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DNA / RNA試料の保存試薬 DNA / RNA Shield
掲載日情報:2020/11/18 現在Webページ番号:7176
DNA / RNA試料の保存試薬です。試料に添加するだけで、試料中のDNA / RNAを室温(4~30℃)でも安定に保持できます。また、同時にウイルスや感染性病原体等も不活化します。
※ 本製品を用いた試料保存において、室温は4~30℃を想定しています。
※ 試料採取用チューブにDNA / RNA Shield をあらかじめ充填した製品についてはこちらをご覧下さい。
※ 唾液などの試料中のウイルスゲノム(核酸)の分解を防ぎ、核酸の抽出操作を必要とせずに直接PCRを行えるDNA / RNA Shield DirectDetectについてはこちらをご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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2024/11/14
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH(ZYR)
- 特長
- 他社類似製品との比較
- 使用例
- 使用例:新型コロナウイルスの不活性化実験
- DNA / RNA Shieldで保存した試料からの核酸精製について
- DNA / RNA Shieldによる不活化の実績がある病原体の例
- ウイルス関連試料におけるDNA / RNA Shieldの使用文献
- DNA / RNA ShieldのFAQ
- 価格
特長
- DNAもしくは、RNAを含む様々な試料を、安定的に保存するのに適したAll-in-one保存試薬です。
- DNA / RNA Shieldは試料を効率よく溶解し、RNase、ウイルスやそのほかの感染性病原体を効率よく不活化します。
- DNA / RNA Shieldで保存した試料は、室温下(4~30℃)でDNAは2年以上、RNAは1か月まで保存可能です。-20℃/-80℃では、より長期間の保存が可能です。
- DNA / RNA精製の際には試薬の除去は不要です。
- ほとんどのDNAおよびRNA精製キットに適応します(推奨するキットはこちら)。
- DNA / RNA Shiedによる感染性病原体の不活性化は、米国CDC(疾病予防管理センター)のガイドラインに準拠し、独国EUROVIR Hygiene-Labor社から認証を受けています。
- 米国NASA(航空宇宙局)での使用実績もあります。
- 試料:細胞、組織、微生物、血液、唾液、尿、糞便など。
※組織や溶解しにくい物質は、あらかじめホモジナイズが必要です。使用方法についてはデータシートをご確認下さい。
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他社類似製品との比較
DNA / RNA Shield | 他社類似製品の RNA保存試薬 |
|
細胞、組織、血液、唾液、尿、糞便の保存 | ○ | × (組織のみ保存可) |
感染性病原体の不活化 | ○ | × |
保存試薬の除去をせずに、直接スピンカラムを用いての精製 | ○ | × |
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使用例
DNAもしくは、RNA保存試薬を用いて保存した試料中のウイルス不活化の比較
DNA / RNA Shieldまたは他社類似製品のRNA保存試薬と、単純ヘルペスウイルス(HSV:Herpes Simplex Virus)をインキュベートした。他社類似製品のRNA保存試薬を用いると、ウイルスが不活化されないが、DNA / RNA Shieldでは完全にウイルスが不活化されたことが分かる。
DNA・RNA保存試薬を用いて保存した試料から精製したRNAの比較
DNA / RNA Shieldを用いて室温で保存した細胞試料から、直接RNAを精製した。本製品を用いて保存した試料のRNAが分解していないことが分かる。
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使用例:新型コロナウイルスの不活性化実験
実験概略
- 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)溶液100μlに、DNA / RNA ShieldまたはPBS(ネガティブコントロール)300μlを添加し、室温で10分間インキュベートする。
- 溶液を5% FBS含有のDMEM培地で10倍連続希釈し、希釈溶液それぞれ50μlを、TMPRSS2発現Vero細胞株*に接種する。
- 接種したTMPRSS2発現Vero細胞株を37℃で24時間培養後、アセトン/メタノール(1:1)で固定し、抗SARS-CoV-2ヌクレオカプシド抗体およびAlexa488標識二次抗体で免疫蛍光染色を行う。
* TMPRSS2は、SARS-CoV-2のSpikeタンパク質活性化に関与している。
結果および考察
- 上記の結果から、ウイルスとDNA / RNA Shieldを混合した試料では、検出限界未満(8×104 viruses/ml)までウイルスが失活していることが示された。
- 確認のために、上記ウイルスとDNA / RNA Shieldを混合した試料100μlを未希釈で、10 cmディッシュで調製したTMPRSS2 / Vero細胞に接種し、培養したが、ウイルスの増殖は見られなかった。この実験から、ウイルスとDNA / RNA Shieldを混合した試料では、検出限界未満(2.5×101 viruses/ml)までウイルスが失活していることが示された(データ非掲載)。
