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変異株にも対応!新型コロナウイルスの定量的RT-PCR検出キット Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit

掲載日情報:2021/12/02 現在Webページ番号:69915

新型コロナウイルス(SARS-CoV-2, COVID-19)のヌクレオカプシド(Nucleocapsid, N)遺伝子と、試料の品質を評価するためのヒトRNase P遺伝子(内部標準)を定量する定量的RT-PCR用マスターミックスです。キットには、試験の成否やコンタミネーションを判定するために、ポジティブコントロールとテンプレートなしのコントロールも含まれています。
また、別売りのSARS-CoV-2 Quantification Standards(#R3016)と組み合わせて測定を行うことにより、8~5,000 GEC/μlという幅広い濃度範囲で、濃度が未知のSARS-CoV-2のRNA試料の定量が行えます。

本製品は、SARS-CoV-2のヌクレオカプシド(Nucleocapsid, N)遺伝子を標的としており、スパイクタンパク質遺伝子と異なり突然変異が起こりにくいため、検出において既知および新規のSARS-CoV-2変異株に生じた変異の影響を受けることがありません。

本製品は研究用です。研究用以外に使用できません。
その他の新型コロナウイルス関連製品については、「コロナウイルス(SARS-CoV)研究用抗体/タンパク質製品特集」をご覧下さい。

感度

性能

  • PPA: 30/30=100%(95% CI: 88.7~100%)
  • NPA: 30/30=100%(95% CI: 88.7~100%)
  • 100%正確な検出を行えるウイルス量の範囲:10 GEC/reaction以上

略号説明

  • PPA:Positive Percent Agreement(陽性一致率)
  • NPA:Negative Percent Agreement(陰性一致率)
  • GEC:Genomic Equivalent Copies(遺伝子相当量)

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他社製品との比較

項目 Quick SARS-CoV-2 Multiplex
ZymoResearch社
A社 B社 C社 D社 E社 F社
検出限界(LOD、GEC/ml) 167 180,000 4,167 1,800 600 3,000 2,700
宿主由来の内部標準を含む
(試料校正およびRNA抽出の確認用)
Ready-to-useなRT-qPCR Mix
低温輸送不要
全コンポーネントが自社製品
(試料採取から結果まで)

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特長

  • アッセイを評価するためのCV positive controlと、試薬がコンタミネーションしていないことを確認するNo-template control(Nuclease-free water)が含まれています。
  • わずか10 GEC/reaction(167 GEC/ml)でも検出できます。
  • 操作の自動化・ハイスループットに対応できます。
  • RNA試料から3時間以内に分析が完了します。
  • 試料:スワブ、喀痰、気道液などの試料から抽出したRNA
  • 測定波長:励起 535 nm/蛍光 556 nm(N遺伝子)、励起 647 nm/蛍光 670 nm(RNase P遺伝子)

本製品にRNA抽出試薬は含まれていません。お勧めRNA抽出キットについてはこちらをご覧下さい。


適応機器

HEX(またはVIC)、およびQuasar 670(またはCy5)のチャンネルを有するリアルタイムPCR装置(CFX96/384 Touch:Bio-Rad社、または同等品)

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原理・操作方法概略

最初に、RNA抽出キット(本キットには含まれていません)などを用いて、スワブ、喀痰、気道液などの試料からRNAを抽出します。試料中の標的核酸の選択的増幅は、SARS-CoV-2のRNA、および宿主特異的RNase P RNAの逆転写と、その後の標的特異的なフォワード/リバースプライマーを用いたPCR増幅によって行います。

本製品は、SARS-CoV-2特異的配列としてヌクレオカプシド遺伝子(N)を、宿主(ヒト)特異的配列としてRNase P遺伝子を検出します。rRT-PCRアッセイで使用されるプライマーとプローブは、CDC(米国疾病予防管理センター)が公開しているプライマーとプローブの配列に変更を加えたものに基づいています。本製品は、コントロールとして、RNase P遺伝子の検出に加えて、RNAは、抽出を含むすべての操作の検証用にテンプレートなしのコントロールと、試薬の完全性と操作の正確さの検証用にポジティブコントロールを使用します。

別売りのSARS-CoV-2 Quantification Standards(#R3016)と組み合わせて測定を行うことにより、8~5,000 GEC/μlという幅広い濃度範囲で、SARS-CoV-2の定量を行えます。

Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kitの操作方法概略

Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kitの操作方法概略

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測定結果の解釈

試料 SARS-CoV-2(N) 内部標準(RNase P) 結果
No-template control 増幅なし 増幅なし 有効
CV positive control Ct≦40 Ct≦30 有効
測定試料 Ct≦40 増幅あり 陽性
増幅なし、またはCt>40 Ct<40 陰性
増幅なし 増幅なし、またはCt≧40 無効

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使用例

正常な増幅曲線

#SARS-CoV-2増幅曲線(正常)

