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ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
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ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
様々な試料からバイアスのないゲノムDNAが高収率で得られるキット＜マイクロバイオーム研究用＞ ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズ
掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：65463
哺乳類の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水などの広範な試料を，微生物種にほとんど影響することなく溶解できるため，それらの試料中の細菌，真菌類，原生動物，藻類，ウイルス，ミトコンドリアおよび宿主のDNAをバイアスなく，かつ効率的に単離できるキットです。qPCRや次世代シークエンシンサー（NGS）を用いた微生物叢（マイクロバイオータ，マイクロバイオーム），腸内細菌（腸内フローラ）研究およびメタゲノム解析などに最適です。
ZymoBIOMICS Microbial Community Standardを4種類の方法でDNA抽出，分析した例
ZymoBIOMICS DNA Mini Kit(#D4300)，HMP Protocol（Human Microbiome Project fecal DNA extraction protocol）および他社DNA抽出キット2種類を用いて，ZymoBIOMICS Microbial Community StandardからDNAを抽出，精製した。v3-4領域を標的とするプライマーを用いて，各DNA試料から16S rRNAを増幅し，Illumina-MiSeq（2×250 bp）により解析した。組成のプロファイルは，ZymoBIOMICS Microbial Community Standardに含まれる8種類の異なる細菌種の既知16S rRNA遺伝子に対する単位複製配列解析後の配列数に基づいて決定した。4種類のDNA抽出，精製法で唯一ZymoBIOMICS DNA Mini Kitだけが理論値に近いバイアスのないプロファイルを示した。
追加しました。
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2019/12/10
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH（ZYR）
- ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズの製品ラインナップ
- ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
- ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
- 特長
- 使用例
- Application Note
- キット内容
- 価格
- 微生物叢研究を総合的にサポート
ZymoBIOMICS DNA Prep Kitシリーズの製品ラインナップ
画像をクリックすると拡大図がご覧いただけます。
| 品名 | ZymoBIOMICS DNA | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Microprep Kit | Miniprep Kit | 96 Kit | 96 MagBead Kit | |||
| 商品コード | D4301 | D4300 D4300T | D4303 D4307 D4309 | D4302 D4306 D4308 | ||
| 使用回数 | 50 preps | 50 preps | 2×96 preps | 2×96 preps | ||
| 操作方法概要 |
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| 抽出試料 | 哺乳類糞便 | ≦100 mg | ≦200 mg | ≦100 mg | ||
| 土壌 | ≦100 mg | ≦250 mg | ≦100 mg | ≦200 mg | ||
| 細胞 | 湿重量 | 5～20 mg | 50～100 mg | 5～20 mg | 5～20 mg | |
| 細菌 | 2×108 cells | 1×109 cells | 1×108 cells | 2×108 cells | ||
| 酵母 | 2×107 cells | 1×108 cells | 1×107 cells | 2×107 cells | ||
| 哺乳動物 | 2×106 cells | 1×107 cells | 1×106 cells | 2×106 cells | ||
| 水，スワブ試料 | 250μl，あるいは水試料をろ過したフィルター | |||||
| DNA/RNA Sheild 保存試料* | 250μl | 250μl | 200μl | 250μl | ||
| 抽出されるDNA | 陽性／陰性細菌，真菌類，原生動物，藻類，宿主，ウイルス，ミトコンドリアなど | |||||
| DNA結合量 | 最大5μg | 最大25μg | 最大5μg | 最大10μg | ||
| 精製DNAサイズ | 平均15～20 kb | |||||
| 適用 | PCR, アレイ，16S rRNAジーンシークエンシング，ショットガン・シークエンシング | |||||
* DNA/RNA Sheild中に10％（v/v）の試料を保存している場合
追加しました。
ZymoBIOMICSとZymoBIOMICS DNA Kits
（詳細はこちらをクリックして下さい。）
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特長
- 迅速かつ単純な精製方法により，高品質で阻害物質を含まないDNAが得られます。
- 幅広い試料に対応します。
- グラム陽性／陰性バクテリア，真菌類，原生動物，藻類，ウイルスなどの種別に関わらず，効果的に溶解することができます。
- ZymoBIOMICS DNA Kitシリーズには，試料の数や重量に応じて4種類のキットがあり，目的に応じて最適なキットが選択できます。
- 16S rRNA遺伝子のqPCRにより，キットに微生物の混入が無いことを確認しています（溶出液1μl中にバクテリアゲノムのコピー数が3以下）。
追加しました。
使用例
ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit（#D4300）
糞便80 mgからZymoBIOMICS DNA Mini Kitと他社（A, B, C）DNA抽出キットを用いて単離したDNAの比較。各キットで100μlから溶出したDNA 6μlを1.0% (w/v)アガロース／エチジウムブロミドゲルで各3回分析した。L：1 kb ladder
ZymoBIOMICS DNA Mini Kitでは，特にPCR阻害物質の多い試料を用いた場合でも阻害物質を含まないDNAを得ることができる。
ZymoBIOMICS DNA Mini Kitおよび他社（A，B，C社）DNA抽出キットを用いてPCR阻害物質を多く含む試料から回収した溶出液のPCRへの影響をリアルタイムPCRで評価した。
各キットの溶出液が10％または35％となるように，Brettanomyces DNAを25 ng含む反応液に添加し、PCR阻害物質の残存を検証した。BrettanomycesのDNAの増幅速度の遅延または非増幅の結果は，PCR阻害物質の除去が不十分であることを示す。
4種類のDNA抽出法（上図参照）を用いてヒト糞便200μlより抽出したDNAをPBS (10 % m/v)に懸濁し，16S rRNA遺伝子のシークエンシングを用いて分析した。ZymoBIOMICS DNA Mini Kitを用いて得られたDNAにおいては，収率向上が顕著であり（上図），またグラム陽性菌の存在比が大きいことがわかる（下図）。
