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EZ DNA Methylation Kit
非メチル化シトシンをウラシルに変換する亜硫酸水素塩処理キット EZ DNA Methylation Kit
掲載日情報:2024/09/04 現在Webページ番号:1109
精製したDNA試料を熱変性し、次に亜硫酸水素ナトリウムで処理(バイサルファイト処理)することにより非メチル化シトシンをウラシルに化学的に変換するキットです。メチル化シトシンは変換されません。本キットで処理したDNAをテンプレートにしてPCRを行った後、制限酵素処理、シークエンシング、マイクロアレイなどによりメチル化DNAを検出することができます。
Zymo Research社では、お客様の実験内容に応じて亜硫酸水素ナトリウム塩処理キットをご選択いただけるように☞ 幅広いシリーズ製品を取りそろえています。
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- DNAメチル化について
- EZ DNA Methylation Kit(亜硫酸水素塩処理キット)シリーズ概要
- 特長
- 製品ラインナップ
- 使用例
- 解析システムにおける推奨キット
- 製品掲載誌のご紹介
- 関連情報
- FAQ
DNAメチル化について
DNAメチル化は、DNA分子に対する化学的修飾の一つです。多くは、5'-CG-3'のシトシン基(CpG配列のシトシン基)の5位の炭素にメチル基が共有結合し、5-メチルシトシン(5mC)が形成されることを指します。この反応は、DNAメチルトランスフェラーゼによって行われ、ゲノム全体においてDNAメチル化パターンを確立および維持されます。DNAメチル化は、DNA配列の変更を伴わずに遺伝子発現の調節や、細胞の分化、発生といった細胞内の働きを制御する役割をもちます。 DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担う5-ヒドロキシメチルシトシン(5-hmC)もまた、新しいエピジェネティックな調節を担っていると考えられています。近年ではmRNA、 tRNA、miRNAなどのRNA種においてもメチル化が起こり、RNAの安定性やmRNAの翻訳のようなさまざまな過程の制御に影響を与えていることが示唆されています。
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EZ DNA Methylation Kit(亜硫酸水素塩処理キット)シリーズ概要
図のEZ Methylation-Gold/-Lightning KitまたはEZ Methylation-Direct/-Startup Kitをクリックすると、それぞれの製品記事をご覧いただけます。
EZ DNA Methylation Kit(亜硫酸水素塩処理キット)シリーズ各キットの操作方法概略
それぞれのキット(EZ DNA Methylation Startup Kitを除く)は、スピンカラム、96 wellプレート(Shallow well/Deep well)、MagPrepの4つのフォーマットからご選択いただけます。詳細は下表をご参照下さい。
品名をクリックすると製品の詳細、商品コードをクリックすると各キット製品の価格表をご覧いただけます。
品名 | EZ(EZ-96 / EZ-96 MagPrep) DNA Kit | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Methylation Kit | ☞ Methylation Gold Kit |
☞ Methylation Lightning Kit |
☞ Methylation Direct Kit |
☞ Methylation Startup Kit |
||||||
製品説明 | DNAの変性と亜硫酸水素塩処理を2ステップで行うキット。 | 1ステップでDNAの変性と亜硫酸水素塩処理の両方を行う迅速性に優れたキット。 | 変換試薬がReady-to-useになり、Gold Kitよりもさらに簡便性・迅速性などが向上したキット。 | DNAの精製操作が不要で、細胞・組織から直接DNAを亜硫酸水素塩処理できるキット。 | Direct Kitにコントロール実験用のヒトのメチル化したゲノムDNA、プライマーおよびDNAポリメラーゼを加えたキット。初めて亜硫酸水素塩処理を行う方におすすめ。 | |||||
フォーマット 商品コード |
スピンカラム | D5001 / D5002 | D5005 / D5006 | D5030 / D5031 | D5020 / D5021 | D5024 | ||||
Shallow well(96) | D5003 | D5007 | D5032 | D5022 | − | |||||
Deep well(96) | D5004 | D5008 | D5033 | D5023 | ||||||
MagPrep(96) | D5040 / D5041 | D5042 / D5043 | D5046 / D5047 | D5044 / D5045 | − | |||||
適応試料 | DNA | 500 pg~2 μg | 500 pg~2 μg | 100 pg~2 μg | ≧50pg | その他 | − | 細胞(≧10 cells)、血液、パラフィン包埋組織切片(FFPE)など | ||
変換効率 | ≧99% | ≧99% | ≧99.5% | ≧99.5% | ≧99% | |||||
処理時間 | 12~16時間 | 3時間 | 1.5時間 | 4時間 | 4時間 |
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特長
