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5-hmC化DNAを特異的に免疫沈降できるキット EpiQuik Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Kit

掲載日情報:2016/06/16 現在Webページ番号:5205

抗5-ヒドロキシメチル化シトシン(5-hmC)抗体を用いて、5-hmCを含むDNAを免疫沈降(hMeDIP:Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation)により濃縮できる96ウェルフォーマットのキットです。

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特長

  • 簡単な操作法で、再現性が高い結果が得られます。
  • わずか3時間でDNA溶出までを行え、実際に操作する時間は20分以下です。
  • 哺乳動物、植物、菌類、バクテリア、ウイルスなど幅広い生物種、特に哺乳動物では、培養細胞、新鮮・凍結・パラフィン包埋組織と幅広い試料を用いて免疫沈降が行えます。
  • 5-hmCを含む一本鎖および二本鎖DNAのみを選択的に濃縮できます。
  • ポジティブコントロールに対するネガティブコントロールの濃縮効率は1,000倍以上です。
  • キットには、hMeDIPのポジティブコントロールとして5-hmCを含むDNA断片、ネガティブコントロールとして非免疫IgG、PCRのポジティブコントロールとしてコントロールプライマーが含まれています。
  • 試料DNA量:100 ng~1μg(最適量:500 ng)
  • 溶出したDNAは、PCR(hMeDIP-PCR)やマイクロアレイ(hMeDIP-chip)による、組織・細胞特異的なDNA解析に使用できます。

5-ヒドロキシメチル化DNAの濃縮効率

本キットでの5-ヒドロキシメチル化DNAの濃縮効率
断片化した500 ngのヒトゲノムDNAに、それぞれ50 pgの非メチル化DNA、メチル化DNA、5-ヒドロキシメチル化DNAを添加した試料を、本キットに含まれる抗5-hmC抗体を用いてhMeDIPを行った。また、ネガティブコントロールとして非免疫IgGを用いた。得られたDNAを、キットに含まれるコントロールプライマーを用いてリアルタイムPCRを行い、Ct値から濃縮効率を計算した。

5-ヒドロキシメチル化DNAの検出

遺伝子特異的な5-ヒドロキシメチル化DNAの検出
EpiSonic 1000を用いて断片化した500 ngのヒト脳由来のゲノムDNAを、本キットを用いてhMeDIPを行った。得られたDNAを、OCT4(5-ヒドロキシメチル化DNA)およびGAPDH(非メチル化DNA)のプロモーター領域に対するプライマーを用いてリアルタイムPCRを行い、Ct値から濃縮効率を計算した。

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キット内容

  • Wash buffer
  • Antibody buffer
  • hMeDIP solution
  • DNA release buffer
  • Non-Immune IgG
  • 5-hmC antibody
  • Control DNA
  • Proteinase K
  • Control primers
  • 8-well assay strip with frame
  • Adhesive 8-well strip film

DNA試料のせん断にはEpiSonic 1000(#EQC-1000)のご使用が便利なためお勧めします。

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価格

[在庫・価格 :2024年04月29日 00時00分現在]

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Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Kit, EpiQuik (48reactions) <EpiQuik hMeDIP Kit>
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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