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メーカー：	Horizon社Dharmacon製品 OriGene Technologies
	Horizon社Dharmacon製品(メーカー略称：DHA)のRNAiコレクション，cDNAコレクション，Yeastコレクションなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら OriGene Technologies社(メーカー略称：ORI)のTrueClone / TrueORF / TrueORF Gold cDNAクローンなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら
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次世代シークエンサーで5-hmCを解析するためのライブラリー作製キット RRHP 5-hmC Library Prep Kit

掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：9033

ザイモリサーチ /
ZYMO RESEARCH
[メーカー略称：ZYR]

RRHP(Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)により、次世代シークエンサーで5-hmCを解析するためのライブラリーを作製するキットです。試料は少量で済み、亜硫酸水素塩処理は必要ありません。
※作製したライブラリーは、Illumina 社次世代シークエンサー（HiSeq, MiSeq）に使用できます。

※本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

RRHP (Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)について
特長
使用例
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キット内容

RRHP (Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)について

RRHP (Reduced Representation Hydroxymethylcytosine Profiling)は、5-hmCのグリコシル化と制限酵素MspⅠを利用し、5-hmCを含む配列のみを特異的に解析する方法です。MspⅠは、CCGG配列を認識し5-mCおよび5-hmCのいずれも切断しますが、グリコシル化された5-hmCは切断しません。この特性を利用し、DNAにアダプター配列を付加してグリコシル化処理を行った後にMspⅠで処理することで、アダプター配列が付加された5-hmCを含む断片のみを得ることができます。

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特長

ゲノムワイドに5-hmCの定量解析を行えます。
試料の亜硫酸水素塩処理は必要ありません。
本製品で処理した試料は、Illumina社の次世代シークエンサーでの解析やクローニング、アレイ解析などに用いることができます。
キットにはRRHPに必要な酵素やバッファー、ライブラリー構築用の試薬がすべて含まれています。
必要試料量：≧100 ng (ニューロン由来DNA）、≧500 ng（その他の細胞、組織由来DNA）

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使用例

5-hmCを含む配列のみのライブラリー作製に有用です RRHP 5-hmC Library Prep Kit

RRHP 5-hmC Library Prep Kitで作製したライブラリーを、次世代シークエンサーで解析した例

Human brain DNA was prepared using the RRHP 5-hmC Library Prep Kit and then sequenced with an Illumina HiSeq 2000 with 50 bp single-end reads. Sequence was aligned to the human reference genome.
Tracks (bottom figure) display relative quantitation of 5-hmC strand distribution (blue = sense, red = antisense) as well as SNP positions within the fragments at a single locus.

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