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迅速・簡便なマイクロバイオーム解析用ライブラリー調製キット Quick-16S Plus / Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit

掲載日情報:2021/07/08 現在Webページ番号:68305

微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,16S rRNA遺伝子 (Quick-16S Plus Kit (V3-V4)) またはITS領域(Quick-ITS Plus Kit)の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを調製するキットです。
ライブラリー調製時のPCR操作が1回のみでノーマライズのステップが不要となり,従来の製品と比べ,迅速(わずか30分)かつ簡便な操作でライブラリー調製が可能となりました。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Quick-16S-Plus-Normalization

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit(V3-V4)(#D6420, #D6422)を用いてライブラリー調製した場合のリード数
糞便,土壌,水試料由来のDNAを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。各ライブラリーはノーマライズせずに等量(各2μl)でプールし,MiSeq Reagent Kit v3(イルミナ社,600サイクル)を用いてシークエンシングした。
異なるDNA試料量でも同程度のリード数が得られていることが分かる。

Quick-ITS-Plus-Normalization

様々な量のDNA試料からQuick-ITS Plus NGS Library Prep Kit (#D6424, #D6426)を用いてライブラリー調製した場合のリード数
ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは土壌試料由来のDNAを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。各ライブラリーはノーマライズせずに等量(各2μl)でプールし,MiSeq Reagent Kit v3(イルミナ社,600サイクル)を用いてシークエンシングした。
異なるDNA試料量でも同程度のリード数が得られていることが分かる。


シリーズ製品一覧

Quick-16S NGS Library Prep Kitの詳細についてはこちらをご覧下さい。また,表中の商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

製品名Quick-16S Plus
NGS Library Prep Kit
Quick-ITS Plus
NGS Library Prep Kit
Quick-16S
NGS Library Prep Kit
他社製品
商品コードD6420, D6422 D6424, D6426 D6400, D6410
特 長最も早くライブラリーを調製できる。
各ライブラリーを等量プーリングする。
柔軟なプライマーセットとワークフロー。
PCRのサイクル数をコントロールすることで,PCRキメラを最小限に抑えることができる。
プライマーセットのカバー範囲が狭い。
操作時間30 min1.5 h≧4 h
操作手順1回のPCRで標的配列の増幅とバーコード配列の付加を行う。 標的配列の増幅,未反応プライマーの酵素分解,バーコード配列の付加の各ステップを別個に行う。 標的配列の増幅,磁気ビーズを用いた核酸精製,バーコード配列の付加の各ステップを別個に行う。
DNA試料量<100 ng5~20 ng/μl1~50 ng
ノーマライズの手法自動的にノーマライズされるため不要。
必要に応じて定量的PCRも可能。
定量的PCRで定量後にノーマライズ。ゲル電気泳動またはBioanalyzerで定量後にノーマライズ。
ライブラリーに含まれる超可変領域V3-V4領域のみITS領域V1-V2 Primer Set
V3-V4 Primer Set
V4領域(V4 Kit)
ITS領域(ITS Kit)
解析に適した生物種細菌,古細菌真菌類細菌,古細菌細菌,古細菌(V4 Kit)
真菌類(ITS Kit)

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特長

  • 独自のEqualase qPCR Premixとインデックスプライマーの使用により,1回のPCRのみで標的配列の増幅とバーコード配列の付加が行われます。
  • 各ライブラリーの定量・ノーマライズ操作が不要となり,等量のPCR産物をプールするだけです。
  • 自動分注装置による完全自動化も可能です。
  • 定量的PCRによる,微生物のコピー数の絶対定量が行えます(オプション)。

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本キットと既存法の操作法比較

本キット既存法
PCR(標的配列の増幅・バーコード配列の付加)標的配列のPCRによる増幅
磁気ビーズキットによる核酸精製
各ライブラリーを等量プーリングPCRによるバーコード配列の付加
磁気ビーズキットによる核酸精製
ライブラリーの最終精製各ライブラリーを定量・ノーマライズ後に
プーリング
  
