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EZ DNA Methylation Kit
メチル化DNA検出用の亜硫酸水素塩処理（バイサルファイト処理）キット EZ DNA Methylation Kit
掲載日情報：2017/10/18 現在Webページ番号：1109
試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理（バイサルファイト処理）することにより，メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するキットです。メチル化シトシンは変換されません。本キットで処理した DNA をテンプレートにして PCR を行った後，制限酵素処理，シークエンシング，マイクロアレイなどによりメチル化DNA を検出できます。
MEMO
DNAメチル化（メチレーション）について
DNAは，DNAメチルトランスフェラーゼと呼ばれる酵素の働きによって，5’-CG-3’のシトシン基（CpG）がメチル化（メチレーション）されます。DNAのメチル化によって，遺伝子の発現や細胞の分化，発生といった様々な細胞内の働きを制御しています。また，DNAのメチル化は様々な疾患のバイオマーカーとしても注目されています。
また，DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担う5-ヒドロキシメチルシトシン（5-hmC）もまた，新しいエピジェネティックな調節を担っていると考えられています。
近年ではmRNA, tRNA, miRNAなど様々なRNA種においてもメチル化が起こり，RNAの安定性やmRNAの翻訳のような様々な過程の制御に影響を与えていることが示唆されています。
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メチル化DNA検出キットラインナップ
| 製品 | EZ DNA Methylation1，2 | EZ DNA Methylation-Gold3，4 | EZ DNA Methylation-Lightinig Kit3，5 | EZ DNA Methylation-Direct Kit | EZ DNA Methylation Startup Kit |
| 製品説明 | スタンダードタイプ | 迅速 | プリメイドの変換試薬を含み便利 | 細胞・組織を直接処理可能 | 初めての方に |
| 形状（溶出液量） | スピンカラム（≧10μl），96ウェル（≧15μl），MagBead（≧25μl） | スピンカラム（≧10μl） | |||
| 変換効率 | ≧99％ | ≧99％ | ≧99.5％ | ≧99.5％ | ≧99％ |
| 処理時間 | 12～16時間 | 3時間 | 1.5時間 | 4時間 | 4時間 |
| アプライ量 | 500pg～2μg DNA | 500pg～2μg DNA | 100pg～2μg DNA | DNA(≧50pg)，細胞(≧10)，血液，パラフィン包埋組織切片(FFPE) | |
※MagBeadのみオートクレーブ可。
※Startup Kitはメチル化コントロールプライマー付き。
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特長
- 亜硫酸水素ナトリウムで処理（バイサルファイト処理）した DNA の洗浄と脱スルホン化を同一のカラムで行えるため，試料DNA の分解や，損失を最小限に抑えられます。
- キットには，ウラシルに変換した DNA を高純度で精製する試薬が含まれています。
- 出発試料：プラスミドDNA，ゲノムDNA，エンドヌクレアーゼ処理DNA
メチル化DNA検出キットは以下の解析システムで使用が推奨されています
対応するキットは上記「メチル化DNA検出キットラインナップ」一覧表中の商品名末尾の番号をご参照ください。
- Illumina Infinium and GoldenGate assay systems
- Sequenom MassARRAY EpiTYPER
- Epicentre EpiGnome Methyl-Seq kit
- Agilent Technologies SureSelect Methyl-Seq Target Enrichment System
- Roche NimbleGen SeqCap Epi Enrichment System
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操作法概略
EZ DNA Methylation Kit シリーズ各キットの操作法概略
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使用例
DNA sequencing results after bisulfite treatment.
DNA with methylated CmpG (at nucleotide position #5) was bisulfite treated. The recovered DNA was amplified by PCR and then sequenced directly. The methylated cytosine at position #5 remained intact while the unmethylated cytosines (i.e., positions #7, 9, 11, 14 and 15) were completely converted into uracil following bisulfite treatment and detected as thymine following PCR.
A 459 bp PCR product amplified from DNA converted with the EZ DNA Methylation™ Kit (lane 1) and from DNA not treated with the kit (lane 2) was digested with EcoR I. The cytosine at the EcoR I site was converted to uracil during treatment, not resulting in cleavage of the DNA by the endonuclease.
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キット内容
- CT conversion reagent
- M-desulphonation buffer
- M-dilution buffer
- M-elution buffer
- M-binding buffer
- Zymo-spin IC column
- M-wash buffer
- Collection tube
※キットに PCR 用酵素は含まれていません。
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製品掲載誌のご紹介
 |
実験医学別冊エピジェネティクス実験スタンダード（羊土社）にて (株） 羊土社 実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード
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価格
[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
|
DNA Methylation Kit, EZ (50 reactions) |
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4 | |||
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DNA Methylation Kit, EZ (200 reactions) |
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4 | |||
[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
DNA Methylation Kit, EZ (50 reactions)
文献数：4
- 商品コード：D5001
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥26,000
- 在庫：2個
- 納期：-
- 法規制等：
| 説明文 |
試料DNA を亜硫酸水素ナトリウムで処理（バイサルファイト処理）することにより，メチル化されていないシトシンをウラシルに化学的に変換するメチル化DNA検出キット。 |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | |||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2019年4月1日号 p.4 ニュース2018年5月1日号 p.3
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関連製品
[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
|
DNA Methylation Kit, EZ-96, Shallow-Well Format (2×96reactions) |
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1 | |||
|
DNA Methylation Kit, EZ-96, Deep Well Format (2×96reactions) |
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1 | |||
[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
DNA Methylation Kit, EZ-96, Shallow-Well Format (2×96reactions)
文献数：1
- 商品コード：D5003
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥71,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※
- 法規制等：
| 説明文 |
96ウェルプレートフォーマットで非メチル化シトシンをウラシルに変換した後,変換したDNAを精製するメチル化DNA検出キット。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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キット別売品
[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CT Conversion Reagent |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Binding Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Dilution Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Desulphonation Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Desulphonation Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Elution Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Elution Buffer |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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M-Wash Buffer |
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M-Wash Buffer |
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Zymo-Spin Column IC |
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Zymo-Spin Column IC |
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2 ml Collection Tube |
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Collection Tube |
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Collection Tubes |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2020年01月25日 00時13分現在]
M-Binding Buffer
文献数：0
- 商品コード：D5001-3
- メーカー：ZYR
- 包装：20ml
- 価格：¥3,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※
- 法規制等：
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M-Dilution Buffer
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- 納期：10日程度 ※
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- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※
- 法規制等：
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- 商品コード：D5001-4
- メーカー：ZYR
- 包装：6ml
- 価格：¥2,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※
- 法規制等：
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M-Wash Buffer
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- 商品コード：D5002-4
- メーカー：ZYR
- 包装：24ml
- 価格：¥5,000
- 在庫：無(発注済)
- 納期：10日程度 ※
- 法規制等：
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Zymo-Spin Column IC
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- メーカー：ZYR
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- 在庫：無(発注済)
- 納期：ご照会下さい
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- 商品コード：C1001-1000
- メーカー：ZYR
- 包装：1000tubes
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- 在庫：3個以上
- 納期：-
- 法規制等：
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。