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様々な試料からバイアスのない核酸が高収率で得られるキット ZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kits

掲載日情報:2018/06/25 現在Webページ番号:65370

哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水などの広範な試料を,微生物種にほとんど影響することなく溶解できるため,それらの試料中の細菌,真菌類,原生動物,藻類,ウイルス,ミトコンドリアおよび宿主のDNA/RNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキットです。微生物叢およびメタゲノム解析に最適です。

ZymoBIOMICSシリーズの全プロセスの製品構成については,こちらをご覧下さい。
Miniprep Kit以外のスケールのZymoBIOMICS DNA Prep Kitについては,こちらをご覧下さい。

Community Standard DNA抽出

ZymoBIOMICS Microbial Community Standardを4種類の方法でDNA抽出,分析した例

ZymoBIOMICS DNA Mini Kit(#D4300),HMP Protocol(Human Microbiome Project fecal DNA extraction protocol)および他社DNA抽出キット2種類を用いて,ZymoBIOMICS Microbial Community StandardからDNAを抽出,精製した。v3-4領域を標的とするプライマーを用いて,各DNA試料から16S rRNAを増幅し,Illumina-MiSeq(2×250 bp)により解析した。組成のプロファイルは,ZymoBIOMICS Microbial Community Standardに含まれる8種類の異なる細菌種の既知16S rRNA遺伝子に対する単位複製配列解析後の配列数に基づいて決定した。4種類のDNA抽出,精製法で唯一ZymoBIOMICS DNA Mini Kitだけが理論値に近いバイアスのないプロファイルを示した。

ZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kitsの製品ラインナップ

画像をクリックすると拡大図がご覧いただけます。

品名 ZymoBIOMICS
DNA Mini Kit DNA/RNA Mini Kit RNA Mini Kit
商品コード D4300T, D4300 R2002 R2001
操作方法概要 D4300操作方法 R2002操作方法 R2001操作方法
測定
試料
哺乳類
糞便
≦200 mg
土壌 ≦250 mg
植物/
種子
≦200 mg
細胞試料
(細菌/真菌など)
50~100 mg(湿重量)
(細菌:109 cells,酵母:108 cells,哺乳動物細胞:107 cells)
バイオ
フィルム
250μlあるいは水試料をろ過したフィルター
対応微生物 グラム陽性/陰性細菌,真菌類,原生動物および藻類
測定回数 50 preps
核酸の
種類
DNA
RNA
回収率 最大25μg 約100μg
核酸の
長さ
ゲノムDNA 15~20 kb ≧17 nuculeotides
Total RNA ≧17 nuculeotides
適用 ゲノムDNA PCR, アレイ,16S rRNAジーンシークエンシング,
ショットガン・シークエンシング
Total RNA RT-PCR,ハイブリダイゼーション,シークエンシング

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関連製品

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品名 商品コード 包装 製品概要
ZymoBIOMICS Microbial Community Standard D6300 0.75 ml 10種類の不活性化した微生物(細菌および真菌)の混合物。微生物相およびメタゲノミクス研究用。使用回数:10 preps
ZymoBIOMICS Microbial DNA Community Standard D6305 200 ng
(/20 μl)
10種類の不活性化した微生物(細菌および真菌)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相およびメタゲノミクス研究用。
D6306 2,000 ng
(/20 μl)
ZymoBIOMICS PCR PreMix E2056 50 tests 3’末端トランスフェラーゼ活性を有するホットスタートDNAを含め,PCRに必要な試薬の全てを含んだ溶液。細菌ゲノムDNAのコンタミネーションが25μl当たり10コピー数以下であることを検証済み。
E2057 200 tests

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ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kits


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特長

  • ZymoBIOMICS DNA/RNA Mini Kitsには,DNA用(#D4300T, #D4300),RNA用(#R2001)および全核酸(DNAおよびRNA)用(#R2002)の3種類があり,目的に応じて最適なキットが選択できます。
  • 迅速かつ簡潔な精製方法を採用し,PCR阻害物質を除去するZymo-Spin Ⅲ-HRC Spin FilterなどZymo社独自のSpinカラム技術により,高品質で阻害物質を含まないDNAまたはtotal RNA (17 nt以上)が得られます。
  • 幅広い試料に対応します。
  • グラム陽性/陰性バクテリア,真菌類,原生動物,藻類,ウイルスなどの種別に関わらず,効果的に溶解することができます。
  • RNA用(#R2001)およびDNA/RNA用(#R2002)の製品は,DNase Iを含み,DNA-freeのRNAが得られます。
  • ZymoBIOMICS DNA/RNA Mini Kit(#R2002)では,全核酸の単離(Co-Purification)と,DNAおよびRNAのそれぞれを単離(Parallel Purification)の2種類のプロトコルに対応しています。
  • DNA用(#D4300)製品は,16S rRNA遺伝子のqPCRにより,キットに微生物の混入が無いことを確認しています(溶出液1μl中にバクテリアゲノムのコピー数が3以下)。

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使用例

■(1)ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit(#D4300

D4300使用例

糞便80 mgからZymoBIOMICS DNA Mini Kitと他社(A, B, C)DNA抽出キットを用いて単離したDNAの比較。各キットで100μlから溶出したDNA 6μlを1.0% (w/v)アガロース/エチジウムブロミドゲルで各3回分析した。Lは1 kbのラダーを示す。