トータルの操作時間:30分トータルの操作時間:4時間


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使用例

PCRキメラの抑制

Quick-16S-Plus-PCRキメラの抑制

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは,糞便,土壌試料由来のDNAを用いて,Equalase qPCR Premixを用いた1-Step PCR(Quick-16S Plus Kit)またはイルミナ社の16Sプロトコルでそれぞれ42サイクルのPCRを行った。キメラ配列の予測はUCHIMEを用いて行った。
本キットでは,PCRサイクル数の調整をすることなく,PCRキメラが最大70%抑制されていることが示された。

Quick-ITS-Plus-PCRキメラの抑制

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは,土壌試料由来のDNAを用いて,Equalase qPCR Premixを用いた1-Step PCR(Quick-ITS Plus Kit)またはイルミナ社のMetagenomicプロトコルでそれぞれ42サイクルのPCRを行った。キメラ配列の予測はUCHIMEを用いて行った。
本キットでは,PCRサイクル数の調整をすることなく,PCRキメラが最大70%抑制されていることが示された。


ライブラリー調製時に生じるバイアス

Quick-16S-Plus-ライブラリー調製時に生じるバイアス

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit(#D6420, #D6422)を用いてライブラリー調製した場合のバイアス
ZymoBIOMICS microbial community DNA standardを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。その後シークエンシングを行い,ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。
得られた結果が理論値(TheoretIcal)に近いことが分かる。



Quick-16S-Plus-ライブラリー調製時に生じるバイアス

DNA試料/微生物試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (#D6420, #D6422)を用いてライブラリー調製した場合のバイアス
ZymoBIOMICS microbial community DNA standard,またはZymoBIOMICS microbial community standardから抽出したDNAを用いてライブラリー調製した。その後シークエンシングを行い,ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。
得られた結果がいずれも理論値(TheoretIcal)に近いことが分かる。



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NGS特集へのリンク

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キット内容

製品名Quick-16S Plus Kit(V3-V4)Quick-ITS Plus Kit
商品コードD6420, D6422D6424, D6426
Equalase qPCR premix
ZymoBIOMICS DNase / RNase free water
ZymoBIOMICS microbial community DNA standard
ZymoBIOMICS 16S / ITS qPCR standard
V3-V4 index primer setSet A(plate):#D6420
Set Z(tube) :#D6422
ITS index primer setSet A(plate):#D6424
Set Z(tube) :#D6426
PCR inactivation solution
Select-a-Size MagBead concentrate
Select-a-Size MagBead buffer
DNA wash buffer
Magnetic rod

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価格

Quick-16S Plus Kit(V3-V4)

[在庫・価格 :2021年09月25日 00時14分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4) - 96 rxns
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,16S Rrna遺伝子の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを構築するキット。わずか30分の簡便な操作で調製でき,ノーマライズのステップが不要。
法規制等
保存条件 室温,4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ

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2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,16S rRNA遺伝子の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを構築するキット。わずか30分の簡便な操作で調製でき,ノーマライズのステップが不要。
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[在庫・価格 :2021年09月25日 00時14分現在]

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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4) - 96 rxns

文献数:0

説明文 微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,16S Rrna遺伝子の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを構築するキット。わずか30分の簡便な操作で調製でき,ノーマライズのステップが不要。
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Quick-ITS Plus Kit

[在庫・価格 :2021年09月25日 00時14分現在]

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Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit - 96 rxns
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微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,ITS領域の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを構築するキット。わずか30分の簡便な操作で調製でき,ノーマライズのステップが不要。
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説明文 微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている,ITS領域の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを構築するキット。わずか30分の簡便な操作で調製でき,ノーマライズのステップが不要。
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キット別売品

[在庫・価格 :2021年09月25日 00時14分現在]

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ZymoBIOMICS DNAse/RNAse Free Water
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
微生物叢(マイクロバイオーム)研究用製品ZymoBOMICS DNA/RNA Kitのキットコンポーネント別売品。
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ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard
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説明文
10種類の微生物(細菌および酵母)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相,微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム)およびメタゲノミクス研究における標準試料(微生物スタンダード)として有用。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.4
ニュース2019年3月1日号 p.4

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説明文
10種類の微生物(細菌および酵母)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相,微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム)およびメタゲノミクス研究における標準試料(微生物スタンダード)として有用。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.4
ニュース2019年3月1日号 p.4

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説明文 10種類の微生物(細菌および酵母)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相,微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム)およびメタゲノミクス研究における標準試料(微生物スタンダード)として有用。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.4
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法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。