HOME>
試薬>
遺伝子工学>
PCR・シークエンシング>
シークエンシング>
Zymo-Seq RRBS Library Kit
HOME>
試薬>
細胞情報伝達>
エピジェネティクス>
DNAメチル化>
Zymo-Seq RRBS Library Kit
HOME>
試薬>
遺伝子工学>
エピジェネティクス>
DNAメチル化>
Zymo-Seq RRBS Library Kit
DNAメチル化解析用RRBSライブラリーを再現性高く調製するキット Zymo-Seq RRBS Library Kit
掲載日情報：2020/02/28 現在Webページ番号：68150
ゲノムDNAからRRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing）ライブラリーを調製するキットです。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について、単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適しています。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
追加しました。
-
2024/02/29
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH（ZYR）
RRBSとその問題点について
RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing）は、重要な遺伝子発現調節因子が含まれ、DNAメチル化が主として起きるゲノム中のCpG領域のみを対象としたライブラリーを調製し、DNAメチル化を解析する手法です。全ゲノムを対象とする手法と比べ、ライブラリー調製時のコストを削減し、またDNAメチル化に関する豊富な情報が得られるという利点がありますが、以下のような問題点もあります。本キットはこれらの問題点を解決しています。
| RRBSの問題点 | 本キットでの解決法 |
|---|---|
| CCGGを認識するMspⅠを使用してシトシン間を切断するため、2番目のCのメチル化に対する感受性がない。また、ゲノムスケールでの消化で生じた断片すべての複製物は得られないため、カバーできるCpG領域の再現性が低くなる。 | CpG領域を高い割合、かつ高い再現性でカバーできる。 |
| MspⅠ消化後に40～220 bpの断片を濃縮し、さらにCpGアイランドやその他のCpGジヌクレオチドリッチ領域を濃縮するためのサイズ選択ステップが必要となる。 | MspⅠ消化後にサイズ選択を行わないため、短い断片も反映されたライブラリーが調製できる。バイオインフォマティクス解析により、CpG領域を高い割合でカバーすることができる。 |
| Bisulfite変換時に、試料のメチル化率によるバイアス無しにシグナルを得る必要がある。 | 試料のメチル化率に関わらず、バイアス無しにBisulfite変換を行える。 |
| バイオインフォマティクス解析を行う場合に、特別な処理が必要。 | 製品マニュアルに解析時の情報が記されている。 |
追加しました。
特長
- ≧10 ngのわずかなゲノムDNAから解析可能です。
- 12試料の場合わずか2時間の操作時間で、簡単にRRBSライブラリーを調製できます。
- CpG領域を再現性高くカバーし、メチル化率によるバイアスが無く検出できます。
- MspⅠ消化後にサイズ選択を行わないため、短い断片も反映されたライブラリーが調製でき、CpG領域を高い割合でカバーします。
追加しました。
操作方法概略
追加しました。
Zymo Research社のDNAメチル化解析用ライブラリー調製キットの一覧
製品名をクリックすると各製品の詳細を、商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。
| 製品名 （商品コード） |
Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit （#D5462 / #D5463） |
Zymo-Seq WGBS Library Kit （#D5465） |
Pico Methyl-Seq Library Prep Kit （#D5455 / #D5456） |
Zymo-Seq RRBS Library Kit （#D5460 / #D5461） |
|---|---|---|---|---|
| カバーされる領域 | ゲノム全体 | ゲノム全体 | ゲノム全体 | ゲノム中のCpG領域 |
| 試料DNAの 必要量 |
5～10 ng | 10～100 ng | 10 pg～100 ng | 10～500 ng |
| 試料DNAの品質 | cfDNAなど小さくて損傷したDNA | 損傷のないDNA （＞10 kb） |
損傷のないDNA、FFPE試料から抽出したDNA、cfDNA、分解されたDNA | 損傷のないDNAが望ましい ※ FFPE試料から抽出したDNA、およびcfDNAに適合することを確認済み |
| 対応生物種 | 全生物種 | 全生物種 | 全生物種 | 哺乳動物（ヒト、マウス、ラットなど） ※ 他の生物種については、事前にゲノムのカバー率の評価が必要 |
| 推奨するリード数 （ヒトゲノムの場合） |
5億リード | 6億リード | 6億リード | 4千万リード |
| 特長 | cfDNAの断片末端のメチル化状態を正確に保持 | 簡便な操作で、わずか4時間で調製可能 | 少量のDNA試料や劣化したDNA試料にも適用可能 | CpG領域を高い割合、かつ高い再現性でカバーできる |
追加しました。
関連した特集記事
追加しました。
キット内容
各キットコンポーネント名をクリックすると、単品の価格表をご覧いただけます。
- MspⅠ
- RRBS buffer
- rATP
- RRBS adapter
- T4 DNA ligase
- 5-Methylcytosine dNTP mix
- Taq DNA polymerase
- LibraryAmp master mix
- Zymo-Seq UDI primer set （Index 1～12）
- E. coli non-methylated genomic DNA
- Lightning conversion reagent
- M-binding buffer
- M-wash buffer
- L-desulphonation buffer
- DNA elution buffer
- Zymo-SpinⅠC column
- Collection tube
- DNA binding buffer
- DNA wash buffer
- DNase / RNase-free water
追加しました。
価格
[在庫・価格 ：2024年04月26日 00時00分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Zymo-Seq RRBS Library Kit (24 preps) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Zymo-Seq RRBS Library Kit (48 preps) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
[在庫・価格 ：2024年04月26日 00時00分現在]
Zymo-Seq RRBS Library Kit (24 preps)
文献数： 0
- 商品コード：D5460
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥270,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について，単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。 |
||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温,-20℃,-80℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2023年1月合併号 p.23
|
||
| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
||
| 関連記事 | |||
Zymo-Seq RRBS Library Kit (48 preps)
文献数： 0
- 商品コード：D5461