D4300使用例2

ZymoBIOMICS DNA Mini Kitでは,特に阻害物質の多い試料を用いた場合でも阻害物質を含まないDNAを得ることができる。ZymoBIOMICS DNA Mini Kitおよび他社(A,B,C社)DNA抽出キットを用いて回収した溶出液をリアルタイムPCRで評価した。各キットの溶出液の10%または35%を用いて,PCR阻害物質の残存を検証した。各試料にはBrettanomyces DNA 25 ngを添加した。DNAの増幅速度の遅延または,非増幅の結果は,PCR阻害物質の除去が不十分であることを示す。

D4300使用例3

4種類のDNA抽出法(上図参照)を用いてヒト糞便200μlより抽出したDNAをPBS (10 % m/v)に懸濁し,16S rRNAジーンシークエンシングを用いて分析した。ZymoBIOMICS DNA Mini Kitを用いて得られたDNAにおいては,収率向上が顕著であり(上図),またグラム陽性菌の存在比が大きいことがわかる(下図)。

■(2)ZymoBIOMICS DNA/RNA Mini Kit(#R2002

R2002使用例

左図:ヒトの糞便中の全核酸(DNAおよびRNA)をZymoBIOMICS DNA/RNA Mini Kit (#R2002)を用いて単離し,溶出液を1% TAE/アガロース/EtBr ゲルで分離した。Aは1 kbのラダー(Zymo Research)を示す。
右図:Agilent 2200 TapeStationにより分析した結果, ZymoBIOMICS DNA/RNA Mini Kitにより単離されたDNAおよびRNAは,高度にintactな状態であることがわかる。

■(3)ZymoBIOMICS RNA Mini Kit(#R2001

R2001使用例

ZymoBIOMICS RNA Mini Kit(右)およびA社RNA抽出キット(左)を用いてヒトの糞便から単離されたRNAを,Agilent 2200 TapeStationによって比較分析した結果。
ZymoBIOMICS RNA Mini Kitを用いて単離されたRNAは,A社RNA抽出キットを用いて単離されたRNAに比べて品質が高いことがわかる。

R2001使用例2

左図:ヒトの糞便から,ZymoBIOMICS RNA Mini Kitまたは他社製品により単離されたRNAを,RT-PCRおよびPCRで増幅後(約150 bpフラグメント)にAgilent 2200 TapeStationによって分析した結果。PCRにおけるバンドの欠如により,得られたRNAがDNAフリーであることがわかる。
右図:Zymo-Spin Ⅲ-HRC Spin Filterの使用時または不使用時のRNAの増幅速度の比較。増幅サイクルの速さの違いは,PCRの阻害物質が完全に除去されていることを示す。

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キット内容

キットの商品コードをクリックすると,直接価格表がご覧いただけます。キットコンポーネントの●をクリックすると,単品の価格表がご覧いただけます。

品名 ZymoBIOMICS
DNA Mini Kit DNA/RNA Mini Kit RNA Mini Kit
商品コード D4300T, D4300 R2002 R2001
DNA/RNA shield
ZR BashingBead lysis tubes
RNA lysis buffer
DNA/RNA lysis buffer
ZymoBIOMICS lysis solution
RNA prep buffer
DNA/RNA prep buffer
ZymoBIOMICS HRC prep solution
ZymoBIOMICS DNA binding buffer
RNA wash buffer
DNA/RNA wash buffer
ZymoBIOMICS DNA wash buffer 1/2
DNase/RNase-free water
ZymoBIOMICS DNase/RNase free water
DNase Ⅰ Set
(DNase Ⅰ& DNA digestion buffer)
Zymo-Spin Ⅲ-HRC spin filter
Zyom-Spin Ⅲ-F spin filter
Spin-Away filter
Zymo-Spin ⅢCG column
Zymo-Spin ⅡC-Z column
Collection tube

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価格

[在庫・価格 :2020年03月31日 15時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (5preps)
- 0
説明文
哺乳動物の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢(マイクロバイオーム,マイクロバイオータ),腸内細菌(腸内フローラ)研究などに有用。測定回数:5 preps,Collection tube使用。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

製品記事 フナコシニュース連載企画 「FRONTIERS」 Zymo Research 社の紹介
ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
微生物叢(マイクロバイオーム)研究用製品/土壌・糞便・植物など環境試料からの核酸抽出キット
関連記事 [ZYR]核酸精製・DNAメチル化検出キット お試しサンプル品
ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (50 preps)
10日程度  0
説明文
哺乳動物の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢(マイクロバイオーム,マイクロバイオータ),腸内細菌(腸内フローラ)研究などに有用。測定回数:50 preps,Collection tube使用。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICSシリーズ(微生物叢研究用試薬)
ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
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ZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kit (50preps)
- 0
説明文
哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNA/RNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキット。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICSシリーズ(微生物叢研究用試薬)
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ZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit (50preps)
10日程度  0
説明文
哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からRNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキット。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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[在庫・価格 :2020年03月31日 15時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (5preps)

文献数:0

  • 商品コード:D4300T
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥8,000
  • 在庫:1個
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 哺乳動物の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢(マイクロバイオーム,マイクロバイオータ),腸内細菌(腸内フローラ)研究などに有用。測定回数:5 preps,Collection tube使用。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (50 preps)

文献数:0

  • 商品コード:D4300
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥57,000
  • 在庫:無(発注済)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 哺乳動物の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢(マイクロバイオーム,マイクロバイオータ),腸内細菌(腸内フローラ)研究などに有用。測定回数:50 preps,Collection tube使用。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
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ZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kit (50preps)

文献数:0

  • 商品コード:R2002
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥106,000
  • 在庫:1個
  • 納期:-
  • 法規制等:取扱注意

説明文 哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNA/RNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキット。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit (50preps)

文献数:0

  • 商品コード:R2001
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥83,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:取扱注意

説明文 哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からRNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキット。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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