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Quick-DNA/RNA Water Kit
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Quick-DNA/RNA Water Kit
大容量の水試料からPCR阻害物質を含まないDNA/RNAを精製するキット Quick-DNA/RNA Water Kit
掲載日情報：2025/04/14 現在Webページ番号：71668
最大50 mlの原廃水や最大1 Lの低生物量の水試料といった大容量の水試料から、超遠心や真空吸引を行わずに、PCR阻害物質を含まないDNA/RNAを精製するキットです。水試料中に含まれるウイルス・微生物や、それらに由来する遊離核酸の検出が行え、廃水監視や環境モニタリングに最適です。
※ 最大5 mlの下水などの環境水からウイルスなどに由来するRNAを抽出するキットについてはこちらをご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
SARS-CoV-2を添加した廃水30 mlから各社キットで核酸精製を行い、Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit（#R3013）を用いたRT-qPCRで、SARS-CoV-2のN1遺伝子を検出した。
他社キットではRT-qPCRが阻害されたが、本キットでは問題なく検出を行えた。
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2024/11/14
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH（ZYR）
特長
- 廃水、汚水、汚泥、処理水、天然水、河川水、淡水、塩水などの幅広い種類の水試料に対応し、原廃水、汚泥などの最も条件が厳しい水試料からのDNA/RNA回収も可能です。
- キットに含まれるWastewater stabilization bufferは、水試料中のウイルス・微生物・遊離核酸の濃縮を容易にし、また水試料中の病原体を不活性化し、微生物プロファイルを保ったまま室温での最大7日間の保存を可能にします。
- 関連製品としてWastewater stabilization bufferをあらかじめ充填したボトルもあります。
- キットに含まれるZymoSpin Ⅳ-IR HRC filter＊1により、PCR阻害物質を除去したDNA/RNAが得られます。
- 得られたDNA/RNAは、ddPCR、RT-qPCR、NGSなどの高感度アプリケーションを含む各種用途に使用できます。
- 試料量：最大50 mlの原廃水または最大1 Lの低生物量の水試料
- 収量：最大25 μg DNA、最大100 μg RNAを最大50 μlの高濃度溶液として溶出＊2。
＊1 OneStep PCR Inhibitor Removal Kitとして単品販売されています。
＊2 キット付属のDNaseⅠで処理することで、RNAのみの溶液を得ることも可能です。
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操作方法概略
① 試料の濃縮・前処理
大容量の水試料を濃縮する。
② 試料破砕
バイアスが生じないように微生物菌体を完全に破砕する。
③ DNA/RNAの精製
ウイルス・微生物由来および遊離のTotal DNA/RNAを精製する。
④ PCR阻害物質の除去
各種アプリケーションにそのまま使用できるようにPCR阻害物質を除去する。
※ 試料ごとの詳細な操作方法については、下記をご覧下さい。
① 試料の濃縮・前処理
■ 液体試料（原廃水、下水、天然水、処理水）の場合
- 50 mlコニカルチューブに最大45 mlの試料を加える。
※ 遠心ボトルと対応したローターの遠心分離機がある場合は、より大容量の試料を処理できる。 - Wastewater stabilization bufferを1/10量（45 mlの試料の場合4.5 ml）加え、ボルテックスで撹拌後、室温で10分間インキュベートする。
- 10,000×gで20分間遠心する。
- 上清を捨て、ペレットを750 μlのDNA/RNA Shieldに懸濁させた後、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に加える。
■ Wastewater Sample Collection Bottle（別売品）で採取した試料の場合
- 50 mlコニカルチューブに最大50 mlの試料を加える。
※ 遠心ボトルと対応したローターの遠心分離機がある場合は、より大容量の試料を処理できる。 - 10,000×gで20分間遠心する。
- 上清を捨て、ペレットを750 μlのDNA/RNA Shieldに懸濁させた後、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に加える。
■ 水試料を処理したフィルターの場合
- フィルターを細断し、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に入れ、さらに750 μlのDNA/RNA Shieldを加える。
■ 廃水固形物および汚泥の場合
- ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に最大250 mgの試料を加え、さらに750 μlのDNA/RNA Shieldを加える。
■ 限界ろ過フィルターなどで濃縮した水試料の場合
- 濃縮処理についてはそれぞれの製品の指示に従う。
- DNase/RNase-freeの新しいチューブに試料を移し、終量が1 mlになるようにDNA/RNA Shieldを加えた後、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に移す。
■ Nanotrap Particle（Ceres Nanosciences社）で濃縮した水試料の場合
- 濃縮処理については製品の指示に従う。
- DNase/RNase-freeの新しいチューブにNanotrap Particleが入らないように試料を移し、終量が1 mlになるようにDNA/RNA Shieldを加えた後、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）に移す。
② 試料破砕
- VortexミキサーまたはFastPrep-5G装置などを用いて、ZR BashingBead lysis tube（0.1 & 0.5 mm）中の試料を破砕する。
- 遠心分離後、DNase/RNase-freeの新しいチューブに上清を移す。
③ DNA/RNAの精製
- 得られた上清にViral DNA/RNA bufferを加える。
- Zymo-SpinⅢCG columnへの試料のアプライ・洗浄・溶出、新しいZymo-SpinⅢCG columnへの試料のアプライ・洗浄・溶出を順次行う。
※ 【オプション】RNAのみを得たい場合は、2つめのZymo-SpinⅢCG columnにDNaseⅠをアプライして、カラム上でDNA分解を行う。
④ PCR阻害物質の除去
- ZymoSpin Ⅳ-IR HRC filterに試料をアプライして、遠心する。
- 得られた核酸溶液は下流のアプリケーションに使用できる。
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使用例
廃水からの病原体検出例
7.5 mlの流入廃水から、各社キットを用いて核酸を精製した（n=3）。
左）デジタルPCRによるSARS-CoV-2 RNA検出
PREvalence ddPCR SARS-CoV-2 Wastewater Quantification Kit（Bio-Rad社）を用いて、SARS-CoV-2のN2遺伝子をデジタルPCRで検出した。
