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ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
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ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
様々な試料からバイアスのないゲノムDNAが高収率で得られるキット<マイクロバイオーム研究用> ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:65463
哺乳類の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水などの広範な試料を,微生物種にほとんど影響することなく溶解できるため,それらの試料中の細菌,真菌類,原生動物,藻類,ウイルス,ミトコンドリアおよび宿主のDNAをバイアスなく,かつ効率的に単離できるキットです。qPCRや次世代シークエンシンサー(NGS)を用いた微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム),腸内細菌(腸内フローラ)研究およびメタゲノム解析などに最適です。

ZymoBIOMICS Microbial Community Standardを4種類の方法でDNA抽出,分析した例
ZymoBIOMICS DNA Mini Kit(#D4300),HMP Protocol(Human Microbiome Project fecal DNA extraction protocol)および他社DNA抽出キット2種類を用いて,ZymoBIOMICS Microbial Community StandardからDNAを抽出,精製した。v3-4領域を標的とするプライマーを用いて,各DNA試料から16S rRNAを増幅し,Illumina-MiSeq(2×250 bp)により解析した。組成のプロファイルは,ZymoBIOMICS Microbial Community Standardに含まれる8種類の異なる細菌種の既知16S rRNA遺伝子に対する単位複製配列解析後の配列数に基づいて決定した。4種類のDNA抽出,精製法で唯一ZymoBIOMICS DNA Mini Kitだけが理論値に近いバイアスのないプロファイルを示した。
追加しました。
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2019/12/10
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH(ZYR)
- ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズの製品ラインナップ
- ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
- ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
- 特長
- 使用例
- Application Note
- キット内容
- 価格
- 微生物叢研究を総合的にサポート
ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズの製品ラインナップ
画像をクリックすると拡大図がご覧いただけます。
品名 | ZymoBIOMICS DNA | |||||
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Microprep Kit | Miniprep Kit | 96 Kit | 96 MagBead Kit | |||
商品コード | D4301 | D4300 D4300T | D4303 D4307 D4309 | D4302 D4306 D4308 | ||
使用回数 | 50 preps | 50 preps | 2×96 preps | 2×96 preps | ||
操作方法概要 |
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抽出試料 | 哺乳類糞便 | ≦100 mg | ≦200 mg | ≦100 mg | ||
土壌 | ≦100 mg | ≦250 mg | ≦100 mg | ≦200 mg | ||
細胞 | 湿重量 | 5~20 mg | 50~100 mg | 5~20 mg | 5~20 mg | |
細菌 | 2×108 cells | 1×109 cells | 1×108 cells | 2×108 cells | ||
酵母 | 2×107 cells | 1×108 cells | 1×107 cells | 2×107 cells | ||
哺乳動物 | 2×106 cells | 1×107 cells | 1×106 cells | 2×106 cells | ||
水,スワブ試料 | 250μl,あるいは水試料をろ過したフィルター | |||||
DNA/RNA Sheild 保存試料* | 250μl | 250μl | 200μl | 250μl | ||
抽出されるDNA | 陽性/陰性細菌,真菌類,原生動物,藻類,宿主,ウイルス,ミトコンドリアなど | |||||
DNA結合量 | 最大5μg | 最大25μg | 最大5μg | 最大10μg | ||
精製DNAサイズ | 平均15~20 kb | |||||
適用 | PCR, アレイ,16S rRNAジーンシークエンシング,ショットガン・シークエンシング |
* DNA/RNA Sheild中に10%(v/v)の試料を保存している場合
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ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
(詳細はこちらをクリックして下さい。)
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特長
- 迅速かつ単純な精製方法により,高品質で阻害物質を含まないDNAが得られます。
- 幅広い試料に対応します。
- グラム陽性/陰性バクテリア,真菌類,原生動物,藻類,ウイルスなどの種別に関わらず,効果的に溶解することができます。
- ZymoBIOMICS DNA Kitシリーズには,試料の数や重量に応じて4種類のキットがあり,目的に応じて最適なキットが選択できます。
- 16S rRNA遺伝子のqPCRにより,キットに微生物の混入が無いことを確認しています(溶出液1μl中にバクテリアゲノムのコピー数が3以下)。
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使用例
ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit(#D4300)