- 亜硫酸水素塩処理したDNAの洗浄と脱スルホン化を同一のカラムで行えるため、試料DNAの分解や、損失を最小限に抑えられます。
- キットには、ウラシルに変換したDNAを高純度で精製する試薬が含まれています。
- 適応試料*1:プラスミドDNA、ゲノムDNA、エンドヌクレアーゼ処理DNA
*1 DNA試料は、高品質でRNAフリーのものを用いて下さい。
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製品ラインナップ
商品コードをクリックすると各キット製品の価格表、キットコンポーネント(●)をクリックすると各単品製品の価格表をご覧いただけます。
品名 | EZ DNA Methylation Kit |
EZ-96 DNA Methylation Kit | |||
---|---|---|---|---|---|
Shallow-Well | Deep-Well | MagPrep | |||
商品コード | D5001 / D5002 | D5003 | D5004 | D5040 / D5041 | |
製品外観 | 🔍 | 🔍 | 🔍 | ||
回収率 | >80% | >80% | >70% | ||
キット内容 | CT conversion reagent | ● | ● | ● | ● |
M-dilution buffer | ● | ● | ● | ● | |
M-binding buffer | ● | ● | ● | ● | |
M-wash buffer | ● | ● | ● | ● | |
M-desulphonation buffer | ● | ● | ● | ● | |
M-elution buffer | ● | ● | ● | ● | |
☞ Zymo-spin IC column | ● | − | − | − | |
Collection tube | ● | − | − | − | |
☞ EZ-Methylation Magprep bead*2 | − | − | − | ● | |
☞ Zymo-Spin I-96 binding plate | − | − | ● | − | |
☞ Silicon-A binding plate | − | ● | − | − | |
Conversion plate w/ pierceable cover film | − | ● | ● | ● | |
Collection plate | − | ● | ● | ● | |
Elution plate | − | ● | ● | ● |
*2 Magprep beadのみオートクレーブ可。
※ キットにPCR用酵素は含まれていません。別途ご用意下さい。
フォーマット別スペック比較表
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使用例
亜硫酸水素塩処理後のDNA配列結果
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解析システムにおける推奨キット
EZ DNA Methylation Kitシリーズは、以下の解析システムにおいて使用が推奨されています。
解析システム | EZ DNA Methylation Kit | EZ DNA Methylation ☞ Gold |
EZ DNA Methylation ☞ Lightining |
---|---|---|---|
Illumina Infinium and GoldenGate assay systems | ● | − | − |
Sequenom MassARRAY EpiTYPER | ● | − | − |
Epicentre EpiGnome Methyl-Seq kit | − | ● | ● |
Agilent Technologies SureSelect Methyl-Seq Target Enrichment System | − | ● | − |
Roche NimbleGen SeqCap Epi Enrichment System | − | − | ● |
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製品掲載誌のご紹介
『実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード』(羊土社)にてZymo Research社 EZ DNA Methylation Kitが掲載されました
- 牛島俊和、眞貝洋一、塩見春彦/編
- 2017年05月19日発行
- B5判 398ページ
- ISBN 978-4-7581-0199-8
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関連情報
下の各項目をクリックすると、メーカーサイトでそれぞれの詳細な解説(英語)をご覧いただけます。
- ☞ Bisulfite Beginner Guide
- ☞ Controls for DNA Methylation Assays
- ☞ Bisulfite Conversion for Illumina Methylation Assays
- ☞ Bisulfite Primer Design Tool
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FAQ
Q-4. CpG配列でのみ亜硫酸水素塩変換が起こりますか?☟
Q-5. 回収可能なDNAの最小サイズはどれくらいですか?☟
Q-7. 変換されたDNAを視覚化する方法を教えて下さい。☟
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。