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ctDNA(腫瘍循環DNA)からMRD(微小残存病変)のNGS解析する際の精度管理試料 Seraseq ctDNA MRD Panel Mix

掲載日情報:2024/12/03 現在Webページ番号:71618

ctDNA(腫瘍循環DNA)試料を用いてMRD(微小残存病変)のNGS解析で使用する精度管理試料です。主に固形腫瘍に見られる臨床的に重要な22種類の変異体が含まれています。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Web面談を承ります

Seraseqはオンコロジー、出生前診断の次世代シークエンサーでの測定結果の信頼性を高める精度管理試料です。
オンコロジーシリーズではCNV、TMB、MSIをはじめ、FFPE、ctDNAなど、出生前診断ではトリソミー13、18、21などの数多くのラインナップを取り扱っています。
製品内容のご説明、シリーズラインナップのご紹介などのご希望があれば、お気軽にお申し付け下さい。
Web面談にて対応させていただきます。お手数をお掛けいたしますが、ご依頼の際は、面談で説明をご希望される内容についてお知らせ下さい。
担当者との調整のため、Web面談実施までに1~2週間頂戴する場合もございます。ご了承下さい。

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特長

  • 主に固形腫瘍に見られる臨床的に重要な22種類の変異体が添加されています。
  • 添加された変異体DNAは、デジタルPCRとNGSで定量されています。
  • Tumor Fraction値が異なる4種類のDNA Mixのセットです。
  • ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出など、NGS解析のさまざまなステップでの精度管理試料として使用できます。
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや標準化に有用です。

Tumor Fraction値:cfDNA(セルフリーDNA)中に含まれるctDNA(腫瘍循環DNA)の割合。
本製品にはNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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仕様

品名 Seraseq ctDNA MRD Panel Mix
含まれる変異体の数 MRDに関連した22 variant
製品形状 合成した変異体DNAを記載のTumor Fraction値になるように導入したヒトがん細胞株およびSNPがマッチしたヒト正常細胞からゲノムDNAを抽出、断片化、精製したものをバッファーに溶解。
容量・包装 10 ng/μl、20 μl/vial
4 vials(Tumor Fraction値:0%(WT)、0.005%、0.05%、0.5%)
商品コード 0710-2146

Seraseq ctDNA MRD Panel Mixに添加された変異体

遺伝子名COSMIC IDアミノ酸変異
AKT1COSM33765p.E17K
ALKCOSM144250p.G1202R
ALKCOSM28055p.F1174L
BRAFCOSM476p.V600E
BRCA1COSM1383519p.K654fs*47
BRCA2COSM1738242p.R2645fs*3
CD74-ROS1N/ATranslocation
EGFRCOSM12370p.L747_P753>S
EGFRCOSM6223p.E746_A750delELREA
EGFRCOSM6224p.L858R
EGFRCOSM6240p.T790M
遺伝子名COSMIC IDアミノ酸変異
EGFRCOSM6256p.S752_I759delSPKANKEI
EML4-ALKN/ATranslocation
ERBB2COSM20959p.A775_G776insYVMA
KITCOSM1314p.D816V
KRASCOSM516p.G12C
KRASCOSM521p.G12D
KRASCOSM554p.Q61H
NCOA4/RETN/ATranslocation
NRASCOSM584p.Q61R
PIK3CACOSM124641p.N1068fs*4
PIK3CACOSM775p.H1047R

Seraseq ctDNA MRD Panel Mixに含まれるDNAのサイズ分布

Seraseq ctDNA MRD Panel Mixに含まれるDNAのサイズ分布<

断片化およびエラー補正後のDNA断片のサイズを分析した。
黒線:全リード、青点:参照配列を含むリード、赤/黄点:変異体を含むリード。
いずれのTumor Fraction値においても、DNA MixはcfDNAを模倣した断片サイズを示している。


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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状② 製品形状③



がんの
プロファ
イリング
固形
腫瘍
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
HRD(相同組換えDNA修復欠損)の解析 SNV DNA Mix FFPE RM
BRCA遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様) FFPE RM
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
Whole Transcriptome解析 融合遺伝子 RNA Mix
血液
がん
リンパ腫の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix DNA Mix FFPE RM
骨髄性がん(ミエロイド)の解析 DNA INDEL、SNV ctDNA Mix DNA Mix
RNA 融合遺伝子 RNA Mix
腫瘍免疫研究 TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
MSI(マイクロサテライト不安定性)の解析 MSI DNA Mix FFPE RM
がんの
モニタ
リング
リキッド
バイオ
プシー
ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV ctDNA Mix RM(血漿様)
ctDNAのメチル化解析 メチル化 ctDNA Mix
ctDNAによるMRD(微小残存病変)の解析 INDEL、SNV、SV ctDNA Mix
その他 代謝酵素関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様) cfDNA Mix DNA Mix

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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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