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Zymo-Seq WGBS Library Kit
バイサルファイト処理後のWGBSライブラリー調製を1本のチューブで行えます Zymo-Seq WGBS Library Kit
掲載日情報：2021/11/15 現在Webページ番号：68348
DNAメチル化解析に用いるWGBS（Whole Genome Bisulfite Sequencing）ライブラリーを調製するキットです。キットにはバイサルファイト処理試薬も含まれ、またバイサルファイト処理後のライブラリー調製のステップを1本のチューブで行えます。わずか4時間で再現性が高く、バイアスがないライブラリーを調製できます。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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2024/11/14
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH（ZYR）
- 特長
- 操作方法概略
- Zymo Research社のDNAメチル化解析用ライブラリー調製キットの一覧
- 関連した特集記事
- リード全体に渡りライブラリー調製時のバイアスを軽減
- 本キットで調製したライブラリーの解析例
- 他社製品との比較
- Zymo-Seq WGBS Library KitのFAQ
- キット内容
- 価格
特長
- わずか4時間で、再現性高く、バイアスがないライブラリーを調製できます。
- わずか10 ngのDNA試料から、90％以上のCpG、CHG、CHH部位（H=A / C / T）のメチル化の度合いを正確に検出できます。
- あらゆるメチル化のレベルにおいて、メチル化の度合いを正確に検出できます。
- 酵素反応のステップを1本のチューブで行えるため、多数試料の取り扱い時に特に有用です。
- バイサルファイト処理に用いているEZ DNA Methylation-Lightning Kit（#D5030T、#D5030、#D5031）は、多くの使用文献があり、信頼性が高い製品です。
- 調製したライブラリーは、すべてのIllumina社プラットフォーム（MiSeq、MiniSeq、HiSeq、NextSeq、NovaSeq）に対応しています。
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操作方法概略
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Zymo Research社のDNAメチル化解析用ライブラリー調製キットの一覧
製品名をクリックすると各製品の詳細を、商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。
| 製品名 （商品コード） |
Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit （#D5462 / #D5463） |
Zymo-Seq WGBS Library Kit （#D5465） |
Pico Methyl-Seq Library Prep Kit （#D5455 / #D5456） |
Zymo-Seq RRBS Library Kit （#D5460 / #D5461） |
|---|---|---|---|---|
| カバーされる領域 | ゲノム全体 | ゲノム全体 | ゲノム全体 | ゲノム中のCpG領域 |
| 試料DNAの 必要量 |
5～10 ng | 10～100 ng | 10 pg～100 ng | 10～500 ng |
| 試料DNAの品質 | cfDNAなど小さくて損傷したDNA | 損傷のないDNA （＞10 kb） |
損傷のないDNA、FFPE試料から抽出したDNA、cfDNA、分解されたDNA | 損傷のないDNAが望ましい ※ FFPE試料から抽出したDNA、およびcfDNAに適合することを確認済み |
| 対応生物種 | 全生物種 | 全生物種 | 全生物種 | 哺乳動物（ヒト、マウス、ラットなど） ※ 他の生物種については、事前にゲノムのカバー率の評価が必要 |
| 推奨するリード数 （ヒトゲノムの場合） |
5億リード | 6億リード | 6億リード | 4千万リード |
| 特長 | cfDNAの断片末端のメチル化状態を正確に保持 | 簡便な操作で、わずか4時間で調製可能 | 少量のDNA試料や劣化したDNA試料にも適用可能 | CpG領域を高い割合、かつ高い再現性でカバーできる |
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関連した特集記事
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リード全体に渡りライブラリー調製時のバイアスを軽減
マウスおよびシロイヌナズナのゲノムDNAから本キットを用いてWGBSライブラリーを調製し（左図）、従来法で調製したWGBSライブラリーの公開データ（右図）と比較した。すべてのシークエンスリードはトリミングをした後、Bismarkを用いてアライメントを行った。
従来法では追加のトリミングが必要なのに対して、本キットではリード全体に渡りバイアスのないデータが得られていることが示された。
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本キットで調製したライブラリーの解析例
100 ngのシロイヌナズナのゲノムDNAから本キットを用いてWGBSライブラリーを調製し、TapeStation 2200（Agilent社）で解析した。
約200?700 bpのフラグメントが生成されている。
左：D1000 ScreenTape gelの泳動図、右：エレクトログラム、A1：分子量マーカー、B1：調製したWGBSライブラリー
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他社製品との比較
| キットの種類 | 本製品 | A社製品 | B社製品 |
|---|---|---|---|
| バイサルファイト処理試薬を含む | ○ | ○ | ○ |
| ゲノムDNAの断片化が不要 | ○ | × | × |
| ユニークなDual Indexプライマーが付属 | ○ | × | × |
| Illumina社の標準的なシークエンシングに対応 | ○ | ○ | × |
| ビーズを用いた精製を行う回数 | 1 | 5 | 4 |
| 操作時間の合計 | 4時間 | 7.1時間 | 9.25時間 |
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Zymo-Seq WGBS Library KitのFAQ
Q-1. Zymo-Seq WGBS Library Kitには、シークエンシング用ライブラリーを調製する際に必要な試薬がすべて含まれていますか？
A-1. Illumina DNA Prep Kit（#20018704または#20018705）が必要です。別途、Illumina社からご購入下さい。
Q-2. インデックス用のプライマーを別途購入する必要がありますか？
A-2. 本キットには、12種類のユニークなDual index primer setが含まれています。追加のIndex primer setが必要な場合は、フナコシのテクニカルサポート（試薬担当）までお問い合わせ下さい。
Q-3. Zymo-Seq WGBS Library Kitを用いてWGBSライブラリーを調製する際に、FFPE試料から抽出したDNAやセルフリーDNAなどの劣化した試料を使用できますか？
A-3. 高品質で高収量のライブラリーを得るためには、用いるゲノムDNAのサイズが重要です。FFPE試料から得られたDNAは劣化が激しく、ライブラリーの品質に影響を与えます。セルフリーDNA（cfDNA）は、断片サイズが短すぎて効率的なタグ付加ができないため、本キットでは使用できません。
劣化したDNA試料からWGBSライブラリーを調製される場合は、Pico Methyl-Seq Library Prep Kitのご使用をお勧めします。
Q-4. Zymo-Seq WGBS Library Kitは、どんな生物種由来の試料に対応していますか？
A-4. 本キットは、哺乳類、バクテリア、植物など、あらゆる生物種から抽出したゲノムDNAに対応しています。RNAを含んでおらず、損傷のない高品質なゲノムDNAを使用するのがベストです。
Q-5. WGBSライブラリーに必要な推奨リード長と読み取り深度はどのくらいですか？
A-5. ライブラリーは、どのようなサイクリング回数にも適していますが、サイクリング回数が増えると、より多くのアダプタートリミングが必要になります。ほとんどの場合、100 bpのペアエンドリードが適しています。読み取り深度（リード数）は、ゲノムサイズと希望するカバー率に依存します。一般的には、CpG部位あたりのカバー率を10倍にすることをお勧めします。
リード数（N）は、以下の式を用いて算出することができます。
N = (Coverage)×(Diploid Genome Length) / Read Length.