- 以上の結果から、DNA / RNA Shieldによって、SARS-CoV-2はほぼ完全に不活化されると考えられる。
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DNA / RNA Shieldで保存した試料からの核酸精製について
DNA / RNA Shieldで保存した試料は、各社より発売されているほとんどのDNAおよびRNA精製キットに適応します。
以下に、試料/抽出物ごとのZymo Research社が推奨するキットをまとめます。製品名をクリックすると製品の詳細をご覧になれます。
試料の種類 | 細胞 (血液、生体液、組織 など) |
ウイルス (血清、血漿 など) |
微生物 (糞便、土壌、環境水 など) |
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抽出物 | |||
DNA | Quick-DNA Plus Kit (カラム法、磁気ビーズ法) |
Quick-DNA Viral Kit (カラム法) |
ZymoBIOMICS DNA Kit (カラム法、磁気ビーズ法) |
RNA | Quick-RNA Miniprep Plus Kit (カラム法) |
Quick-RNA Viral Kit (カラム法) |
ZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit (カラム法) |
DNA / RNA 両方 |
Quick-DNA / RNA Kit (カラム法、磁気ビーズ法) |
Quick-DNA / RNA Viral Kit (カラム法、磁気ビーズ法) |
ZymoBIOMICS DNA / RNA Miniprep Kit (カラム法) |
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DNA / RNA Shieldによる不活化の実績がある病原体の例
バクテリア | ウイルス | 酵母・真核生物 |
---|---|---|
B. subtilis | SARS-CoV-2 | C. albicans |
E. faecalis | Parvovirus | C. neoformans |
E. coli | Chikungunya Virus | S. cerevisiae |
L. fermentum | Dengue Virus | P. malariae |
L. monocytogenes | Ebolavirus | ― |
M. tuberculosis | Herpes Simplex Virus-1 | ― |
P. aeruginosa | Herpes Simplex Virus-2 | ― |
S. enterica | Influenza A | ― |
S. aureus | Rhinovirus | ― |
S. pneumoniae | MERS-coronavirus | ― |
X. fastidiosa | West Nile Virus | ― |
― | Mpox virus | ― |
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ウイルス関連試料におけるDNA / RNA Shieldの使用文献
- "Inactivation of foot-and-mouth disease virus in epithelium samples for safe transport and processing in low-containment laboratories."
Horsington, Jacquelyn, et al., Journal of virological methods, 276, 113770 (2020). - "Exploratory Investigation on the Occurrence, Spatial Distribution, and Risk Factors of Selected Zoonotic Enteropathogens in Davao City Backyard Farms."
Kenneth, P., and Nilo, B., - "Transcriptomic analysis of Macrobrachium rosenbergii (giant fresh water prawn) post-larvae in response to M. rosenbergii nodavirus (MrNV) infection: de novo assembly and functional annotation."
Pasookhush, Phongthana, et al., BMC genomics, 20 (1), 762 (2019). - "Comparing Gut Microbiome and Virome in the Breast Milk-and Formula-fed Late Preterm Infants."
Wang, Zyi, (2019). - "Hepatic IFN-Induced Protein with Tetratricopeptide Repeats Regulation of HCV Infection."
