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新型コロナウイルス感染症パンデミック下におけるウイルスRNA修飾の研究支援ツール ウイルスのRNA修飾および宿主由来RNAの研究用製品（EpiGentek社）

掲載日情報：2022/04/22 現在Webページ番号：70234

エピジェンテックグループ /
Epigentek Group Inc.
[メーカー略称：EPG]

新型コロナウイルス感染症（COVID-19）によるパンデミックな状況下で、ウイルスRNAの多様でエピジェネティックな変化とウイルス自体の回復や感染力増加との関連性、および宿主の細胞や組織由来のRNAの解析を通して病原体が宿主細胞機能にどう影響するかについての研究に注目が高まっています。EpiGentek社は、そのワークフローの中の個々のステップおける有用な製品を取りそろえています。

※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

ウイルスRNA修飾および宿主RNA由来RNAの解析ワークフロー

ウイルスRNA修飾および宿主RNA由来RNAの解析ワークフロー

RNAの抽出 核の抽出 m<sup>6</sup>Aメチラーゼ／デメチラーゼ活性の測定 グローバルm<sup>6</sup>A/5mcの定量 MeRIPおよびm<sup>6</sup>A-seqアッセイ
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m6A RNAサイクル

m6A RNAの形成は、メチル基転移酵素（METTL酵素）で部分的に構成されているMulti-protein methyltransferase複合体によって媒介されます。哺乳類におけるこれらのメチラーゼ「ライター」および関連するデメチラーゼ「イレーサー」の最近の発見により、m6A修飾の可逆性が明らかにされました。メチル基は、METTL3/14ヘテロダイマーによってアデノシン（A）残基のN-6位置に化学的に付加され、N6-メチルアデノシン（m6A）を形成します。FTOを介した酸化的脱メチル化によって、m6Aは段階的にN6-ヒドロキシメチルアデノシン（hm6A）にまず変換され、次にN6-ホルミルアデノシン（f6A）に変換されてから、最終的にAに戻ります。

m<sup>6</sup>A RNAサイクル

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m6A RNAサイクル

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新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）パンデミック下におけるm6Aメチル化研究の重要性

ヒトコロナウイルスなどの特定のウイルスのライフサイクルにおいて転写後修飾は、重要な役割を果たすことが知られています。特にm6A、m6Am、2'-O-meなどのアデノシンメチル化は、ウイルスのキャップ構造、ウイルス複製、自然免疫経路、自然免疫応答を調節することにより、特定のRNAウイルスの生存率に影響を与えることが報告されています1。さらに、コロナウイルスおよび他のウイルス種のメンバーは、アデノシン残基を自己メチル化し、免疫回避を促進するために、独自のメチルトランスフェラーゼをコードしています。

SARS-CoV-2の構造

新型コロナウイルス（SARS-CoV-2の構造）2

アデノシンメチル化によるウイルスのライフサイクル調節ダイナミクスの解明は、新しい抗ウイルス療法の設計と開発を促進します。N6-メチルアデノシン、またはm6Aは、真核生物のRNA修飾において最も一般的に見られ、total RNAメチル化の80％以上を占め、構造、スプライシング、局在化、翻訳、安定性、および代謝回転のリボ核酸生物学のあらゆる面に影響を及ぼします3。m6Aは、ウイルス種と宿主細胞の種類に応じてプロウイルス活性と抗ウイルス活性の両方を示します4。SARS-CoV-2のRNAゲノムには、GGACU（T）、GGACA、GGACCなどのRNAメチラーゼ複合体METTL3/14によるm6A修飾の特定の配列モチーフが存在し、50以上の潜在的なm6A部位が含まれています。その結果、SARS-CoV-2 RNAの全アデノシンの＞0.64％、または全塩基の0.18％がm6Aとなる可能性があります。

m6Aの獲得または喪失は、RNAウイルスに重大な機能変化をもたらし、宿主細胞の融合／侵入、複製、感染、病原体強度、および免疫回避を変化させる場合があります。また、宿主抵抗性に関与する宿主細胞のm6Aエピトランスクリプトームも、ウイルス感染後に変化することも考えられます。したがって、ウイルスおよび宿主のm6A修飾の研究は、SARS-CoV-2感染に影響を与える要因を明らかにし、COVID-19の治療のための新しい標的を特定するのに役立つことが期待されます。

参考文献

  1. Gonzales-van Horn, S.R. and Sarnow, P., "Making the Mark: The Role of Adenosine Modifications in the Life Cycle of RNA Viruses.", Cell Host Microbe., 21(6), 661～669 (2017). [PMID：28618265]
  2. Kim, D., et al., "The Architecture of SARS-CoV-2 Transcriptome.", Cell, 181(4), 914～921 (2020). [PMID：32330414]
  3. Zaccara, S., et al., "Reading, writing and erasing mRNA methylation.", Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 20(10), 608～624 (2019). [PMID：31520073]
  4. Dang, W., et al., "N6-Methyladenosine and Viral Infection.", Front Microbiol., 10, 417 (2019). [PMID：30891023]

