに見られるDNA損傷が,本製品から抽出したDNAにも同様に生じるため,ワークフロー全体の評価に有用。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

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■ がん陰性コントロール(WT)

[在庫・価格 :2024年04月24日 20時55分現在]

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詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
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納期 文献数
FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる標準物質。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material
次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
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[在庫・価格 :2024年04月24日 20時55分現在]

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FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)

文献数: 0

説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる標準物質。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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