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1ステップで非メチル化シトシンをウラシルに変換するバイサルファイト処理キット EZ DNA Methylation-Gold Kit
掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:1110
1 ステップで亜硫酸水素塩処理(バイサルファイト処理)によってDNAの非メチル化シトシンをウラシルに変換した後、迅速かつ簡単にDNAを抽出・精製できるキットです。DNAのメチル化解析に有用です。
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DNAメチル化について
DNAは、DNAメチルトランスフェラーゼと呼ばれる酵素の働きによって、5’-CG-3’のシトシン基(CpG)がメチル化されます。DNAのメチル化によって、遺伝子の発現や細胞の分化、発生といった様々な細胞内の働きを制御しています。また、DNAのメチル化は様々な疾患のバイオマーカーとしても注目されています。
また、DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担う5-ヒドロキシメチルシトシン(5-hmC)もまた、新しいエピジェネティックな調節を担っていると考えられています。
近年ではmRNA, tRNA, miRNAなど様々なRNA種においてもメチル化が起こり、RNAの安定性やmRNAの翻訳のような様々な過程の制御に影響を与えていることが示唆されています。
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メチル化DNA検出キットラインナップ
製品 | EZ DNA Methylation1、2 | EZ DNA Methylation-Gold3、4 | EZ DNA Methylation-Lightinig Kit3、5 | EZ DNA Methylation-Direct Kit | EZ DNA Methylation Startup Kit |
---|---|---|---|---|---|
製品説明 | スタンダードタイプ | 迅速 | プリメイドの変換試薬を含み便利 | 細胞・組織を直接処理可能 | 初めての方に |
形状(溶出液量) | スピンカラム(≧10μl)、96ウェル(≧15μl)、MagBead(≧25μl) | スピンカラム(≧10μl) | |||
変換効率 | ≧99% | ≧99% | ≧99.5% | ≧99.5% | ≧99% |
処理時間 | 12~16時間 | 3時間 | 1.5時間 | 4時間 | 4時間 |
アプライ量 | 500pg~2μg DNA | 500pg~2μg DNA | 100pg~2μg DNA | DNA(≧50pg)、細胞(≧10)、血液、パラフィン包埋組織切片(FFPE) |
※MagBeadのみオートクレーブ可。
※Startup Kitはメチル化コントロールプライマー付き。
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メチル化DNA検出キットは以下の解析システムで使用が推奨されています
対応するキットは上記「メチル化DNA検出キットラインナップ」一覧表中の商品名末尾の番号をご参照ください。
- Illumina Infinium and GoldenGate assay systems
- Sequenom MassARRAY EpiTYPER
- Epicentre EpiGnome Methyl-Seq kit
- Agilent Technologies SureSelect Methyl-Seq Target Enrichment System
- Roche NimbleGen SeqCap Epi Enrichment System
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特長
- DNA を化学的変性ではなく熱により変性させることにより、DNA変性と亜硫酸水素処理(バイサルファイト処理)を 1 ステップで行えます。
- 独自の技術を用いたカラムを使用することにより、DNA の脱亜硫酸水素化工程と DNA の精製工程が同時に行えます。
- DNA の損傷、損失が最小限に抑えられています。
- 高純度の変換DNA が高い回収率で回収できます。
- 回収した変換DNA は制限酵素処理、シークエンシングやマイクロアレイ等により解析します。
- 96 ウェルフォーマットの製品もあります(#D5007)。
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操作法概略
EZ DNA Methylation Kit シリーズ各キットの操作法概略追加しました。
キット内容
- CT conversion reagent
- M-dilution buffer-Gold
- M-dissolving buffer-Gold
- M-binding buffer-Gold
- M-wash buffer
- M-desulphonation buffer
- M-elution buffer
- Zymo-spin IC column(#D5005, #D5006のみ)
- Collection tube(#D5005, #D5006のみ)
- Silicon-A binding plate(#D5007のみ)*
- Zymo-spin I-96 filtration plate(#D5008のみ)*
- Conversion plate with pierceable cover foil(#D5007, #D5008のみ)
- Collection plate(#D5007, #D5008のみ)
- Elution plate(#D5007, #D5008のみ)
* #D5007と#D5008でプレートの形状が異なります。詳細は、下記FAQのQ-5をご覧下さい。
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製品掲載誌のご紹介
『実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード』(羊土社)にて 『実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード
|
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FAQ
Q-1. 亜硫酸水素ナトリウム処理を行う試料 DNA は、どのようなバッファーに溶解すれば良いですか?