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kit（#D4302, D4306, D4308）
左図：阻害物質を多量に含む試料からのDNAの回収の比較
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitおよび他社競合品Aを用いてPCR阻害物を多く含む試料から回収した溶出液のPCRへの影響をリアルタイムPCRにより評価した。反応液量は10％（緑色）の溶出液および35％（黄色）の溶出液を含み，Brettanomyces DNAを10 ng添加してある。BrettanomycesのDNAの増幅遅延は阻害物質除去効率が低いことによるPCRの阻害を示す（N=8）。
右図：ZymoBIOMICS 96 Magbead DNA Kit を用いたE. coliおよびH. pyloriからのDNAの効率的な抽出
1×106個の志賀毒素産生大腸菌を添加した糞便およびH. pylori を添加した糞便を段階希釈し，各試料からZymoBIOMICS 96 Magbead DNA Kitを用いて抽出したDNAをqPCRにより増幅した（N=8）。結果，希釈率1000：1でも効果的なDNA精製およびqPCRによる増幅が行われたことが示された。
DNA回収量の比較
80 mgの糞便を，各製品のプロトコルに従って処理した。各DNAは，100μlの ZymoBIOMICS DNase/RNase Free Waterを用いて溶出し，その6μlを1.0％（w/v）のアガロース／エチジウムブロミドゲル中で分析した（N=3）。L：1 kb ladder
左図：自動液体ハンドリングシステムとマニュアル操作よってDNA精製した際の収量の比較
分光光度計により，ヒト糞便サンプル20 mgからZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitを用いてDNA収量を測定した（N＝2）。結果，自動液体ハンドラーでDNA単離を行った場合では均一で再現性の高い収量が得られた。
右図：ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitと競合他社（Supplier A）を用いて，20 mgの糞便から精製したDNAのA260 / 230値の比較
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA Kitを用いて得られた精製DNAはA260 / 230値≧1.80で，他社Aの製品を用いて得られた精製DNAと比較して高品質なDNAが得られることが示された。
液体ハンドラーを標準96ウェルプレートと一緒に用いて精製したDNAの交差汚染の評価
プレートを，ZymoBIOMICS Microbial Community Standards 1，HeLa細胞およびS. cerevisiae細胞の交互の列を用いてセットアップし（上図上部参照），液体ハンドリングプラットフォーム上でDNAを同時に精製した。細菌16S遺伝子，ヒトLINE遺伝子および真菌ITS遺伝子を標的とするプライマーセットを用いた定量的PCRにより試料を評価した（N=2）。その結果，液体ハンドラーを標準96ウェルプレートと一緒に用いて精製したDNAでは交差汚染は検出できなかった。
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Application Note
フライヤーの画面をクリックするとPDFファイルがダウンロードできます。
「Automated Microbiome-grade DNA Extraction on the Hamilton Microlab® STAR™」
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キット内容
キットの商品コードをクリックすると，直接価格表がご覧いただけます。キットコンポーネントの●をクリックすると，単品の価格表がご覧いただけます。
| 品名 | ZymoBIOMICS DNA | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Microprep Kit | Miniprep Kit | 96 Kit | 96 MagBead Kit | |||||
| 商品コード | D4301（D4305） | D4300,D4300T（D4304） | D4303 | D4307 | D4309 | D4302 | D4306 | D4308 |
| ZR BashingBead lysis tube | ●（－） | ●（－） | － | － | ● | － | － | ● | ZR BashingBead lysis rack | － | － | ● | － | － | ● | － | － |
| ZymoBIOMICS lysis solution | ●（－） | ●（－） | ● | － | ● | ● | － | ● |
| ZymoBIOMICS DNA binding buffer | ● | ● | ● | ● | ● | － | － | － |
| ZymoBIOMICS MagBinding buffer | － | － | － | － | － | ● | ● | ● |
| ZymoBIOMICS DNA wash buffer 1/2 | ● | ● | ● | ● | ● | － | － | － |
| ZymoBIOMICS MagWash 1/2 | － | － | － | － | － | ● | ● | ● |
| ZymoBIOMICS DNase/RNase-free water | ● | ● | ● | ● | ● | ● | ● | ● |
| ZymoBIOMICS HRC prep solution | ● | ● | ● | ● | ● | － | － | － |
| Zyom-Spin Ⅲ-F spin filter | ● | ● | － | － | － | － | － | － |
| Zymo-Spin Ⅱ-μHRC spin filter | ● | － | － | － | － | － | － | － |
| Zymo-Spin Ⅲ-HRC spin filter | － | ● | － | － | － | － | － | － |
| 96-well block | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
| Silicon-A-HRC plate | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
| Zymo-Spin Ⅰ-96-Z plate | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
| Cover foil | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
| ZymoBIOMICS MagBinding beads | － | － | － | － | － | ● | ● | ● |
| Zymo-Spin ⅠC-Z column | ● | － | － | － | － | － | － | － |
| Zymo-Spin ⅡC-Z column | － | ● | － | － | － | － | － | － |
| Collection tubes | ● | ● | － | － | － | － | － | － |
| Collection plate | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
| Elution plate | － | － | ● | ● | ● | － | － | － |
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価格
[在庫・価格 ：2021年09月28日 23時09分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (50 prep) |