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RNAの抽出

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抽出物 品名 製品イメージ 商品コード 製品概要
ウイルスRNA EpiQuik Viral RNA Isolation Fast Kit EpiQuik／EpiMag Viral RNA Isolation Kitシリーズ拡大図 P-9107-050 唾液、鼻または鼻咽頭スワブなどからカラムまたは磁性ビーズを用いてウイルスRNAを抽出するキット
EpiMag 96-Well Viral RNA Extraction Kit (High Throughput) P-9108-050
EpiMag Viral RNA Isolation Kit (Magnetic Beads) P-9109-96
total RNA EpiQuik Total RNA Isolation Fast Kit EpiQuik Total RNA Isolation Fast Kit拡大図 P-9105-050 細胞・組織からカラムまたは磁性ビーズを用いてtotal RNA抽出するキット
EpiQuik Magbeads Quick RNA Isolation Kit EpiQuik Magbeads Quick RNA Isolation Kit拡大図 P-9106-050

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核の抽出

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品名 製品イメージ 商品コード 製品概要
EpiQuik Nuclear Extraction Kit EpiQuik Magbeads Quick RNA Isolation Kit拡大図 OP-0002-1 哺乳動物細胞、組織から核抽出物を調製するキット

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m6Aメチラーゼ／デメチラーゼ活性の測定

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品名 製品イメージ 商品コード 製品概要
Epigenase m6A Methylase Activity/Inhibition Assay Kit (Colorimetric) Epigenase m<sup>6</sup>A Methylase Activity/Inhibition Assay Kit (Colorimetric)拡大図 P-9019 m6Aメチラーゼ（メチルトランスフェラーゼ）の活性／阻害を測定するキット
Epigenase m6A Demethylase Activity/Inhibition Assay Kit (Colorimetric) Epigenase m<sup>6</sup>A Demethylase Activity/Inhibition Assay Kit (Colorimetric)拡大図 P-9013 m6Aデメチラーゼ活性／阻害活性を簡便、迅速に測定するキット

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RNA中のm6Aや5mCの総量の定量

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品名 製品イメージ 商品コード 製品概要
EpiQuik m6A RNA Methylation Quantification Kit (Colorimetric) EpiQuik Magbeads Quick RNA Isolation Kit拡大図 P-9005 RNA試料中のN6-メチルアデノシン（m6A）を定量するキット
EpiQuik m6A RNA Methylation Quantification Kit (Fluorometric) P-9008
MethylFlash Urine N6-methyladenosine (m6A) Quantification Kit (Colorimetric) MethylFlash Urine <i>N</i><sup>6</sup>-methyladenosine (m<sup>6</sup>A) Quantification Kit (Colorimetric)拡大図 P-9015 尿中のN6-メチルアデノシン（m6A）を定量するキット
MethylFlash 5-mC RNA Methylation ELISA Easy Kit (Fluorometric) MethylFlash 5-mC RNA Methylation ELISA Easy Kit (Fluorometric)拡大図 P-9009 RNA試料中の5-メチルシトシン (5-mC)を定量するキット

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抗m6A抗体

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略号

  • Poly：Polyclonal
  • Mono：Monoclonal
  • Hu：Human
  • Ms：Mouse
  • Rt：Rat
  • DB：Dot blot
  • IF：Immunofluorescence
  • IP：Immunoprecipitation
  • MeRIP：Methylated RNA Immunoprecipitation-sequencing
品名[クローン] 免疫動物 製品イメージ 交差性 適用 商品コード
N6-methyladenosine (m6A) Polyclonal Antibody Rabbit-Poly <i>N</i><sup>6</sup>-methyladenosine (m<sup>6</sup>A) Polyclonal Antibody拡大図 Hu, Ms DB, ELISA, IF, IP, MeRIP A-1801
N6-methyladenosine (m6A) Monoclonal Antibody [2H6] Rabbit-Mono <i>N</i><sup>6</sup>-methyladenosine (m<sup>6</sup>A) Monoclonal Antibody [2H6]拡大図 Hu, Ms, Rt DB, ELISA, IF, MeRIP, Nucleotide Array A-1802

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MeRIPおよびm6A-seqアッセイ

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品名 製品イメージ 商品コード 製品概要
EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit EpiNext CUT&RUN RNA m<sup>6</sup>A-Seq Kit拡大図 P-9018 RNAのm6A修飾のマッピングを改良型CUT&RUN法で行うキット
EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit P-9016

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お問い合わせ先

（テクニカルサポート 試薬担当）

reagent@funakoshi.co.jp

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。

エピジェネティクス