HOME > 試薬 > 遺伝子工学 > PCR・シークエンシング > シークエンシング > Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material

融合遺伝子などがん関連遺伝子変異をRNAのNGSで解析する際の精度管理試料 Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68214

融合遺伝子やエクソンスキップバリアント、複数エクソンの欠損などのがん関連遺伝子の変異を、RNA試料を用いた次世代シークエンシング(NGS)で解析する際に用いる精度管理試料です。精製したRNA試料との比較に用いるRNA Mixと、FFPE(パラフィン包埋ホルマリン固定)試料との比較に用いるFFPE Reference Materialがあります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


RNA-Fusion-v4のロット差検証

Seraseq Fusion RNA v4 FFPE Reference Material(#710-0496)のロット差検証
異なる3ロット(Block 1~3)の製品からRNAを抽出し、Oncomine Focus Assay(Thermo Fisher Scientific社)を用いたNGS解析により、融合遺伝子の検出を行った。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

お申し込みはこちらから


がん研究における遺伝子変異の解析法について

全ゲノム解読および多数の遺伝子発見という過去10年の研究成果のがん研究分野での利用が急速に進んでいます。検出が困難な構造多型の検出法は、マニュアル操作による高度に多重化されたFISHから、次世代シーケンシング(NGS)へと置き換わり始めています。本製品は、この高度に多重化されたNGSアッセイに対応した精度管理試料です。


目次に戻る

特長

  • 核酸の抽出(FFPE Reference Materialのみ)、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。
  • 個々の遺伝子変異や融合遺伝子について、陽性な細胞株をそれぞれ用意する必要がありません。
  • 幅広いがんの解析用のv4と、Neurotrophic Tyrosine Receptor Kinase(NTRK)関連の変異解析用製品の2つのシリーズがあります。

本製品にはRNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


目次に戻る

Fusion RNA FFPE Reference Materialの製造について

Fusion RNA FFPE Reference Materialの製造法

目次に戻る

製品一覧

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

シリーズ名 Fusion RNA v4 NTRK Fusion RNA
検出できる
遺伝子変異
幅広いがんにおける18種類の融合遺伝子やエクソンスキップバリアント、複数エクソンの欠損 NTRKに関連した15種類の融合遺伝子
フォーマット RNA Mix FFPE Reference Material RNA Mix FFPE Reference Material
製品形状 GM24385細胞から全RNA抽出をし、融合遺伝子のmRNAを添加したものをバッファーに溶解 融合遺伝子のmRNAをGM24385細胞に導入後、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10 μmに薄切したもの(curl) GM24385細胞から全RNA抽出をし、融合遺伝子のmRNAを添加したものをバッファーに溶解 融合遺伝子のmRNAをGM24385細胞に導入後、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 25 ng/μl
25 μl
1 FFPE curl/vial 25 ng/μl
20 μl
1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-0497 0710-0496 0710-1696 0710-1031

■Fusion RNA v4に含まれる融合遺伝子

融合遺伝子5'側3'側
CCDC6-RET CCDC6 exon 1RET exon 12
CD74-ROS1 CD74 exon 6ROS1 exon 34
EGFR VariantⅢ EGFR exon 1EGFR exon 8
EGFR-SEPT14 EGFR exon 24SEPT14 exon 10
EML4-ALK EML4 exon 13ALK exon 20
ETV6-NTRK3 ETV6 exon 5NTRK3 exon 15
FGFR3-BAIAP2L1 FGFR3 exon 17BAIAP2L1 exon 2
FGFR3-TACC3 FGFR3 exon 17TACC3 exon 11
KIF5B-RET KIF5B exon 24RET exon 11
LMNA-NTRK1 LMNA exon 2NTRK1 exon 10
MET exon 14 Skipping MET exon 13MET exon 15
NCOA4-RET NCOA4 exon 8RET exon 12
PAX8-PPARG1 PAX8 exon 9PPARG1 exon 3
SLC34A-ROS1 SLC34A2 exon 4ROS1 exon 34
SLC45A3-BRAF SLC45A3 exon 1BRAF exon 8
TFG-NTRK1 TFG exon 5NTRK1 exon 9
TMPRSS2-ERG TMPRSS2 exon 1 (5' UTR)ERG exon 2
TPM3-NTRK1 TPM3 exon 7NTRK1 exon 9

■NTRK Fusion RNAに含まれる融合遺伝子

融合遺伝子5'側3'側
TPM3-NTRK1TPM3 exon 7NTRK1 exon 10
LMNA-NTRK1LMNA exon 11NTRK1 exon 11
IRF2BP2-NTRK1IRF2BP2 exon 1NTRK1 exon 10
SQSTM1-NTRK1SQSTM1 exon 5NTRK1 exon 10
TFG-NTRK1TFG exon 5NTRK1 exon 10
AFAP1-NTRK2AFAP1 exon 14NTRK2 exon 12
NACC2-NTRK2NACC2 exon 4NTRK2 exon 13
QKI-NTRK2QKI exon 6NTRK2 exon 16
TRIM24-NTRK2TRIM24 exon 12NTRK2 exon 15
PAN3-NTRK2PAN3 exon 1NTRK2 exon 17
ETV6-NTRK3ETV6 exon 5NTRK3 exon 14
ETV6-NTRK3ETV6 exon 5NTRK3 exon 15
ETV6-NTRK3ETV6 exon 4NTRK3 exon 15
ETV6-NTRK3ETV6 exon 4NTRK3 exon 14
BTBD1-NTRK3BTBD1 exon 4NTRK3 exon 14

