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CUT&RUN RNA m6A-Seq / m6A RNA Enrichment Kit
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CUT&RUN RNA m6A-Seq / m6A RNA Enrichment Kit
RNAのm6A修飾のマッピングを改良型CUT&RUN法で行うキット CUT&RUN RNA m6A-Seq / m6A RNA Enrichment Kit
掲載日情報：2021/01/05 現在Webページ番号：68188
RNAのm6A修飾のマッピングを改良型CUT&RUN法で行うキットです。
NGSライブラリーの調製までを行えるEpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit（#P-9016）と、m6A修飾RNAの濃縮・精製までを行うEpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment（MeRIP）Kit（#P-9018）があります。
※ タンパク質―DNA相互作用の解析をCUT&Tag In-Place法／改良型CUT&RUN法で行うキットについてはこちらをご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit（#P-9016）で調製したライブラリーにおけるフラグメントのサイズ分布
3μgのヒトtotal RNAから、抗m6A抗体を用いてm6A修飾RNAを捕捉し、ライブラリーを調製した。195 bpのピークは、抗m6A抗体と結合したRNA領域（約55 nt）に対応している。
EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit（#P-9016）を用いたm6A修飾部位のマッピング
ヒトSREK1転写物のm6A修飾部位についてマッピングを行ったところ、Meyerら（2012年）のデータ（図中右上）と高い相関性を示した。
m6A修飾のピークについて550倍の濃縮が行われている。
追加しました。
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追加しました。
RNAのm6A修飾とその解析法について
RNAのm6A修飾とは
m6A（N6-メチルアデノシン：N6-methyladenosine）は、真核生物において最も一般的かつ豊富に存在するRNA分子の修飾です。m6A修飾は、メチルトランスフェラーゼ複合体METTL3によって触媒され、α-ケトグルタル酸（α-KG）およびFe2＋依存的にm6Aの脱メチル化を触媒するm6AデメチラーゼのFTOとALKBH5によって除去されます。m6Aメチラーゼおよびデメチラーゼは、発生および代謝から生殖能力に至るまでの多くの生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たします。 m6Aは全RNA塩基のメチル化の80％以上を占めており、その多くはmRNAに見られますが、tRNA、rRNA、snRNAなどの非コードRNAにも存在します。非コードRNAと比べてmRNAにおいてm6Aが相対的に多いことから、スプライシング、核外輸送、翻訳能力と安定性、RNA転写などのRNA代謝プロセスに影響を与えることが示唆されます。 m6A RNAメチラーゼおよびデメチラーゼの欠陥による異常なm6Aメチル化レベルは、RNAの機能不全を起こし、病気の発症につながる可能性があります。例えば、FTOの変異によりその活性が増大した場合、標的mRNAのm6Aのレベルが異常に低くなり、未知の経路を介して肥満や関連疾患の発症につながります。RNAの動的で可逆的な化学的m6A修飾は、生物学的に重要な新しいエピジェネティックマーカーとなる可能性があります。そのため、RNAのm6Aメチル化レベルとRNA転写産物の分布をより理解することが求められています。
RNAのm6A修飾の解析法
エピトランスクリプトーム（全転写物の全修飾）全体に対してm6Aのマッピングをする手法として、現在、MeRIP-seq、PA-m6A-seq、miCLIP、m6A-CLIPなどがあります。
MeRIP-seq（Methylated RNA Immunoprecipitation-sequencing）は広く用いられていますが、m6Aプロファイリングにおいては高解像度が得られません。PA-m6A-seq、miCLIP、およびm6A-CLIPはプロファイリングの解像度を向上させますが、再現性が低く、プロセスが複雑になり、時間（＞2日）とコストを要します。
これらの問題に対処するために、EpiGentek Group社は、CUT&RUN RNA m6A –Seq（Cleavage Under Target & Recover Using Nuclease for m6A -Sequencing）およびCUT&RUN m6A Enrichment（Cleavage Under Target & Recover Using Nuclease for m6A Enrichment）という新たな解析法のキットを開発しました。これらのキットは、MeRIPとm6A-CLIPの利点を組み込み、最速の手順で解析を行うことができます。
追加しました。
特長
- 非特異的なバックグラウンドを最小限に抑えて、m6A修飾RNAを捕捉できます。
- RNA切断酵素ミックスの使用により、RNAの断片化と、m6A修飾配列の両端のRNA配列の切断／除去を同時に行うため、m6A修飾された短いRNA断片のみが得られ、高解像度でのマッピングが行えます。
- キットに含まれる抗m6A抗体は、アデノシンがメチル化されていないRNAには交差しません。
- キットには検証用にネガティブコントロール抗体（Non-immune IgG）が含まれています。
- 濃縮したRNAは、バーコード配列なし（シングルプレックス）、バーコード配列付き（マルチプレックス）いずれのライブラリーの調製にも適しています。
- ＜1,000万回の読み取り深度でシークエンンスデータ分析が可能です。
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製品仕様
商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。
| キット名 | EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit | EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment（MeRIP）Kit |
|---|---|---|
| 商品コード | P-9016 | P-9018 |
| 手 法 | 改良型CUT&RUN法 | |
| キットでできること | NGSライブラリーの調製まで | m6A修飾RNAの濃縮・精製まで （ライブラリー調製用試薬またはRT-qPCR試薬が別途必要） |
| 試 料 | total RNA（高品質で、DNAが混入していないもの） | |