Ishida, Yuji, et al., Journal of Interferon & Cytokine Research, 39 (3), 133 (2019). - "Chikungunya virus vaccine candidates with decreased mutational robustness are attenuated in vivo and have compromised transmissibility."
Carrau, Lucía, et al., Journal of virology, 93 (18), e00775-19 (2019). - "Impact of Pretransplant Donor BK Viruria in Kidney Transplant Recipients."
Tan, Susanna K., et al., The Journal of infectious diseases, 220 (3), 370 (2019). - "Small RNA-Seq Analysis Reveals miRNA Expression Dynamics Across Tissues in the Malaria Vector, Anopheles gambiae."
Bryant, William Bart, et al., G3: Genes, Genomes, Genetics, 9 (5), 1507 (2019). - IL-36γ Is a Key Regulator of Neutrophil Infiltration in the Vaginal Microenvironment and Limits Neuroinvasion in Genital HSV-2 Infection."
Gardner, Jameson K., Alison Swaims-Kohlmeier, and Melissa M. Herbst-Kralovetz, The Journal of Immunology, ji1900280 (2019). - "Associations between soil-transmitted helminthiasis and viral, bacterial, and protozoal enteroinfections: a cross-sectional study in rural Laos."
Chard, Anna N., et al., Parasites & vectors, 12 (1), 216 (2019). - "Detection of Rickettsiae, Borreliae, and Ehrlichiae in Ticks Collected from Walker County, Texas, 2017-2018."
Mendell, Nicole L., et al. Insects, 10 (10), 315 (2019). - "Evaluation of salivary and plasma microRNA expression in patients with Sjögren's syndrome, and correlations with clinical and ultrasonographic outcomes."
Talotta, R., et al., Clin. Exp. Rheumatol., 37 Suppl. 118, S70 (2019). - "Rates of asymptomatic respiratory virus infection across age groups."
Galanti, M., et al., Epidemiology & Infection, 147, (2019). - "Presence of the point mutations Val1016Gly in the voltage-gated sodium channel detected in a single mosquito from Panama."
Murcia, Osiris, et al., Parasites & vectors, 12 (1), 62 (2019). - "Providence virus: An animal virus that replicates in plants or a plant virus that infects and replicates in animal cells?."
Jiwaji, Meesbah, et al., PloS one, 14 (6), e0217494 (2019). - "Unbiased Pathogen Detection and Host Gene Profiling for Conjunctivitis."
Lalitha, Prajna, et al., Ophthalmology, 126 (8), 1090 (2019). - "Longitudinal active sampling for respiratory viral infections across age groups."
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Bennett, Andrew J., et al., Virology, 528, 64 (2019). - "Environmental Contamination and Hygienic Measures After Feline Calicivirus Field Strain Infections of Cats in a Research Facility."
Spiri, Andrea Monika, et al., Viruses, 11 (10), 958 (2019). - "A new bunya-like virus associated with mass mortality of white-clawed crayfish in the wild."
Grandjean, Frederic, et al., Virology, 533, 115 (2019). - "Phenotypic and Genotypic Characterization of West Nile Virus Isolate 2004Hou3."
Ronca, Shannon E., et al., International journal of molecular sciences, 20 (8), 1936 (2019). - "Genome Sequence of a Divergent Avian Metapneumovirus from a Monk Parakeet (Myiopsitta monachus)."
Retallack, Hanna, Susan Clubb, and Joseph L. DeRisi, Microbiol. Resour. Announc., 8 (16), e00284-19 (2019). - "Comparison of Three Different Pretreatment Methods for Blood RNA Extraction."
Zhang, Jiayi, et al., Forensic Science International: Genetics Supplement Series, (2019). - "Wild, insectivorous bats might be carriers of Campylobacter spp."
