UMI/UDI配列を含むプライマーが付属!別途ご用意はいりません! Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit
掲載日情報:2023/12/12 現在Webページ番号:71243
Total RNA試料から、ライブラリー調製の前処理を行わずに迅速かつ簡単に3'mRNA-Seq用のNGSライブラリーの調製を行えるキットです。cDNA合成に用いるOligo dT primerにUMI配列を、ライブラリー増幅に用いるインデックスプライマーにUDI配列を有し(それぞれ下記参照)、高い精度でのシークエンシングを行えます。また、本キットで調製したライブラリーは、HiSeq Xシリーズを除く、すべてのイルミナ社シークエンサーと互換性があります。
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- Index hoppingとUnique Dual Indexes (UDI)について
- Unique Molecular Identifiers (UMI)について
- 特長
- 操作方法概略
- 使用例
- Zymo-Seq RNA Library Kitシリーズ製品の比較表
- 関連した特集記事
- キット内容
- 価格
Index hoppingとUnique Dual Indexes (UDI)について
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Unique Molecular Identifiers (UMI)について
UDIとUMIを併用することで、お互いの利点を組み合わせて解析ができます。
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特長
- ライブラリー調製の前処理は不要です。
- mRNAにポリAテールを有する生物種(真核生物など)のRNAに適しています。
- 10~500 ngのTotal RNAからライブラリー調製が可能です。
- 約4時間の高速プロトコルです(8試料の場合)。
- cDNA合成に用いるOligo dT primerにUMI配列を、ライブラリー増幅に用いるインデックスプライマーにUDI配列を有するため、別途用意する必要はありません。
- RNAから合成した一本鎖のcDNAにアダプターを付加させる独自のSwitchFree法を採用しています(操作方法概略参照)。
- 磁気ビーズで精製するため、操作が簡単です。
- 自動分注装置による自動化も可能です。
- 遺伝子発現量の定量および発現差解析(DGE)に適しています。
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操作方法概略
1. cDNA合成
Oligo dT primerを用いて、cDNA合成を行う。
(P5アダプター配列とUMI配列の付加)
2. アダプターのライゲーション
一本鎖cDNAにP7アダプター配列を付加する。
3. ライブラリーの増幅
PCR産物の全長にはindex(UDI)および分子バーコード(UMI)配列を含まれる。
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使用例
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Zymo-Seq RNA Library Kitシリーズ製品の比較表
商品コードをクリックすると価格表がご覧いただけます。
品名をクリックすると詳細情報がご覧いただけます。
品名 | 推奨する用途 | 推奨する試料 | 最小試料量 | 商品コード |
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Zymo-Seq SwitchFree3′mRNA Library Kit |
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10 ng | R3008 R3009 |
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit |
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10 ng | R3000 R3003 |
Zymo-Seq miRNA Library Kit |
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1 ng | R3006 R3007 |
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関連した特集記事
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キット内容
各キットコンポーネント名をクリックすると、単品の価格表をご覧いただけます。
キット名 | Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit | |
---|---|---|
商品コード | R3008 (12 preps) |
R3009 (96 preps) |
PolyA R1 reagent | 〇 | 〇 |
R2 reagent | 〇 | 〇 |
Reaction clean-up solution | 〇 | 〇 |
3′mRNA L reagent | 〇 | 〇 |
ZymoTaq premix | 〇 | 〇 |
Zymo-Seq UDI primer sets(Indexes 1-12) | 〇 | ― |
Zymo-Seq UDI primer plate(Indexes 1-96) | ― | 〇 |
Select-a-Size MagBead | 〇 | 〇 |
Select-a-Size MagBead buffer | 〇 | 〇 |
Library binding solution | 〇 | 〇 |
DNA wash buffer | 〇 | 〇 |
DNA elution buffer | 〇 | 〇 |
DNase / RNase-free water | 〇 | 〇 |
※ 磁気ビーズスタンドが別途必要です。PCR Strip MagStand(#3DP-1002)のご使用をお勧めします。
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価格
[在庫・価格 :2024年12月10日 00時01分現在]
詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit (12 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit (96 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 :2024年12月10日 00時01分現在]
Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit (12 preps)
文献数: 0
- 商品コード:R3008
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥81,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | |||
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温,4℃,-80℃ | 法規備考 | |
掲載カタログ |
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製品記事 | 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集 |
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関連記事 |
Zymo-Seq SwitchFree 3' mRNA Library Kit (96 preps)
文献数: 0
- 商品コード:R3009
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:ご照会ください
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | |||
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温,4℃,-80℃ | 法規備考 | |
掲載カタログ |
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製品記事 | 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集 |
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関連記事 |
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