A~E:SARS-CoV-2(N遺伝子)
F:CV positive control
G:No-template control

#RNase P増幅曲線(正常)

茶色:内部標準(RNase P遺伝子)
A:CV positive control
B:No-template control

異常な増幅曲線(SARS-CoV-2)

#SARS-CoV-2増幅曲線(異常1)

A~Cはシグナルが弱い(Ct>40)ため、陽性とはみなせない。

#SARS-CoV-2増幅曲線(異常2)

Aは増幅が異常であり、BCはシグナルが弱いか異常な増幅であること示している。

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キット内容

コンポーネント名 説明
2× CV mix SARS-CoV-2のN遺伝子(HEX/VICチャンネル)と、ヒトRNase P遺伝子(Quasar 670/Cy5チャンネル)の特異的増幅・検出が行える。RNase Pの検出は、試料採取時および核酸抽出時の品質管理に有効となる。
CV positive control 陽性だがウイルスのコピー数が少ない試料をシミュレーションしたもので、2.5 GEC/μlのSARS-CoV-2RNAフラグメント(25 GEC/reaction)と1 ng/μlのヒトRNA(10 ng/reaction)を含む。RT-PCRプレートに直接追加して用いることで、キットのすべてのコンポーネントが正しく機能していることを確認できる。
No-template control(NTC) Nuclease-free water。試料と並行してRNA抽出を行い、RNA抽出時およびRT-PCR試薬の潜在的な汚染を特定できる。

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関連製品:SARS-CoV-2 Quantification Standards

SARS-CoV-2のヌクレオカプシド(Nucleocapsid, N)遺伝子のRNAスタンダードです。Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kitと組み合わせて用いることで、濃度が未知のSARS-CoV-2のRNA試料の定量が行えます。

SARS-CoV-2 Quantification Standardsの特長

  • あらかじめ5段階の濃度に調製されており、氷上で融解後、希釈せずにそのまま使用できます。
  • -80℃で適切に保管し、過度の融解・再凍結の繰り返しを行わない場合、3ケ月間に渡り濃度低下が起こらないことを確認済みです。
  • RNAスタンダードにはHeLa由来のRNase P遺伝子RNAが添加されており、融解時の濃度変動を最小限に抑えます。
  • 8~5,000 GEC/μl(80~50,000 copies/reactions)という幅広い濃度範囲で、SARS-CoV-2の定量を行えます。
  • RT-qPCRデータの解析、標準曲線の作成、試料濃度の算出を容易に行えます。
  • 異なるPCRプレート間でのデータの相互比較が可能となります。
  • 試薬汚染の検出用にNo template controlが付属しています。

融解・再凍結の繰り返しは3回までとして下さい。小分け分注することをお勧めします。
本製品は、Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit(#R3013)、CFX96 Touch Real-Time PCR Detection SystemおよびCFX Maestro Software(いずれもBio-Rad社)での使用について検証されています。しかしながら、SARS-CoV-2のN遺伝子を標的とするRT-PCRマスターミックスおよび定量的RT-PCR装置について、いずれのものでも使用可能です。

SARS-CoV-2 Quantification Standardsの使用例

RNA濃度とCt値の高い相関性

RNA濃度とCt値の高い相関性

SARS-CoV-2 Quantification Standards Kit(#R3016)に含まれる5つのスタンダードについて、Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit(#R3013)を用いて検量線を作成した。
それぞれのスタンダードについて、複数のウェルにピペッティングして測定した。
RNA濃度とCt値に高い相関性があることが示された。

RNAスタンダードの高い安定性

RNAスタンダードの高い安定性

-80℃で適切に保管し、過度の融解・再凍結の繰り返しを行わない場合、3ケ月間に渡り濃度低下が起こらないことが示された。


増幅曲線の例

増幅曲線の例

SARS-CoV-2 Quantification Standards Kit(#R3016)に含まれる5つのスタンダードについて、Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit(#R3013)を用いて増幅した。


SARS-CoV-2 Quantification Standardsのキット内容

  • SARS-CoV-2 RNA standard 1~5
  • No template control(NTC)

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関連製品:お勧めRNA採取/抽出キット

(クリックで開閉します)

品名をクリックすると製品の詳細、商品コードをクリックすると各製品の価格表をご覧いただけます。

品名 フォーマット 商品コード サイズ 適用
DNA/RNA Shield Collection Tube w/ Swab Tube(1 ml) R1106 10 pack 様々な試料中の核酸を室温下で長期間保持できるDNA/RNA Shieldが、あらかじめ充填されたチューブです。こちらに記載のスワブや唾液採取器具が付属した製品の他にも各種試料に適応したチューブがあります。
R1107 50 pack
Tube(2 ml) R1108 10 pack
R1109 50 pack
DNA/RNA Shield Saliva Collection Kit 1×2 ml R1210 1 kit
Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 磁気ビーズ R2140 1×96 preps 上記のDNA/RNA Shield中に保存した様々な生体試料から高品質なウイルス核酸(DNAとRNA)を磁気ビーズを用いて抽出・精製を行うキットです。
R2141 4×96 preps
Quick RNA Viral 96 Kit R1040 2×96 preps DNA/RNA Shield中に保存した様々な生体試料から高品質なウイルスRNAを磁気ビーズを用いて抽出・精製を行うキットです。
R1041 4×96 preps

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FAQ

Quick SARS-CoV-2 Multiplex KitのFAQ(クリックで展開します)

Q-1. 本製品は、SARS-CoV-2以外の病原体の検出に使用できますか?

