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5-hmC化DNAを特異的に認識する抗体抗5-Hydroxymethylcytosine抗体

掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：5560

ザイモリサーチ /
ZYMO RESEARCH
[メーカー略称：ZYR]

抗5-Hydroxymethylcytosine抗体をご紹介します。

※本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC：5-hydroxymethylcytosine）を含む一本鎖DNAを特異的に認識する抗体です。

5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC）とは
特長
価格
Quest 5-hmC Detection Kit

5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC）とは

5-hmCは、近年、動物組織で発見されたシトシン修飾体のひとつです。エピジェネティクスにおける5-hmCの役割は未だ判明していませんが、メチル化シトシン（5-mC）と異なる重要な役割を担っていると考えられています。
これまで用いられてきた制限酵素分解、亜硫酸水素塩処理、メチル化DNA免疫沈降とメチル化特異的PCRの組み合わせ、シークエンシングなどの手法では、5-hmCと5-mCの識別ができません。
5-hmCの存在が確認されたことにより、これまでの5-mC解析について再測定をする必要が生じただけでなく、試料間での5-hmC量の比較を行う必要性が指摘されています。

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特長

少量の5-hmCを高感度に検出できます。
通常のシトシン（C）、メチル化シトシン（5-mC）に対する交差性が低くなっています。

本抗体の交差性の確認
通常のシトシン（C）、メチル化シトシン（5-mC）、5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hmC）を含むDNAを10：1：1で混合した1 ngの試料を、抗5-Hydroxymethylcytosine抗体（#A4001）を用いて免疫沈降を行った。なお、5-mCを含むDNAはBamHI部位を、5-hmCを含むDNAはKpnI部位を有する。回収したDNAを、上記の制限酵素部位を含むようにPCRで増幅した後、B：BamHI、K：KpnIで分解を行い、ゲル電気泳動した。本抗体が、5-mCに交差していないことが分かる。

マウス各種組織由来ゲノムDNA中の5-hmC量の比較
マウス各種組織から精製したゲノムDNAをプレートにコートして、抗5-Hydroxymethylcytosine抗体（#A4001）とHRP標識二次抗体を用いたダイレクトELISA法により、検出を行った。なお、LC/MS法でマウス各種組織由来ゲノムDNA中の5-hmC量を解析したところ、脳：0.548％、腎臓：0.225％、肝臓：0.107％、胸腺：0.030％となり、本抗体を用いた結果と相関性を示した。

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