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リキッドバイオプシー(Liquid Biopsy)研究用製品特集
セルフリーDNA/RNA(cfDNA/cfRNA)抽出・解析キットなどをご紹介 リキッドバイオプシー(Liquid Biopsy)研究用製品特集
掲載日情報:2023/02/17 現在Webページ番号:65836
フナコシ /
フナコシ(株)
[メーカー略称:FUN]
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リキッドバイオプシーとは
リキッドバイオプシーは,血漿や血清,尿などの体液の試料を用いて疾病の診断を行う方法であり,採血や生体液の採取で診断が行えるため,患者にも診断する側にも負担が少ない非侵襲的な方法として注目されています。リキッドバイオプシーのバイオマーカーとして,エクソソームやcfDNA(cell free DNA),血中循環腫瘍細胞(Circulating Tumor Cells:CTC),循環RNA(miRNA,IncRNA,mRNA),ペプチドなどがあります。
血清,血漿試料中に含まれるセルフリー核酸(cfNA)は,セルフリーDNA(cfDNA)およびセルフリーRNA(cfRNA)からなります。それらは,主に各種組織においてアポトーシスまたはネクローシスを起こした細胞の溶解時に放出されたものか,またはエクソソームなどの微小小胞体として分泌された粒子中に含まれるものです。後者は,遠く離れた細胞や組織との情報伝達を担っています。
しかし,cfNAの利用には「検出に必要な量のcfNA 得るためには多量の試料を必要とすること」や「高濃度の血漿タンパク質や不純物を除去し効率的なcfNA回収が困難であること」といった課題が残されています。
リキッドバイオプシーにおけるエクソソーム(クリックで詳細が表示されます)
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セルフリーDNAとは
血漿・血清中のcfDNAについて遺伝的解析やエピジェネティック解析を行うことが,がんや自己免疫疾患,感染,胎児異常の早期発見につながるとされています。主にモノヌクレオソームに含まれる170塩基対と,ジヌクレオソームに含まれる340塩基対の2種類のccfDNA(circulating cell-free DNA:循環セルフリーDNA)断片が臨床的に重要であることが示されており,これらヌクレオソームはアポトーシスによる細胞死の際に血中へ放出されます。また,ネクローシス細胞から生じた比較的大きなcfDNA(>1,000 bp)も検出されます。
健常者では血漿/血清cfDNA濃度は低く(0~50 ng/ml),妊娠や疾患,激しい運動やけがによる組織損傷の際にはcfDNA濃度が上昇します。妊娠や疾患の際のcfDNA濃度上昇の検出は,非侵襲的な診断や疾患モニタリング方法になる可能性があるとして注目を集めています。例えば,妊娠時には胎児由来のcfDNAは母親の血漿中を循環しており,トリソミーやその他の胎児の状態の出生前スクリーニングに使用されています。がん患者においては,Ras遺伝子の変異はcfDNAにおける最初の変化の一つであり,腫瘍の進行や再発,治療に対する反応をモニタリングするためのバイオマーカーとして研究されています。そのほか,移植片拒絶反応や糖尿病,自己免疫疾患,心疾患の際にもcfDNAに変化が見られます。
参考文献
- Swarup, V., and Rajeswari M.R., "Circulating (cell-free) nucleic acids - a promising, non-invasive tool for early detection of several human diseases", FEBS Lett., 581 (5), 795~799 (2007).
- Devonshire, A.S., et al., ”Towards standardisation of cell-free DNA measurement in plasma: controls for extraction efficiency, fragment size bias and quantification", Anal. Bioanal. Chem., 406(26), 6499~6512 (2014).
ctDNA中のEGFR変異検出について(クリックで詳細が表示されます)
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血中循環ヒストンとは
クロマチンの構成単位であるヌクレオソームは,DNAとヒストン8量体で構成されており,細胞死などによって血中に放出されてセルフリーDNAと共に循環します。この循環ヌクレオソームおよび循環ヒストン濃度は,一部の疾患患者中の血清で上昇することが確認されており,エピジェネティックな疾患バイオマーカーとして注目されています1,2。 また,血中にはメチル化やシトルリン化などの翻訳後修飾を受けたヒストンも存在します。これらは,健常者と疾患患者とでは血中濃度が異なるという報告もあり,各種修飾ヒストンは血中バイオマーカーとして注目されています3~8。血中循環ヒストンに関する報告は下記の通りです。
血中循環ヒストンに関する報告(クリックで詳細が表示されます)
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製品ラインナップ
カテゴリー名をクリックすると,各製品の詳細情報をご紹介したページをご覧いただけます。
cfDNAやcfRNAを抽出・精製するキット
■ cfDNA用のキット
メーカー | 品名 | 方法 | 適応試料/最大処理量 | 製品概要 | |
---|---|---|---|---|---|
血清・血漿 | その他の試料 | ||||
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Quick-cfDNA Serum & Plasma Kit | スピン カラム |
血清:10 ml 血漿:3 ml/10 ml*1 |
羊水・脳脊髄液(CSF):1 ml, 唾液:1/5 ml*2 |
cfDNAを抽出・精製するキット |
Quick-DNA Urine Kit | - | 尿:40 ml | |||
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MAGicBead cfDNA Isolation Kit | 磁性 ビーズ |
0.2~10 ml | 尿,唾液,脳脊髄液,羊水,培養後の細胞培養液,胸水,胆汁酸,気管支肺胞洗浄液 | |
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EpiQuik Circulating Cell-Free DNA Isolation Easy Kit | 磁性 ビーズ |
0.5 ml | - | |
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Mag-Bind cfDNA Kit | 磁性 ビーズ |
500~4,000 μl | - | |
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cfMAX cfDNA Isolation System | 磁性 ビーズ |
500 μl~8 ml | - | |
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XCF COMPLETE Exosome & cfDNA Isolation Kit | スピン カラム |
0.5 ml | - | 試料に含まれるエクソソーム由来のDNAとcfDNAを単離するキット |
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FitAmp Circulating DNA Assay Kit | スピン カラム |
300 μl | - | cfDNAの抽出・精製から定量まで行えるキット |
*1 血漿からのcfDNAの抽出の際は,遠心分離を2回行うことをお勧めします。遠心分離を2回行うことにより,残留する細胞,細胞残屑や粒子状物質などを取り除くことができます。遠心分離の回数によって最大処理量は異なります(1回の場合には3 ml,2回の場合には10 ml)。
*2 通常の唾液試料の最大処理量は1 mlですが,セルフリーの唾液試料の場合の最大処理量は5 mlとなります。
cfDNA増幅キット
エクソソーム研究用製品
詳細は,エクソソーム(Exosome)研究用製品特集をご覧ください。エクソソームに関する解説,製品ラインナップ,実験ナビゲーションなどをご紹介しています。
NGS解析用製品
CTC検出用製品
血中循環ヒストン解析キット
ヒト・マウス・ラットの血清・血漿試料中に含まれる循環ヒストンを,ELISA様フォーマットで比色定量できるキットです。
- EpiQuik Circulating Acetyl Histone ELISA Kit:
循環アセチル化ヒストン定量キット - EpiQuik Circulating Total Histone H3 Quantification Kit :
総循環ヒストンH3定量キット - EpiQuik Circulating Histone Assay Kit:
総循環ヒストンH3または各種修飾ヒストン定量キット - EpiQuik Circulating Histone Assay Kit:
22種類の修飾ヒストンH3(メチル化/アセチル化/リン酸化/シトルリン化)同時定量キット
キャピラリー電気泳動装置
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