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メチル化DNA検出用の亜硫酸水素塩処理(バイサルファイト処理)キット EZ DNA Methylation Kit

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:1109

試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)することにより、メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するキットです。メチル化シトシンは変換されません。本キットで処理した DNA をテンプレートにして PCR を行った後、制限酵素処理、シークエンシング、マイクロアレイなどによりメチル化DNA を検出できます。

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DNAメチル化(メチレーション)について

DNAは、DNAメチルトランスフェラーゼと呼ばれる酵素の働きによって、5’-CG-3’のシトシン基(CpG)がメチル化(メチレーション)されます。DNAのメチル化によって、遺伝子の発現や細胞の分化、発生といった様々な細胞内の働きを制御しています。また、DNAのメチル化は様々な疾患のバイオマーカーとしても注目されています。
また、DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担う5-ヒドロキシメチルシトシン(5-hmC)もまた、新しいエピジェネティックな調節を担っていると考えられています。
近年ではmRNA, tRNA, miRNAなど様々なRNA種においてもメチル化が起こり、RNAの安定性やmRNAの翻訳のような様々な過程の制御に影響を与えていることが示唆されています。



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メチル化DNA検出キットラインナップ

製品EZ DNA Methylation1、2EZ DNA Methylation-Gold3、4EZ DNA Methylation-Lightinig Kit3、5EZ DNA Methylation-Direct KitEZ DNA Methylation Startup Kit
製品説明スタンダードタイプ迅速プリメイドの変換試薬を含み便利細胞・組織を直接処理可能初めての方に
形状(溶出液量)スピンカラム(≧10μl)、96ウェル(≧15μl)、MagBead(≧25μl)スピンカラム(≧10μl)
変換効率≧99%≧99%≧99.5%≧99.5%≧99%
処理時間12~16時間3時間1.5時間4時間4時間
アプライ量500pg~2μg DNA500pg~2μg DNA100pg~2μg DNADNA(≧50pg)、細胞(≧10)、血液、パラフィン包埋組織切片(FFPE)

MagBeadのみオートクレーブ可。
Startup Kitはメチル化コントロールプライマー付き。


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メチル化DNA検出キットは以下の解析システムで使用が推奨されています

対応するキットは上記「メチル化DNA検出キットラインナップ」一覧表中の商品名末尾の番号をご参照ください。

  1. Illumina Infinium and GoldenGate assay systems
  2. Sequenom MassARRAY EpiTYPER
  3. Epicentre EpiGnome Methyl-Seq kit
  4. Agilent Technologies SureSelect Methyl-Seq Target Enrichment System
  5. Roche NimbleGen SeqCap Epi Enrichment System


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特長

  • 亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)した DNA の洗浄と脱スルホン化を同一のカラムで行えるため、試料DNA の分解や、損失を最小限に抑えられます。
  • キットには、ウラシルに変換した DNA を高純度で精製する試薬が含まれています。
  • 出発試料:プラスミドDNA、ゲノムDNA、エンドヌクレアーゼ処理DNA

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操作法概略

EZ DNA Methylation Kit シリーズ各キットの操作法概略
EZ DNA Methylation Kit シリーズ操作法概略図EZ DNA Methylation KitEZ DNA Methylation-Gold KitEZ DNA Methylation-Direct Kit

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使用例

亜硫酸水素塩処理(バイサルファイト処理)によるメチル化DNA 検出キット EZ DNA Methylation Kit

DNA sequencing results after bisulfite treatment.
DNA with methylated CmpG (at nucleotide position #5) was bisulfite treated. The recovered DNA was amplified by PCR and then sequenced directly. The methylated cytosine at position #5 remained intact while the unmethylated cytosines (i.e., positions #7, 9, 11, 14 and 15) were completely converted into uracil following bisulfite treatment and detected as thymine following PCR.

亜硫酸水素塩処理(バイサルファイト処理)によるメチル化DNA 検出キット EZ DNA Methylation Kit

A 459 bp PCR product amplified from DNA converted with the EZ DNA Methylation™ Kit (lane 1) and from DNA not treated with the kit (lane 2) was digested with EcoR I. The cytosine at the EcoR I site was converted to uracil during treatment, not resulting in cleavage of the DNA by the endonuclease.

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キット内容

  • CT conversion reagent
  • M-desulphonation buffer
  • M-dilution buffer
  • M-elution buffer
  • M-binding buffer
  • Zymo-spin IC column
  • M-wash buffer
  • Collection tube

キットに PCR 用酵素は含まれていません。


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製品掲載誌のご紹介

アオリ文 タイトル

『実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード』(羊土社)にて
Zymo Research社 EZ DNA Methylation Kitが掲載されました


  
掲載
ページ
タイトル紹介製品
37領域特異的バイサルファイト
シークエンシング
EZ DNA Methylation Kit (#D5001)
45メチル化特異的PCR法EZ DNA Methylation Kit(#D5002)
77MassARRAYを用いたメチル化解析EZ DNA Methylation Kit
119Infiniumを用いたメチル化解析EZ DNA Methylation Kit
131PBAT法によるメチローム解析EZ DNA Methylation-Gold Kit (#D5005)

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価格

[在庫・価格 :2024年04月25日 16時15分現在]

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詳細 商品名
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納期 文献数
DNA Methylation Kit, EZ (50 reactions)
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説明文
試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)することにより,メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するメチル化DNA検出キット。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年3月15日号 p.4
ニュース2020年5月1日号 p.6

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2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)することにより,メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するメチル化DNA検出キット。。
別包装品 別包装品あり
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文献数: 0

説明文 試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)することにより,メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するメチル化DNA検出キット。
別包装品 別包装品あり
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別包装品 別包装品あり
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キット別売品

[在庫・価格 :2024年04月25日 16時15分現在]

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納期 文献数
CT Conversion Reagent
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説明文 DNA/RNA精製用のシリカスピンカラム。DNA最大結合量:5μg,RNA最大結合量:10μg,溶出液量:6μL以上,カラム容量:800μl
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(テクニカルサポート 試薬担当)

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