バイサルファイト処理は、DNA-seqに比べてゲノムの複雑度を軽減し、アラインメント率が低いため、リード数を25％増やすことが推奨されています。したがって、100 bpペアエンドシークエンシングを用いた10×カバー率のヒトWGBSの場合、最低でも4億リードが推奨されます。
Q-6. Zymo-Seq WGBS Library KitとPico Methyl-Seq Library Prep Kitの違いは何ですか？どちらを使用すれば良いですか？
A-6. Zymo-Seq WGBS Library Kitは、高濃度のゲノムDNA（10～100 ng）を扱う方に最適です。取り扱いや洗浄の手間が少なく、ハイスループットなライブラリー作成に適しています。
一方、Pico Methyl-Seq Library Prep Kitは、少量のDNA（10 ng以下）や、セルフリーDNA（cfDNA）やFFPEから抽出したDNAのように断片化が進んだDNAを扱う場合に適しています。
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キット内容
※ タグメンテーションにはIllumina DNA Prep Kit（Illumina社、#20018704または#20018705）が別途必要です。その他の必要な試薬、装置類については、製品プロトコルをご確認下さい。
※ 各キットコンポーネント名をクリックすると、単品の価格表をご覧いただけます。
＊ 印で示したキットコンポーネントは、EZ DNA Methylation-Lightning Kit（#D5030T、#D5030、#D5031）に含まれています。
- Lightning conversion reagent＊
- M-binding buffer＊
- M-wash buffer＊
- L-desulphonation buffer＊
- DNA elution buffer
- DNase / RNase-free water
- Zymo-Spin IC column＊
- Collection tube＊
- E. coli non-methylated genomic DNA
- WGBS priming reagent
- WGBS synthesis buffer
- WGBS enzyme
- WGBS library PCR mix
- UDI tag primer
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価格
[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時35分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Zymo-Seq WGBS Library Kit |
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時35分現在]
Zymo-Seq WGBS Library Kit
文献数： 0
- 商品コード：D5465
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥184,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 | DNAメチル化解析に用いるWGBSライブラリーを調製するキット。キットにはバイサルファイト処理試薬も含まれ，またバイサルファイト処理後のライブラリー調製のステップを1本のチューブで行える。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温,-20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2022年11月1日号 p.18
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| 製品記事 | |||
| 関連記事 | 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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関連製品：EZ DNA Methylation-Lightning Kit
[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時35分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (10preps) |
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.) |
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (200 rxns.) |
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時35分現在]
EZ DNA Methylation-Lightning Kit (10preps)
文献数： 0
- 商品コード：D5030T
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥11,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 | |||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | EZ DNA Methylation-Lightning Kit Zymo-Seq Trio WGBS Library Kit EZ DNA-Methylation Gold/Lightning Kit |
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| 関連記事 | [ZYR]核酸精製・DNAメチル化検出キット・核酸保存試薬 お試しサンプル品 |
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (50 rxns.)
文献数： 0
- 商品コード：D5030
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥48,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 | メチル化DNA検出キット。小包装のサンプルあり。 |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | 取扱注意 | ||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2024年10月15日号 p.31 ニュース2021年3月15日号 p.4
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| 製品記事 | Zymo-Seq RRBS Library Kit EZ DNA Methylation-Lightning Kit Zymo-Seq Trio WGBS Library Kit EZ DNA-Methylation Gold/Lightning Kit |
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EZ DNA Methylation-Lightning Kit (200 rxns.)
文献数： 0
- 商品コード：D5031
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥136,000
- 在庫：1個
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 | メチル化DNA検出キット。 |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | 取扱注意 | ||||||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.4 ニュース2020年5月1日号 p.6
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| 製品記事 | Zymo-Seq RRBS Library Kit EZ DNA Methylation-Lightning Kit Zymo-Seq Trio WGBS Library Kit EZ DNA-Methylation Gold/Lightning Kit |
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追加しました。
製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。