右）qPCRによる細菌DNAの定量
Femto Bacterial DNA Quantification Kit（#E2006）を用いて、バクテリア由来DNAの回収量をqPCRで評価した。
ウイルス、バクテリア、真菌類由来核酸の高感度かつ直線的な回収
熱不活性化したSARS-CoV-2、Candida auris、Mycobacterium tuberculosisをさまざまな濃度で添加した流入廃水10 mlから本キットで核酸精製を行った。
左）RT-qPCRによるウイルス回収量の評価
Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit（#R3013）を用いたRT-qPCRで、SARS-CoV-2のウイルス回収量を定量し、結果をPCR反応あたりのゲノムコピー数で示した。
右）qPCRによる真菌類とバクテリアの検出
C. auris（真菌類）およびM. tuberculosis（細菌）それぞれに対する標的特異的プライマーを用いたqPCRにより回収量を定量し、結果をPCR反応あたりのコロニー形成単位（CFU）として表示した。
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アプリケーションノート
画像をクリックするとPDFファイルをご覧いただけます。
廃水および一次汚泥試料から本キットで核酸精製を行った後、Onso（PacBio社）およびNextSeq 2000（Illumina社）を用いてメタゲノム解析を行った（PDF、英文4ページ）。
生廃水試料をCeres Nanosciences社のNanotrap Microbiome ParticleまたはNanotrap Enhancement Reagentで濃縮処理を行った後、本キットで核酸精製を行い、病原性ウイルスやバクテリアの検出を行った（PDF、英文3ページ）。
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キット内容
各キットコンポーネント名をクリックすると、単品の価格表をご覧いただけます。
別途必要な装置・器具などについては製品マニュアルをご確認下さい。
- DNA/RNA shield
- Wastewater stabilization buffer
- Viral DNA/RNA buffer
- DNA/RNA binding buffer
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価格
[在庫・価格 ：2025年04月25日 20時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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納期 | 文献数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Quick-DNA/RNA Water Kit |
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2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 20時55分現在]
Quick-DNA/RNA Water Kit
文献数： 0
- 商品コード：R2044
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥102,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 | 最大50mlの原廃水や最大1Lの低生物量の水試料といった大容量の水試料から、超遠心や真空吸引を行わずに、PCR阻害物質を含まないDNA/RNAを精製するキット。水試料中に含まれるウイルス・微生物や、それらに由来する遊離核酸の検出が行え、廃水監視や環境モニタリングに最適。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | |||
| 関連記事 | |||
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関連製品：Wastewater Sample Collection Bottle
Quick-DNA/RNA Water Kitで用いているWastewater stabilization bufferをあらかじめ充填したHDPE（高密度ポリエチレン）製の250 mlサイズのボトルで、水試料を200 mlまで入れることができます。水試料中の病原体を不活性化し、微生物プロファイルを保ったまま室温での最大7日間の保存を可能にするため、試料の低温輸送が不要となります。
[在庫・価格 ：2025年04月25日 20時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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納期 | 文献数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Wastewater Sample Collection Bottle |
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2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Wastewater Sample Collection Bottle |
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2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 20時55分現在]
Wastewater Sample Collection Bottle
文献数： 0
- 商品コード：R1503
- メーカー：ZYR
- 包装：1bottle
- 価格：¥5,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 高密度ポリエチレン製の250mlサイズのボトルで、水試料を200mlまで入れることができる。水試料中の病原体を不活性化し、微生物プロファイルを保ったまま室温での最大7日間の保存を可能にするため、試料の低温輸送が不要となる。Quick-DNA/RNA Water Kitの関連製品。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 法規備考 | ||
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | |||
| 関連記事 | |||
Wastewater Sample Collection Bottle
文献数： 0
- 商品コード：R1503-8
- メーカー：ZYR
- 包装：8bottles
- 価格：¥35,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 高密度ポリエチレン製の250mlサイズのボトルで、水試料を200mlまで入れることができる。水試料中の病原体を不活性化し、微生物プロファイルを保ったまま室温での最大7日間の保存を可能にするため、試料の低温輸送が不要となる。Quick-DNA/RNA Water Kitの関連製品。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 法規備考 | ||
| 掲載カタログ |
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。