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アポトーシス細胞由来のセルフリーDNAの増幅を行えるキット TruePrime Apoptic Amplification Kit

掲載日情報:2020/07/14 現在Webページ番号:69905

4basebio社のTruePrime法を用い、合成ランダムプライマーを使用せずにセルフリーDNA(cfDNA)を増幅するキットです。本製品は、アポトーシス由来、長さ160~170 bpの断片化されたcfDNAを増幅することができます。

使用例

#使用例

腫瘍タイプごとの増幅DNA量

がん患者48人 (N = 48) から各々採取した血液 (各10 ml) から、ダブルスピン法で血漿を分離した。分離した血漿1 mlからcfDNAを精製し、DNA量を測定した後、各cfDNA1 ngをTruePrime Apoptic Amplification Kit (#340005, #340020) を用いて増幅を行った。その結果、すべてのcfDNAが効率的に増幅され、あらゆる分析や技術に十分なDNA量が得られた。

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特長

  • 測定試料:血漿、血清、尿、脳脊髄液、その他体液のcfDNA
  • 160~170 bpのcfDNA増幅に最適です。
  • 高感度で、pgレベルから150 ngまたは50μlまでのcfDNAを増幅できます。
  • Phi29 DNAポリメラーゼを採用しており、高いfidelityで増幅が行えます。
  • 合成ランダムプライマー由来のアーティファクトを含みません。
  • 合理的なワークフローで操作時間の短縮が見込めます。

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TruePrime法とは

Phi29 DNAポリメラーゼを用いたDNA増幅方法はMultiple strand Displacement Amplification (MDA) 法と呼ばれ、単一細胞からの均一なDNA増幅が可能な方法として注目されています。しかし、合成ランダムプライマーを使用することから、プライマー由来のバイアスが生じることが知られています。

4basebio社は、Phi29 DNAポリメラーゼと新規のDNAプライマーゼTthPrimPolを組み合わせ、ランダムプライマーによるアーティファクトや、外部DNA汚染の影響を低減したキットを開発しました。

TruePrimeシステムによるDNA増幅の模式図
  1. TthPrimPol (赤四角) が変性DNAの異なる部位に結合する。
  2. TthPrimPolが、短いDNAプライマーを合成する。
  3. Phi29 DNAポリメラーゼ (青丸) がTthPrimPolと置き換わり、合成を開始する。
  4. Phi29 DNAポリメラーゼが、鎖置換を起こす。
  5. TthPrimPolが新生DNAに結合し、新しいDNAプライマーを合成する。
  6. Phi29 DNAポリメラーゼがTthPrimPolと置き換わり、DNAプライマーと結合し、合成を開始する。

参考文献

  • Zafar M. K., et al, Biochemistry, 53 (41), 6584~6594 (2014).
  • Helleday T., Nat. Struct. Mol. Biol., 20, 1348~1350 (2013).
  • Garcia-Gomez S., et al, Mol. cell, 52 (4), 541~553 (2013).

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増幅原理

#増幅原理
  1. DNA末端を平滑化する。
  2. 5’末端にリン酸基を、3’末端にヒドロキシ基を付加し、さらに3’末端にdAを付加する。
  3. 両末端にヘアピン構造のアダプターをライゲートする。
  4. TthPrimPolがヘアピン構造を認識しプライマーを合成する。
  5. 強い鎖置換能力を有するPhi29 DNAポリメラーゼがプライマーを認識しDNAを伸長する。(TruePrime法)
  6. TthPrimPolが新たに作られたヘアピン構造を認識しプライマーを合成する。ローリングサークル型複製によってcfDNAが増幅される。

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TruePrimeキットシリーズ

各製品の詳細は品名をクリックして下さい。

品名用途
TruePrime Necrotic Cell-free / Exosomal DNA Amplification Kitネクローシス細胞やエクソソーム由来の少量の精製cfDNAを増幅するキット
TruePrime Apoptic Amplification Kitアポトーシス由来の長さ160~170 bpの断片化されたcfDNAを増幅するするキット
TruePrime WGA Kit少量の精製DNAから全ゲノム増幅するキット
TruePrime Single Cell WGA Kitシングルセルから全ゲノム増幅するキット
TruePrime RCA Kit 一本鎖または二本鎖環状DNAの増幅を行えるキット

NGS特集へのリンク
cfDNA特集へのリンク

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キット内容

  • End-repair enzyme mix
  • End-repair reaction buffer
  • Ligation mix
  • Enhancer
  • Adaptor
  • Reaction buffer
  • dNTPs
  • Nuclease-free water
  • Enzyme 1/2

セルフリーDNAを抽出するキット等が別途必要です。


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4basebio社製品ご購入のご注意

本製品は、ご注文時に専用のMTA(Material Transfer Agreement)が必要です。必要事項をご記入の上、販売店担当者にお渡し下さい。


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価格

[在庫・価格 :2024年04月25日 15時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
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納期 文献数
TruePrime apoptic amplification kit (5reactions)
3~4週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
※MTAが必要です。※輸入諸費用(120,000円)を別途いただく製品です。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年1月合併号 p.22

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TruePrime apoptic amplification kit (20reactions)
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TruePrime apoptic amplification kit (5reactions)

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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