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全トランスクリプトームRNAシークエンシングで融合遺伝子解析をする際の精度管理試料 Seraseq Whole Transcriptome RNA Seq Mix

掲載日情報:2024/11/28 現在Webページ番号:71614

NGSでの全トランスクリプトームRNAシークエンシングを行う際に用いる精度管理試料で、高力価濃度の精製RNAミックスです。腫瘍学での解析に用いる22の融合遺伝子を含み、既知および新規の融合遺伝子の検出に使用でき、トランスクリプトームの包括的な解析が可能となります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

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全トランスクリプトームRNAシークエンシングによる新規がんマーカーの探索について

全トランスクリプトームRNAシークエンシングは、現在の限られたゲノム配列を対象としたターゲットNGSパネルでは検出できない、臨床的に有用な可能性のある融合遺伝子の検出が可能となります。また、一部の臨床がん検査ラボでは、NGSベースのがんプロファイリング検査によって得られる診断情報の向上と臨床応用のために、全トランスクリプトームパネルを評価しています。
マーカーとして用いられる融合遺伝子数の増大と検出効率の向上により、NGSによる融合遺伝子解析の利用が増加することが予測されます。最も重要と思われることは、さまざまながんに対する新しい治療法が、治療のための臨床バイオマーカーとして融合遺伝子を標的としていることです。


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特長

  • ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。
  • 個々の遺伝子変異や融合遺伝子について、陽性な細胞株をそれぞれ用意する必要がありません。
  • RNA Mixに添加したそれぞれの融合遺伝子RNAは、デジタルPCRで正確に定量しています。

本製品にはNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

品名 Whole Transcriptome RNA Seq Mix
用途 全トランスクリプトームRNAシークエンシングによる既知および新規の融合遺伝子の検出
含まれる変異の種類・数 腫瘍学での解析に用いる22の融合遺伝子
製品形状 GM24385細胞から全RNA抽出をし、融合遺伝子のmRNAを添加したものをバッファーに溶解
容量・包装 50 ng/μl、20 μl/vial
商品コード 0710-2129

■ Whole Transcriptome RNA Seq Mixに含まれる融合遺伝子

BCR-ABL1 ETV6-NTRK3 MET exon14 Skipping SLC45A3-BRAF
CCDC6-RET FGFR3-TACC3 NACC2-NTRK2 TCF3-PBX1
CD74-ROS1 KIF5B-RET NCOA4-RET TMPRSS2-ERG
EML4-ALK LMNA-NTRK1 (transcript 1) PML-RARα TPM3-NTRK1
ETV6-ABL1 (transcript 1) LMNA-NTRK1 (transcript 2) RUNX1-RUNX1T1
ETV6-ABL1 (transcript 2) MEF2D-CSF1R SLC34A2-ROS1

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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