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RRHP 5-hmC Library Prep Kit
次世代シークエンサーで5-hmCを解析するためのライブラリー作製キット RRHP 5-hmC Library Prep Kit
掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：9033
RRHP(Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)により、次世代シークエンサーで5-hmCを解析するためのライブラリーを作製するキットです。試料は少量で済み、亜硫酸水素塩処理は必要ありません。
※作製したライブラリーは、Illumina 社次世代シークエンサー（HiSeq, MiSeq）に使用できます。
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RRHP (Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)について
RRHP (Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)は、5-hmCのグリコシル化と制限酵素MspⅠを利用し、5-hmCを含む配列のみを特異的に解析する方法です。MspⅠは、CCGG配列を認識し5-mCおよび5-hmCのいずれも切断しますが、グリコシル化された5-hmCは切断しません。この特性を利用し、DNAにアダプター配列を付加してグリコシル化処理を行った後にMspⅠで処理することで、アダプター配列が付加された5-hmCを含む断片のみを得ることができます。
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特長
- ゲノムワイドに5-hmCの定量解析を行えます。
- 試料の亜硫酸水素塩処理は必要ありません。
- 本製品で処理した試料は、Illumina社の次世代シークエンサーでの解析やクローニング、アレイ解析などに用いることができます。
- キットにはRRHPに必要な酵素やバッファー、ライブラリー構築用の試薬がすべて含まれています。
- 必要試料量：≧100 ng (ニューロン由来DNA）、≧500 ng（その他の細胞、組織由来DNA）
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使用例
RRHP 5-hmC Library Prep Kitで作製したライブラリーを、次世代シークエンサーで解析した例
Human brain DNA was prepared using the RRHP 5-hmC Library Prep Kit and then sequenced with an Illumina HiSeq 2000 with 50 bp single-end reads. Sequence was aligned to the human reference genome.
Tracks (bottom figure) display relative quantitation of 5-hmC strand distribution (blue = sense, red = antisense) as well as SNP positions within the fragments at a single locus.
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キット内容
- MspⅠ
- RRHP reaction buffer
- UDPG
- 5-hmC glucosyltransferase
- RRHP adapter 1 / 2
- T4 DNA ligase
- Index primer set
- rATP
- Taq DNA polymerase
- QuestTaq premix
- dNTP
- Zymo-Spin IC column
- Collection tube
- DNA wash buffer
- ADB buffer
- DNA binding buffer
- DNA elution buffer
- DNase/RNase-free water
[在庫・価格 ：2024年04月24日 00時00分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RRHP 5-hmC Library Prep Kit (12 preps.) |
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RRHP 5-hmC Library Prep Kit (25 preps.) |
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[在庫・価格 ：2024年04月24日 00時00分現在]
RRHP 5-hmC Library Prep Kit (12 preps.)
文献数： 0
- 商品コード：D5450
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥223,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
次世代シークエンスで5-hmCを解析するためのライブラリー作製キット。 |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | |||||||
| 保存条件 | 室温,-20℃ | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2023年9月1日号 p.10 ニュース2023年1月合併号 p.23
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| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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| 関連記事 | |||||||
RRHP 5-hmC Library Prep Kit (25 preps.)
文献数： 0
- 商品コード：D5451
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥377,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
次世代シークエンスで5-hmCを解析するためのライブラリー作製キット。 |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 別包装品 | 別包装品あり | ||||||
| 法規制等 | |||||||
| 保存条件 | 室温,-20℃ | 法規備考 | |||||
| 掲載カタログ |
ニュース2023年9月1日号 p.10 ニュース2023年1月合併号 p.23
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| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。