糞便80 mgからZymoBIOMICS DNA Mini Kitと他社(A, B, C)DNA抽出キットを用いて単離したDNAの比較。各キットで100μlから溶出したDNA 6μlを1.0% (w/v)アガロース/エチジウムブロミドゲルで各3回分析した。L:1 kb ladder

ZymoBIOMICS DNA Mini Kitでは,特にPCR阻害物質の多い試料を用いた場合でも阻害物質を含まないDNAを得ることができる。
ZymoBIOMICS DNA Mini Kitおよび他社(A,B,C社)DNA抽出キットを用いてPCR阻害物質を多く含む試料から回収した溶出液のPCRへの影響をリアルタイムPCRで評価した。
各キットの溶出液が10%または35%となるように,Brettanomyces DNAを25 ng含む反応液に添加し、PCR阻害物質の残存を検証した。BrettanomycesのDNAの増幅速度の遅延または非増幅の結果は,PCR阻害物質の除去が不十分であることを示す。

4種類のDNA抽出法(上図参照)を用いてヒト糞便200μlより抽出したDNAをPBS (10 % m/v)に懸濁し,16S rRNA遺伝子のシークエンシングを用いて分析した。ZymoBIOMICS DNA Mini Kitを用いて得られたDNAにおいては,収率向上が顕著であり(上図),またグラム陽性菌の存在比が大きいことがわかる(下図)。
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kit(#D4302, D4306, D4308)

左図:阻害物質を多量に含む試料からのDNAの回収の比較
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitおよび他社競合品Aを用いてPCR阻害物を多く含む試料から回収した溶出液のPCRへの影響をリアルタイムPCRにより評価した。反応液量は10%(緑色)の溶出液および35%(黄色)の溶出液を含み,Brettanomyces DNAを10 ng添加してある。BrettanomycesのDNAの増幅遅延は阻害物質除去効率が低いことによるPCRの阻害を示す(N=8)。
右図:ZymoBIOMICS 96 Magbead DNA Kit を用いたE. coliおよびH. pyloriからのDNAの効率的な抽出
1×106個の志賀毒素産生大腸菌を添加した糞便およびH. pylori を添加した糞便を段階希釈し,各試料からZymoBIOMICS 96 Magbead DNA Kitを用いて抽出したDNAをqPCRにより増幅した(N=8)。結果,希釈率1000:1でも効果的なDNA精製およびqPCRによる増幅が行われたことが示された。

DNA回収量の比較
80 mgの糞便を,各製品のプロトコルに従って処理した。各DNAは,100μlの ZymoBIOMICS DNase/RNase Free Waterを用いて溶出し,その6μlを1.0%(w/v)のアガロース/エチジウムブロミドゲル中で分析した(N=3)。L:1 kb ladder

左図:自動液体ハンドリングシステムとマニュアル操作よってDNA精製した際の収量の比較
分光光度計により,ヒト糞便サンプル20 mgからZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitを用いてDNA収量を測定した(N=2)。結果,自動液体ハンドラーでDNA単離を行った場合では均一で再現性の高い収量が得られた。
右図:ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitと競合他社(Supplier A)を用いて,20 mgの糞便から精製したDNAのA260 / 230値の比較
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitを用いて得られた精製DNAはA260 / 230値≧1.80で,他社Aの製品を用いて得られた精製DNAと比較して高品質なDNAが得られることが示された。

液体ハンドラーを標準96ウェルプレートと一緒に用いて精製したDNAの交差汚染の評価
プレートを,ZymoBIOMICS Microbial Community Standards 1,HeLa細胞およびS. cerevisiae細胞の交互の列を用いてセットアップし(上図上部参照),液体ハンドリングプラットフォーム上でDNAを同時に精製した。細菌16S遺伝子,ヒトLINE遺伝子および真菌ITS遺伝子を標的とするプライマーセットを用いた定量的PCRにより試料を評価した(N=2)。その結果,液体ハンドラーを標準96ウェルプレートと一緒に用いて精製したDNAでは交差汚染は検出できなかった。
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Application Note
フライヤーの画面をクリックするとPDFファイルがダウンロードできます。
「Automated Microbiome-grade DNA Extraction on the Hamilton Microlab® STAR™」

