ヒドロキシメチル化DNAの研究に！ エピジェネティクスカタログ＜5-hmC＞

MEMO

5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC）とは

5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC）は、様々な生物種に存在するシトシン修飾体の一つで、ヒトやマウスの神経組織では高レベルでその存在が確認されています。幹細胞の自己複製、がんの発症や進行、神経疾患など多くの分野においてエピジェネティックな潜在因子として注目を集めています。ここ数年、DNAのヒドロキシメチル化についての研究が行われてきましたが、その生物学的な役割については未だ不明な点が多く残されています。

“6種類目の塩基”と考えられている5-hmCは、DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担っていると推測されていますが、それ自体が新たなエピジェネティックな調節を担っている可能性があります。

5-hmCの存在が確認されたことにより、これまでの5-mC解析について再測定をする必要が生じただけでなく、試料間での5-hmC量の比較をする必要が指摘されています。しかしながら、5-メチル化シトシン(5-mC)の検出方法としてこれまで用いられてきた制限酵素分解、亜硫酸水素塩処理、メチル化DNA免疫沈降とメチル化特異的PCRの組み合わせ、シークエンシングなどの手法では、5-hmCと5-mCの識別を行うことはできません。
そのため、β-Glucosyltransferaseにより5-hmCをグリコシル化した後に、5-mCのTet1による酸化と亜硫酸水素塩処理を組み合わせた手法で5-hmCを検出する手法などが用いられています。