目次に戻る

関連製品:がん陰性コントロール(Wild Type、WT)

未処理のGM24385細胞から調製した製品です。がん陰性コントロールとして使用できます。
TNA:Total Nucleic Acid
商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

品名 TNA WT(DNA/RNA)Mix FFPE WT(DNA/RNA)Reference Material
Compromised
製品形状 GM24385細胞から抽出したゲノムDNAおよび全RNAをバッファーに溶解 GM24385細胞をホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)して作製したブロックを10 μmに薄切したもの(curl)
容量・包装 25 ng/μl、20 μl/vial
2 vials(DNA/RNA)
1 FFPE curl/vial 1 FFPE curl/vial
商品コード 0710-1580 0710-1710 0710-0137

目次に戻る

Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

目次に戻る

関連した特集

NGS特集へのリンク

目次に戻る

価格

■ Seraseq Fusion RNA Mix / FFPE Reference Material v4

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Fusion RNA Mix v4, Seraseq
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 1
  • 使用文献
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
幅広いがんにおける融合遺伝子やエクソンスキップバリアント,複数エクソンの欠損をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。RNA Mix溶液。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年3月15日号 p.5
ニュース2023年9月1日号 p.8
ニュース2024年9月1日号 p.8

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material, Seraseq
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
幅広いがんにおける融合遺伝子やエクソンスキップバリアント,複数エクソンの欠損をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。融合遺伝子のmRNAを導入した細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.8
ニュース2022年11月15日号 p.36
ニュース2024年3月15日号 p.5

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

Fusion RNA Mix v4, Seraseq

文献数: 1

説明文 幅広いがんにおける融合遺伝子やエクソンスキップバリアント,複数エクソンの欠損をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。RNA Mix溶液。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年3月15日号 p.5
ニュース2023年9月1日号 p.8
ニュース2024年9月1日号 p.8

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material, Seraseq

文献数: 0

説明文 幅広いがんにおける融合遺伝子やエクソンスキップバリアント,複数エクソンの欠損をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。融合遺伝子のmRNAを導入した細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.8
ニュース2022年11月15日号 p.36
ニュース2024年3月15日号 p.5

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集


■ Seraseq NTRK Fusion RNA FFPE Reference Material

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
FFPE NTRK Fusion RNA Mix, Seraseq
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
NTRKに関連したがんにおける融合遺伝子をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。RNA Mix溶液。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年10月1日号 p.12

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
FFPE NTRK Fusion RNA Reference Material, Seraseq
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
NTRKに関連したがんにおける融合遺伝子をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。融合遺伝子のmRNAを導入した細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.8

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

FFPE NTRK Fusion RNA Mix, Seraseq

文献数: 0

説明文 NTRKに関連したがんにおける融合遺伝子をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。RNA Mix溶液。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年10月1日号 p.12

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

FFPE NTRK Fusion RNA Reference Material, Seraseq

文献数: 0

説明文 NTRKに関連したがんにおける融合遺伝子をRNA試料を用いたNGSで解析する際に用いる精度管理試料。融合遺伝子のmRNAを導入した細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2024年9月1日号 p.8

製品記事
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集


■ がん陰性コントロール(WT)

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。ゲノムDNAおよび全RNAのセット。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Tumor Mutation DNA Mix
Seraseq Myeloid Mutation DNA Mix / Fusion RNA Mix
Seraseq Inherited Cancer DNA Mix v1
Seraseq Cardiomyopathy Reference Material v1
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
  • メーカーサイト
  • お問い合わせ
説明文
NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

[在庫・価格 :2025年04月25日 16時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

TNA (DNA/RNA) WT Mix, Seraseq (2vial, 20μl each)

文献数: 0

説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。ゲノムDNAおよび全RNAのセット。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Tumor Mutation DNA Mix
Seraseq Myeloid Mutation DNA Mix / Fusion RNA Mix
Seraseq Inherited Cancer DNA Mix v1
Seraseq Cardiomyopathy Reference Material v1
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

Compromised FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq

文献数: 0

説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集

FFPE WT (DNA/RNA) Reference Material, Seraseq (10μm)

文献数: 0

説明文 NGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に,がん陰性コントロール(WT)として使用できる精度管理試料。細胞をFFPE処理後に切断した切片。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 Seraseq Compromised FFPE Tumor DNA Reference Material
Seraseq BRCA1/2 LGR gDNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
Seraseq Lymphoma ctDNA / DNA Mutation Mix / FFPE Reference Material
関連記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集


目次に戻る

お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。