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ctDNA(血中循環腫瘍DNA)をNGSでメチル化解析する際の精度管理試料 Seraseq Methylated ctDNA Mutation Mix

掲載日情報:2024/12/03 現在Webページ番号:71617

ctDNA(血中循環腫瘍DNA)のNGSを用いたメチル化解析で使用する精度管理試料です。非メチル化およびメチル化のctDNA Mixがあります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

お申し込みはこちらから


ctDNAのメチル化とがんについて

がんの研究と治療においてctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析が進められています。近年の研究の進歩により、セルフリーDNAのCpGメチル化は、複数の有用性を持つバイオマーカーとして注目され、がんの再発、遺伝子発現のエピジェネティックな制御に関する知見を与え、ctDNAの由来組織が示されることもあります。ctDNAのメチル化の状態は、塩基配列レベルのデータに付け加えられる重要性のある情報であり、メチル化データを組み込んだアッセイが普及しているにもかかわらず、メチル化ctDNAに関する市販の精度管理試料は限られています。


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特長

  • 広範囲のCpG部位がメチル化されているため、すべてのCpGメチル化アッセイに使用できます。
  • Methylated ctDNAとUnmethylated ctDNAを混合することにより、ご希望のメチル化頻度のctDNAを調製することができます。
  • 含まれているctDNAは酵素的切断より断片化されているため、バックグラウンドノイズが低く、生理学的に適切な断片サイズになっています。
  • 高感度デジタルPCRアッセイによりメチル化状態を正確に定量しており、またターゲットNGSパネルにより検証済みです。
  • ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。

本製品にはNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

品名 Unmethylated ctDNA Mutation Mix Methylated ctDNA Mutation Mix
製品形状 Unmethylatedは、GM24385細胞からゲノムDNA抽出し、酵素的に断片化、精製したものをバッファーに溶解。Methylatedは、これに合成したメチル化DNAを添加したもの。
メチル化頻度 <2% >90%
容量・包装 10 ng/μl、25 μl/vial 10 ng/μl、25 μl/vial
商品コード 0710-3088 0710-3089

メチル化頻度の分析例

遺伝子名 メチル化頻度(%)
Unmethylated
(#0710-3088)
Methylated
(#0710-3089)
CCND2 0.44 100
EGFR 0.74 99
ETV6 0.63 114
FANCA 0.78 95
MYB 1.1 103
RET 0.90 104
TFRC 0.70 90

表中に記載の各遺伝子の特定のSNPにおけるメチル化頻度
Unmethylated Mix(#0710-3088)、Methylated Mix(#0710-3089)それぞれ1バッチの解析を行った。

Methylated ctDNA Mutation Mixの分析例

図中に記載の各遺伝子の特定のSNPにおけるメチル化頻度
Unmethylated Mix(#0710-3088)、Methylated Mix(#0710-3089)それぞれ3バッチの解析を行った。


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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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