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Zymo-Seq ATAC Library Kit
オープンクロマチン領域のみのNGS解析を行えます Zymo-Seq ATAC Library Kit
掲載日情報：2024/03/26 現在Webページ番号：71240
哺乳動物の細胞や組織試料からオープンクロマチン領域のNGS解析（ATAC-seq）用のライブラリーを調製するキットです。All-in-oneのキットのため、試料調製、タグ付加（Tagmentation）、およびライブラリー調製が約４時間で完了します。細胞試料から不要なミトコンドリアDNAを排除しつつ、核を単離できます。調製したライブラリーは、イルミナ社のシークエンサー（HiSeq, NextSeq, NovaSeq）と互換性があります。
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ATAC-seqとは
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特長
- わずか50,000個の細胞からライブラリーの調製が可能です。
- 凍結試料からの調製も可能です。
- ミトコンドリアDNAのコンタミネーションを低減させます。
- 試料の調製からライブラリー調製まで、約4時間で行えます。
- All-in-oneキットのため、再現性に優れています。
- スピンカラムが付属しており、タグ付加後のDNA精製操作が簡単に行えます。
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操作方法概略
1. 細胞調製（Cell preparation）
目的の細胞を準備します。
2. 細胞溶解・核単離（Cell lysis and nuceli preparation）
細胞50,000個を溶解した後、核を単離します。
3. タグ付加（Tagmentation reaction）
単離した核をTn5 transposaseとインキュベーションし、オープンクロマチン領域のDNAにシーケンスアダプター配列を導入します。
4. ライブラリー増幅（Library amplification）
インデックスプライマーを用いて増幅し、NGS（次世代シークエンシング）解析を行います。
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使用例
本製品で調製したライブラリーの品質
上段：本製品、中段：標準的なATAC-seq法、下段：ENCODEプロジェクトのDNase-seq法
いずれの方法でもピークの位置が同じであり、高品質で一貫性があることが示された。
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キット内容
- ATAC-S buffer
- ATAC lysis buffer
- ATAC wash buffer
- Tn5 enzyme
- Pre-tagmentation buffer
- ATAC library PCR mix
- UDI tag primer set（Indexes 1～12）
- Low binding tube
- DNA binding buffer＊
- DNA wash buffer＊
- DNA elution buffer＊
- Zymo-spin IC column＊
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価格
[在庫・価格 ：2024年04月28日 00時00分現在]
[在庫・価格 ：2024年04月28日 00時00分現在]
Zymo-Seq ATAC Library Kit (12 preps)
文献数： 0
- 商品コード：D5458
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥180,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | |||
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温,-20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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2 ml Collection Tube
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- 商品コード：C1001-50
- メーカー：ZYR
- 包装：50tubes
- 価格：¥3,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | |||||||
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| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
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- 商品コード：C1001-500
- メーカー：ZYR
- 包装：500tubes
- 価格：¥12,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
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- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
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