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DNAメチル化解析用RRBSライブラリーを再現性高く調製するキット Zymo-Seq RRBS Library Kit

掲載日情報:2020/02/28 現在Webページ番号:68150

ゲノムDNAからRRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)ライブラリーを調製するキットです。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について,単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適しています。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


メチル化度合いをバイアス無しに検出

メチル化率によるバイアス無く検出可能
既知の様々なメチル化率(表の横軸)のヒトおよびマウスのゲノムDNA 100 ngから,本キットを用いてライブラリーを調製し,NGS解析を行った(表の縦軸)。
すべての試料において,実際のメチル化率と極めて近い,バイアスの無い結果が得られたことが分かる。

CpG領域を高い割合かつ高い再現性でカバー

CpG領域を高い割合かつ高い再現性でカバー
10 ngおよび100 ngのヒトゲノムDNAから本キットを用いてライブラリーを調製し,NGS解析を行ったところ,360万以上のCpG領域を5×以上の読み込み深度でシークエンシングできた(メチル化率の相関係数:r=0.97)。これらの領域は,CpGアイランド,プロモーター,遺伝子本体など,ヒトゲノムの機能領域の大部分をカバーしている。


RRBSとその問題点について

RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)は,重要な遺伝子発現調節因子が含まれ,DNAメチル化が主として起きるゲノム中のCpG領域のみを対象としたライブラリーを調製し,DNAメチル化を解析する手法です。全ゲノムを対象とする手法と比べ,ライブラリー調製時のコストを削減し,またDNAメチル化に関する豊富な情報が得られるという利点がありますが,以下のような問題点もあります。本キットはこれらの問題点を解決しています。

RRBSの問題点 本キットでの解決法
CCGGを認識するMspⅠを使用してシトシン間を切断するため,2番目のCのメチル化に対する感受性がない。また,ゲノムスケールでの消化で生じた断片すべての複製物は得られないため,カバーできるCpG領域の再現性が低くなる。 CpG領域を高い割合,かつ高い再現性でカバーできる。
MspⅠ消化後に40~220 bpの断片を濃縮し,さらにCpGアイランドやその他のCpGジヌクレオチドリッチ領域を濃縮するためのサイズ選択ステップが必要となる。 MspⅠ消化後にサイズ選択を行わないため,短い断片も反映されたライブラリーが調製できる。バイオインフォマティクス解析により,CpG領域を高い割合でカバーすることができる。
Bisulfite変換時に,試料のメチル化率によるバイアス無しにシグナルを得る必要がある。 試料のメチル化率に関わらず,バイアス無しにBisulfite変換を行える。
バイオインフォマティクス解析を行う場合に,特別な処理が必要。 製品マニュアルに解析時の情報が記されている。

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特長

  • ≧10 ngのわずかなゲノムDNAから解析可能です。
  • 12試料の場合わずか2時間の操作時間で,簡単にRRBSライブラリーを調製できます。
  • CpG領域を再現性高くカバーし,メチル化率によるバイアスが無く検出できます。
  • MspⅠ消化後にサイズ選択を行わないため,短い断片も反映されたライブラリーが調製でき,CpG領域を高い割合でカバーします。

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操作方法概略

操作方法概略

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キット内容

各キットコンポーネント名をクリックすると,単品の価格表をご覧いただけます。

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価格

[在庫・価格 :2020年04月06日 23時14分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Zymo-Seq RRBS Library Kit (24 preps)
10日程度  0
説明文
ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について,単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。
法規制等
保存条件 室温,-20℃ 法規備考
掲載カタログ

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説明文
ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について,単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

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[在庫・価格 :2020年04月06日 23時14分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

Zymo-Seq RRBS Library Kit (24 preps)

文献数:0

  • 商品コード:D5460
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥234,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について,単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。
法規制等
保存条件 室温,-20℃ 法規備考
掲載カタログ

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Zymo-Seq RRBS Library Kit (48 preps)

文献数:0

  • 商品コード:D5461
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥439,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について,単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

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[在庫・価格 :2020年04月06日 23時14分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.)
- 0
説明文
メチル化DNA検出キット。小包装のサンプルあり。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2019年4月1日号 p.4
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説明文
メチル化DNA検出キット。
別包装品 別包装品あり
法規制等
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説明文
PCRや制限酵素処理を行った試料や,ミニプレップで調製した粗精製DNA等から簡単に目的DNAを抽出・精製できるキット。精製したDNAは,シークエンシングや標識プローブの作製など様々な用途に使用できる。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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[在庫・価格 :2020年04月06日 23時14分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.)

文献数:0

  • 商品コード:D5030
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥36,000
  • 在庫:3個以上
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 メチル化DNA検出キット。小包装のサンプルあり。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (200 rxns.)

文献数:0

  • 商品コード:D5031
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥102,000
  • 在庫:1個
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 メチル化DNA検出キット。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2019年4月1日号 p.4
ニュース2018年5月1日号 p.3

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DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (50preps)

文献数:0

  • 商品コード:D4013
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥13,000
  • 在庫:1個
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 PCRや制限酵素処理を行った試料や,ミニプレップで調製した粗精製DNA等から簡単に目的DNAを抽出・精製できるキット。精製したDNAは,シークエンシングや標識プローブの作製など様々な用途に使用できる。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2019年2月1日号 p.13

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DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (200preps)

文献数:0

  • 商品コード:D4014
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥47,000
  • 在庫:3個以上
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 PCRや制限酵素処理を行った試料や,ミニプレップで調製した粗精製DNA等から簡単に目的DNAを抽出・精製できるキット。精製したDNAは,シークエンシングや標識プローブの作製など様々な用途に使用できる。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2019年2月1日号 p.13

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。