Hazeleger, Wilma C., et al., PloS one, 13 (1), e0190647 (2018). - "The cytotoxic activity of natural killer cells is suppressed by IL-10+ regulatory T cells during acute retroviral infection."
Littwitz-Salomon, Elisabeth, et al., Frontiers in immunology, 9, 1947 (2018). - "Characterization of the microbiome at the world's largest potable water
reuse facility."
Stamps, Blake Warren, et al., Frontiers in Microbiology, 9, 2435 (2018). - "arcasHLA: high resolution HLA typing from RNA seq."
Orenbuch, Rose, et al., bioRxiv, 479824 (2018). - "A non-invasive method to collect fecal samples from wild birds for microbiome studies."
Knutie, Sarah A., and Kiyoko M. Gotanda., Microbial ecology, 76 (4), 851 (2018). - "IL-36γ induces a transient HSV-2 resistant environment that protects against genital disease and pathogenesis."
Gardner, Jameson K., and Melissa M. Herbst-Kralovetz, Cytokine, 111, 63 (2018). - "Phylogenetic analysis of West Nile Virus in Maricopa County, Arizona: Evidence for dynamic behavior of strains in two major lineages in the American Southwest."
Hepp, Crystal M., et al., PloS one, 13 (11), e0205801 (2018). - "Asymptomatic shedding of respiratory virus among an ambulatory population across seasons."
Birger, Ruthie, et al., mSphere, 3 (4), e00249-18 (2018). - "Asymptomatic summertime shedding of respiratory viruses."
Shaman, Jeffrey, et al., The Journal of infectious diseases, 217 (7), 1074 (2018). - "Methods and systems for isolating and identifying nucleic acid from a plurality of microorganisms and viruses."
Goldberg, Tony L., and Samuel D. Sibley. U.S. Patent, Application No. 15/694,249. - "SMARCA2-regulated host cell factors are required for MxA restriction of influenza A viruses."
Dornfeld, Dominik, et al., Scientific reports, 8 (1), 2092 (2018). - "Molecular and serological survey of lyssaviruses in Croatian bat populations."
Šimić, Ivana, et al., BMC veterinary research, 14 (1), 274 (2018). - "A novel method for extracting nucleic acids from dried blood spots for ultrasensitive detection of low-density Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax infections."
Zainabadi, Kayvan, et al., Malaria journal, 16 (1), 377 (2017). - "AN AFRICAN PERSPECTIVE ON TOSPOVIRUSES."
Karavina, C., and A. Gubba, Journal of Plant Pathology, 99 (1), 5 (2017). - "Etiology of respiratory tract infections in the community and clinic in Ilorin, Nigeria."
Kolawole, Olatunji, et al., BMC research notes, 10 (1), 712 (2017). - "Detection of occult hepatitis C virus infection in patients who achieved a sustained virologic response to direct-acting antiviral agents for recurrent infection after liver transplantation."
Elmasry, Sandra, et al., Gastroenterology, 152 (3), 550 (2017). - "Stability of Zika Virus in Urine: Specimen processing considerations and implications for the detection of RNA targets in urine."
Tan, K. S., et al., Journal of Virological Methods, 248, 66 (2017). - "Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) in dromedary camels, Oman, 2013."
Nowotny, N., Kolodziejek, J., Euro Surveill., 19 (16), 20781 (2014). - "West Nile Virus Positive Blood Donation and Subsequent ntomological Investigation, Austria, 2014."
Kolodziejek, J., et al., PLoS ONE, 10 (5), e0126381 (2015). - "An ultrasensitive reverse transcription polymerase chain reaction assay to detect asymptomatic low-density Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax infections in small volume blood samples."
Adams, M., Joshi, S.N., Mbambo, G., et al., Malar J., 14, 520 (2015). - "High prevalence of asymptomatic malaria infections: a cross-sectional study in rural areas in six departments in Haiti."
Elbadry, M.A., Al-khedery, B., Tagliamonte, M.S., et al., Malar J., 14, 510 (2015). - "Usutu virus, Belgium, 2016."