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥506,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
ゲノムDNAからRRBSライブラリーを調製するためのキット。重要な遺伝子発現調節因子が含まれるゲノム中のCpG領域について，単一塩基レベルの解像度でのDNAメチル化プロファイリングに適している。 |
||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温,-20℃,-80℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2023年1月合併号 p.23
|
||
| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
||
| 関連記事 | |||
■ 関連製品
[在庫・価格 ：2024年04月26日 00時00分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (200 rxns.) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (50preps) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (200preps) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Zymo-Seq UDI Primer Set (Indexes 1-12) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Zymo-Seq UDI Primer Plate (Indexes 1-96) |
|
0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
[在庫・価格 ：2024年04月26日 00時00分現在]
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.)
文献数： 0
- 商品コード：D5030
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥53,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
メチル化DNA検出キット。小包装のサンプルあり。 |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | 取扱注意 | ||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.4 ニュース2020年5月1日号 p.6
|
||||||
| 製品記事 |
EZ DNA Methylation-Lightning Kit Zymo-Seq WGBS Library Kit Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit |
||||||
| 関連記事 |
[ZYR]核酸精製・DNAメチル化検出キット・核酸保存試薬 お試しサンプル品 |
||||||
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (200 rxns.)
文献数： 0
- 商品コード：D5031
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥148,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
メチル化DNA検出キット。 |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | 取扱注意 | ||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.4 ニュース2020年5月1日号 p.6
|
||||||
| 製品記事 |
EZ DNA Methylation-Lightning Kit Zymo-Seq WGBS Library Kit Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit |
||||||
| 関連記事 |
[ZYR]核酸精製・DNAメチル化検出キット・核酸保存試薬 お試しサンプル品 |
||||||
DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (50preps)
文献数： 0
- 商品コード：D4013
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥20,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
PCRや制限酵素処理を行った試料や,ミニプレップで調製した粗精製DNA等から簡単に目的DNAを抽出・精製できるキット。精製したDNAは,シークエンシングや標識プローブの作製など様々な用途に使用できる。 |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | |||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2023年4月1日号 p.7 ニュース2022年1月合併号 p.3
|
||||||
| 製品記事 |
DNA Clean & Concentrator Kit (DCC) |
||||||
| 関連記事 | |||||||
DNA Clean & Concentrator Kit-5, with Capped Column (200preps)
文献数： 0
- 商品コード：D4014
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥73,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
PCRや制限酵素処理を行った試料や,ミニプレップで調製した粗精製DNA等から簡単に目的DNAを抽出・精製できるキット。精製したDNAは,シークエンシングや標識プローブの作製など様々な用途に使用できる。 |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | |||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2023年4月1日号 p.7 ニュース2020年1月合併号 p.11
|
||||||
| 製品記事 |
DNA Clean & Concentrator Kit (DCC) |
||||||
| 関連記事 | |||||||
Zymo-Seq UDI Primer Set (Indexes 1-12)
文献数： 0
- 商品コード：D3008
- メーカー：ZYR
- 包装：1set
- 価格：¥44,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。 |
||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 法規備考 | ||
| 掲載カタログ |
|
||
| 製品記事 |
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit |
||
| 関連記事 | |||
Zymo-Seq UDI Primer Plate (Indexes 1-96)
文献数： 0
- 商品コード：D3096
- メーカー：ZYR
- 包装：1plate
- 価格：¥111,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。 |
||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -80℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
|
||
| 製品記事 |
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit |
||
| 関連記事 | |||
追加しました。
製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。