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ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (5preps) |
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (50 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps) |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2021年09月28日 23時09分現在]
ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (50 prep)
文献数：0
- 商品コード：D4301
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥57,000
- 在庫：1個
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：50 preps，Collection tube使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年7月15日号 p.4
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ZymoBIOMICS DNA Micro Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4305
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥39,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (5preps)
文献数：0
- 商品コード：D4300T
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥8,000
- 在庫：1個
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：5 preps，Collection tube使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (50 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4300
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥57,000
- 在庫：3個以上
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：50 preps，Collection tube使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年7月15日号 p.4
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ZymoBIOMICS DNA Mini Kit (lysis Matrix Not Included) (50 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4304
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥39,000
- 在庫：2個
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps)
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- 商品コード：D4303
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥179,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年7月15日号 p.4
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4307
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥120,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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ZymoBIOMICS-96 DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4309
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥179,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年7月15日号 p.4
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Rack) (2x96 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4302
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥182,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年7月15日号 p.4
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微生物叢（マイクロバイオーム）研究用製品／土壌・糞便・植物など環境試料からの核酸抽出キット ZymoBIOMICSシリーズ（微生物叢研究用試薬） Zymo Research社MagBead / MagPrep Kitシリーズ |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (lysis Matrix Not Included) (2x96 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4306
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥123,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | 取扱注意 | ||
| 保存条件 | 法規備考 | ||
| 掲載カタログ |
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ZymoBIOMICS-96 Magbead DNA Kit (includes BashingBead Lysis Tubes) (2x96 preps)
文献数：0
- 商品コード：D4308
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥182,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：取扱注意
| 説明文 |
哺乳動物の糞便，土壌，植物／種子，細菌／真菌細胞，バイオフィルムや水など広範な試料からDNAを単離・抽出・精製するキット。微生物叢（マイクロバイオーム，マイクロバイオータ），腸内細菌（腸内フローラ）研究などに有用。測定回数：2×96 preps，Collection plate使用。 |
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| 法規制等 | 取扱注意 | ||
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| 掲載カタログ |
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。