Garigliany, M., Linden, A., Gilliau, G., et al., Infect. Genet. Evol., 48, 116 (2016). - "Co-circulation of the dengue with chikungunya virus during the 2013 outbreak in the southern part of Lao PDR."
Phommanivong, V., Kanda, S., Shimono, T., et al., Trop. Med. Health., 44, 24 (2016).
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DNA / RNA ShieldのFAQ
Q-1. 組成を教えて下さい。
A-1. 企業秘密のため、組成の開示は行っていません。
Q-2. 不活化の原理を教えて下さい。
A-2. 組成は開示されていませんが、溶解と変性に基づくものとなります。
Q-3. 動物由来の成分を含んでいますか?
A-3. いいえ、含んでいません。Animal-Free製品となります。
Q-4. 溶液の色が黄色くなっていますが、大丈夫でしょうか?
A-4. 問題ありません。光の照射により、溶液が黄色くなることがありますが、製品の品質には影響が無いことを確認しています。
Q-5. 組織を保存する際に、ホモジナイズは必要でしょうか?
A-5. 必要ありません。ただし、保存中に組織が硬くなることがあります。それを避けたい場合、先にホモジナイズしてから保存することも可能です。
Q-6. 精製したDNAやRNAの保存にも使用できますか?
A-6. はい、精製したDNAおよびRNAの保存にも使用可能です。ただし、実験に使用する前には、再度精製を行う必要があります。対象の核酸に応じて、Genomic DNA Clean & Concentrator Kit (#D4010 など)、DNA Clean & Concentrator Kit(#D4013など)、RNA Clean & Concentrator Kit (#R1015など)をご使用下さい。
Q-7. 試験成績書を入手したいのですが。
Q-8. 沈殿が生じている場合でも使用できますか?
A-8. 低温(4℃など)での輸送や保存により、沈殿物が生じることがありますが、試薬の機能性には影響いたしません。沈殿は37℃以上で加熱することで、消失させることができます。
Q-9. 30℃以上で保存した場合のDNA/RNAの保存可能期間を教えて下さい。
A-9. DNA・RNA共に7日間安定的に保存可能であることを検証済みです。
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価格
[在庫・価格 :2024年12月10日 20時55分現在]
[在庫・価格 :2024年12月10日 20時55分現在]
DNA/RNA Shield
文献数: 40
- 商品コード:R1100-50
- メーカー:ZYR
- 包装:50ml
- 価格:¥16,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | DNAもしくは,RNAを含む様々な試料を,安定的に保存するのに適したAll-in-one保存試薬。小包装のサンプルあり。 |
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別包装品 | 別包装品あり | ||||||
法規制等 | |||||||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
掲載カタログ |
ニュース2024年1月合併号 p.14 ニュース2024年11月15日号 p.10
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文献数: 40
- 商品コード:R1100-250
- メーカー:ZYR
- 包装:250ml
- 価格:¥54,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | DNAもしくは,RNAを含む様々な試料を,安定的に保存するのに適したAll-in-one保存試薬。 |
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別包装品 | 別包装品あり | ||||||
法規制等 | |||||||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |||||
掲載カタログ |
ニュース2024年1月合併号 p.14 ニュース2024年11月15日号 p.10
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DNA/RNA Shield (2X concentrate)
文献数: 40
- 商品コード:R1200-25
- メーカー:ZYR
- 包装:25ml
- 価格:¥16,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | DNAもしくは,RNAを含む様々な試料を,安定的に保存するのに適したAll-in-one保存試薬。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
掲載カタログ |
ニュース2024年11月15日号 p.10
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- メーカー:ZYR
- 包装:125ml
- 価格:¥54,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | DNAもしくは,RNAを含む様々な試料を,安定的に保存するのに適したAll-in-one保存試薬。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
掲載カタログ |
ニュース2024年11月15日号 p.10 ニュース2024年1月合併号 p.14
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