A-1. 本製品は、SARS-CoV-2を特異的に検出し、他のウイルスや病原体の検出には使用できません。


Q-2. 結果の解釈を行うことができません。

A-2. プロトコル中の結果の解釈、アペンディックス、およびトラブルシューティングガイドのセクションを参照して下さい。


Q-3. 増幅曲線が変に見えます。

A-3. 異常なqPCRシグナルが観察された場合は、本製品のプロトコル中の結果の解釈、アペンディックス、およびトラブルシューティングガイドのセクションを参照して下さい。


Q-4. No-template controlが増幅シグナルを示します。どうすべきですか?

A-4. その場合、プレートのセットアップが正しくないか、No-templete controlまたは2×CV mixがコンタミネーションを示している可能性があります。試験をやり直すことをお勧めします。問題が解決しない場合は、試薬をあらかじめ小分けした別のチューブに変更して下さい。


Q-5. CV positive controlが増幅しません。どうすべきですか?

A-5. Bio-Rad社のCFX96 Touch以外のRT-PCR機器を使用している場合、RT-PCRパラメーター(ベースラインいき値、温度ランプなど)を調整することで解決できます。また、プレート設定が正しくない可能性もあります。


Q-6. RNase P human target(Quasar 670チャンネル) が、40サイクル後に増幅される場合や、まったく増幅されない場合には、結果をどう解釈したら良いですか?

A-6. 宿主標的が増幅しないか、40以上のCt値を示した場合、RNA抽出やRT-PCR反応が正しく実行されていない可能性があります。RNA抽出とRT-PCR反応をやり直すことをお勧めします。


Q-7. SARS-CoV-2ウイルス標的(HEXチャンネル)のシグナルが、35~45サイクルの間に遅れて検出されました。この結果は有効ですか?結果をどう解釈すべきですか?

A-7. SARS-CoV-2ウイルス標的のシグナルが遅れて現れることは、試料中のウイルス量が少ないことを示している可能性があります。確認のために、RT-PCRをやり直すことをお勧めします。


Q-8. 本製品は、FDA EUA(米国食品医薬品局の緊急使用許可)またはCE-IVDを取得した分子検査キットと比較して性能はどうですか?

A-8. 本製品は、検出限界(LOD)が10 GEC/reactionと低いために、発売されているほとんどのSARS-CoV-2分子検査キットよりも優れています。さらに、宿主標的(ヒトRNase P)を検出することにより、他のキットで陰性と分類される可能性のある不十分な試料の識別も可能になります。このため、偽陰性の結果が生じる可能性をさらに低減できます。




SARS-CoV-2 Quantification StandardsのFAQ(クリックで展開します)

Q-9. PCRマスターミックスは自分で用意する必要がありますか?

A-9. はい、必要です。本製品にはマスターミックスは付属しておらず、Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit(#R3013)のマスターミックス(2×CV Mix)での使用について検証されています。


Q-10. 凍結融解は何回まで可能ですか?

A-10. 本製品は3回までの凍結融解を保証しています。凍結融解の回数を最小限にするために、製品を受け取った際に小分けしておくことをお勧めします。


Q-11. 特定のサーマルサイクラーを使用する必要がありますでしょうか?

A-11. 本製品は、Bio-Rad社のCFX96 Touch Real-Time PCR Detection Systemでの使用が検証されています。


Q-12. 使用前のスタンダードは冷やしておいた方がいいですか?

A-12. はい、本製品は-80℃で保存して下さい。使用時には解凍して氷上に置いて下さい。


Q-13. 試料が高濃度のために標準曲線から外れている場合はどうすればよいですか?

A-13. 正確な定量を行うために、RNAテンプレート試料を必要に応じて希釈し、キットの測定範囲である8 copies/μl~5,000 copies/μlに収まるようにして下さい。



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価格

[在庫・価格 :2024年03月29日 19時15分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
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納期 文献数
Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit (100 rxns)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2022年2月15日号 p.25

製品記事 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2/COVID-19)特集
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Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit (100 rxns)

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SARS-CoV-2 Quantification Standards

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SARS-CoV-2 Quantification Standards Kit
中止
本製品は取扱中止になりました 0
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SARS-CoV-2 Quantification Standards Kit

文献数: 0

  • 商品コード:R3016
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 本製品は取扱中止になりました

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。