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キット内容
キットの商品コードをクリックすると,直接価格表がご覧いただけます。キットコンポーネントの●をクリックすると,単品の価格表がご覧いただけます。
品名 | ZymoBIOMICS DNA | |||||||
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Microprep Kit | Miniprep Kit | 96 Kit | 96 MagBead Kit | |||||
商品コード | D4301(D4305) | D4300,D4300T(D4304) | D4303 | D4307 | D4309 | D4302 | D4306 | D4308 |
ZR BashingBead lysis tube | ●(-) | ●(-) | - | - | ● | - | - | ● | ZR BashingBead lysis rack | - | - | ● | - | - | ● | - | - |
ZymoBIOMICS lysis solution | ●(-) | ●(-) | ● | - | ● | ● | - | ● |
ZymoBIOMICS DNA binding buffer | ● | ● | ● | ● | ● | - | - | - |
ZymoBIOMICS MagBinding buffer | - | - | - | - | - | ● | ● | ● |
ZymoBIOMICS DNA wash buffer 1/2 | ● | ● | ● | ● | ● | - | - | - |
ZymoBIOMICS MagWash 1/2 | - | - | - | - | - | ● | ● | ● |
ZymoBIOMICS DNase/RNase-free water | ● | ● | ● | ● | ● | ● | ● | ● |
ZymoBIOMICS HRC prep solution | ● | ● | ● | ● | ● | - | - | - |
Zyom-Spin Ⅲ-F spin filter | ● | ● | - | - | - | - | - | - |
Zymo-Spin Ⅱ-μHRC spin filter | ● | - | - | - | - | - | - | - |
Zymo-Spin Ⅲ-HRC spin filter | - | ● | - | - | - | - | - | - |
96-well block | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
Silicon-A-HRC plate | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
Zymo-Spin Ⅰ-96-Z plate | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
Cover foil | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
ZymoBIOMICS MagBinding beads | - | - | - | - | - | ● | ● | ● |
Zymo-Spin ⅠC-Z column | ● | - | - | - | - | - | - | - |
Zymo-Spin ⅡC-Z column | - | ● | - | - | - | - | - | - |
Collection tubes | ● | ● | - | - | - | - | - | - |
Collection plate | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
Elution plate | - | - | ● | ● | ● | - | - | - |
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価格
[在庫・価格 :2021年04月17日 00時13分現在]
詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (50 prep) |
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ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps) |
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ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (5preps) |
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (50 preps) |
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps) |
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[在庫・価格 :2021年04月17日 00時13分現在]
ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (50 prep)
文献数:0
- 商品コード:D4301
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥57,000
- 在庫:無(発注済)
- 納期:ご照会下さい ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 |
哺乳動物の糞便,土壌,植物/種子,細菌/真菌細胞,バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢(マイクロバイオーム,マイクロバイオータ),腸内細菌(腸内フローラ)研究などに有用。測定回数:50 preps,Collection tube使用。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
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- 商品コード:D4305
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥39,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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- 商品コード:D4300T
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥8,000
- 在庫:無(発注済)
- 納期:ご照会下さい ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
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- 商品コード:D4300
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥57,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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文献数:0
- 商品コード:D4304
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥39,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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- 商品コード:D4303
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- 包装:1kit
- 価格:¥179,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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- 商品コード:D4307
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥120,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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- 商品コード:D4309
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥179,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
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- 商品コード:D4302
- メーカー:ZYR
- 包装:1kit
- 価格:¥182,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:取扱注意
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- メーカー:ZYR
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- 価格:¥123,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:取扱注意
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- 価格:¥182,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
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掲載カタログ |
ニュース2020年2月15日号 p.8
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微生物叢研究を総合的にサポート

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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。