| 試料量 | 1～20μg（推奨：10μg、最小：500 ngでの使用実績あり） | |
| NGSの読み取り深度 | ＜1,000万回 | |
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操作方法概略
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使用例
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キット内容
※ 96 well PCRプレートフォーマットの磁気スタンドなどが別途必要です。
| キット名 | EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit | EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment （MeRIP）Kit |
|---|---|---|
| Wash buffer | ● | ● |
| Capture buffer | ● | － |
| Immuno capture buffer | － | ● |
| Nuclear digestion enhancer | ● | ● |
| Cleavage enzyme mix | ● | ● |
| m6A antibody | ● | ● |
| Non-immune IgG | ● | ● |
| m6A positive control | － | ● |
| Protein digestion buffer | ● | ● |
| Proteinase K | ● | ● |
| Affinity beads | ● | ● |
| RNA purification solution | ● | ● |
| NA binding beads | ● | － |
| RNA binding beads | － | ● |
| Elution buffer | ● | ● |
| Reaction buffer | ● | － |
| RT enzyme | ● | － |
| Adaptor-A / B | ● | － |
| Reaction enzyme mix | ● | － |
| MQ binding beads | ● | － |
| HiFi PCR master mix | ● | － |
| Primer U / I | ● | － |
追加しました。
価格
EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit
[在庫・価格 ：2024年09月20日 09時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit |
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EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit |
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[在庫・価格 ：2024年09月20日 09時55分現在]
EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit
文献数： 0
- 商品コード：P-9016-12
- メーカー：EPG
- 包装：12tests
- 価格：¥158,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | メチル化したRNA塩基m6Aを含むRNA断片を濃縮し、NGS解析用のライブラリーを調製するキット。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 4℃,-20℃,暗所保存 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 ウイルスのRNA修飾および宿主由来RNAの研究用製品（EpiGentek社） |
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- 商品コード：P-9016-24
- メーカー：EPG
- 包装：24tests
- 価格：¥277,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | メチル化したRNA塩基m6Aを含むRNA断片を濃縮し、NGS解析用のライブラリーを調製するキット。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 4℃,-20℃,暗所保存 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年3月15日号 p.11
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| 製品記事 | 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 ウイルスのRNA修飾および宿主由来RNAの研究用製品（EpiGentek社） |
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EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit |
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[在庫・価格 ：2024年09月20日 09時55分現在]
EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit
文献数： 0
- 商品コード：P-9018-24
- メーカー：EPG
- 包装：24tests
- 価格：¥108,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | メチル化したRNA塩基m6Aを含むRNA断片を濃縮するキット。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 4℃,-20℃,暗所保存 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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- メーカー：EPG
- 包装：1kit
- 価格：¥30,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | Epigentek Group社の次世代シークエンス用ライブラリー作製キットを用いてDNA／RNAライブラリーを作製する際に,バーコード配列を組み込むことができる製品。作製したライブラリーは，Illumina社の次世代シークエンサーに使用可能。 |
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。