A-1. 水、TE、TE 改良バッファーに溶解すれば、変換反応時に阻害されません。
Q-2. 変換処理を行った DNA は、どのような温度条件で、どのくらいの期間保存できますか?
A-2. -20℃以下で保存して下さい。変換 DNA の品質は、最大 3 か月間は未変換 DNA と同等です。
Q-3. EZ DNA Methylation-Direct Kit での DNA 変換が不完全でした。なぜでしょうか?
A-3. 固形組織の場合、試料量が多すぎたと思われます。
- FFPE(ホルマリン固定・パラフィン包埋)試料の場合、DNA が大幅なダメージを受けていたか、架橋により DNA 変換が不完全になったと思われます。
- Protease K 処理後の遠心分離時に残渣の除去が不完全な場合、DNA 変換反応が妨げられます。
Q-4. 変換 DNA を PCR で増幅する場合、お勧めの酵素は?
A-4. ZymoTaq DNA Polymeraseなどのホットスタートタイプの酵素をお勧めします。
Q-5. EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズにはそれぞれ2 種類の製品がありますが、何が違うのですか?
A-5. キットに含まれるbinding plate の形状が違います。Shallow-Well、Deep-Well いずれも、多くの遠心分離機のローターに対応しています。
EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズのBinding plate の仕様
商品コード | #D5003, #D5007, #D5022, #D5027 | #D5004, #D5008, #D5023, #D5028 |
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Binding plate | Silicon-A binding plate | Zymo-spin I -96 binding plate |
形 状 | Shallow-Well | Deep-Well |
Binding plate の高さ | 19 mm | 35 mm |
Binding plate とCollection plate を組み合わせた時の高さ | 43 mm | 60 mm |
DNA 結合量/最小溶出量 | 5 μg / 30 μl | 5 μg / 15 μl |
Q-6. イルミナ社のテクノロジーに対応していますか?
A-6. イルミナ社の GoldenGate および Infinium アッセイに最適です。
Q-7. 変換処理を行った DNA はどのような解析法に使用できますか?
A-7. 標準的なシークエンシングの他、Ms-SNuPE(Methylation-sensitive Single-Nucleotide Primer Extension)、COBRA(Combined Bisulfite Restriction Analysis)、MSP(Methylation Sensitive PCR)や、質量分析による解析に使用できます。
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価格
[在庫・価格 :2024年05月04日 18時35分現在]
詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||
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DNA Methylation-Gold Kit, EZ (50 reactions) |
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0 | |||
DNA Methylation-Gold Kit, EZ (200 reactions) |
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0 | |||
DNA Methylation-Gold Kit, EZ-96, Shallow-Well Format (2×96reactions) |
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0 | |||
DNA Methylation-Gold Kit, EZ-96, Deep-Well Format (2×96reactions) |
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0 | |||
[在庫・価格 :2024年05月04日 18時35分現在]
DNA Methylation-Gold Kit, EZ (50 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:D5005
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥40,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 |
メチル化DNA検出キット。DNAを化学的変性ではなく熱により変性させることにより,DNA変性と亜硫酸水素処理(バイサルファイト処理)を 1 ステップで行う。 |
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別包装品 | 別包装品あり | ||||||
法規制等 | |||||||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.4 ニュース2020年5月1日号 p.6
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製品記事 | |||||||
関連記事 |
DNA Methylation-Gold Kit, EZ (200 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:D5006
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥134,000
- 在庫:2個
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 |
メチル化DNA検出キット。DNAを化学的変性ではなく熱により変性させることにより,DNA変性と亜硫酸水素処理(バイサルファイト処理)を 1 ステップで行う。 |
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別包装品 | 別包装品あり | ||||||
法規制等 | |||||||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.4 ニュース2020年5月1日号 p.6
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製品記事 | |||||||
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DNA Methylation-Gold Kit, EZ-96, Shallow-Well Format (2×96reactions)
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- 商品コード:D5007
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥105,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:取扱注意
説明文 |
メチル化DNA検出キット。DNAを化学的変性ではなく熱により変性させることにより,DNA変性と亜硫酸水素処理(バイサルファイト処理)を 1 ステップで行う。 |
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法規制等 | 取扱注意 | ||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
掲載カタログ |
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- 商品コード:D5008
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- 包装:1kit
- 価格:¥105,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:取扱注意
※キット別売品については、EZ DNA Methylation Kit の記事をご参照下さい。その他の別売品についてはお問合せ下さい。
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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。