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迅速・簡単なマイクロバイオーム解析用ライブラリー調製キット Quick-16S Plus / Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit

掲載日情報:2023/10/25 現在Webページ番号:68305

微生物叢(マイクロバイオーム)のプロファイリング時に用いられている、16S rRNA遺伝子 (Quick-16S Plus Kit (V3-V4, UDI)および(V4)) またはITS領域(Quick-ITS Plus Kit)の次世代シークエンシング(NGS)に最適なDNAライブラリーを調製するキットです。
ライブラリー調製時のPCR操作が1回のみでノーマライズのステップが不要なため、迅速(わずか30分)かつ簡便な操作でライブラリー調製が可能です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit(V3-V4)仕様変更のお知らせ

Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit(V3-V4)は、2023年10月より下記のとおり仕様変更されました。

  • 製品名が変更されました。
    旧製品:Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit(V3-V4)
    新製品:Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit(V3-V4, UDI
  • インデックスプライマーのタイプがUDI(Unique Dual Index)になりました。
  • インデックスプライマーが分注されているプレートに、Equalase qPCR premixもあらかじめ分注されるようになりました。
  • チューブフォーマット製品(#D6422)は販売終了となりました。
  • 96ウェルフォーマット製品は4種類(#D6420-PS1 ~ #D6420-PS4)から、8種類(#D6421-PS1 ~ #D6421-PS8)に変わりました。
    新旧いずれの製品も、商品コード末尾の-PSxにより含まれるインデックスプライマーの配列が異なります。

ご不明な点につきましては、当社テクニカルサポート(試薬担当)までお問合せ下さい。



Quick-16S-Plus-Normalization

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4, UDI)(#D6421-PS1 ~ #D6421-PS8)を用いてライブラリー調製した場合のリード数

糞便、土壌、水試料由来のDNAを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。各ライブラリーはノーマライズせずに等量(各2 μl)でプールし、MiSeq Reagent Kit v3(イルミナ社、600サイクル)を用いてシークエンシングした。
異なるDNA試料量でも同程度のリード数が得られていることが分かる。

Quick-16S-Plus-V4-Normalization

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4)(#D6430-PS1 ~ #D6430-PS4、#D6432)を用いてライブラリー調製した場合のリード数

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは土壌試料由来のDNAを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。各ライブラリーはノーマライズせずに等量(各2 μl)でプールし、MiSeq Reagent Kit v2(イルミナ社、300サイクル)を用いてシークエンシングした。
異なるDNA試料量でも同程度のリード数が得られていることが分かる。

Quick-ITS-Plus-Normalization

様々な量のDNA試料からQuick-ITS Plus NGS Library Prep Kit(#D6424-PS1 ~ #D6424-PS4、#D6426)を用いてライブラリー調製した場合のリード数

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは土壌試料由来のDNAを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。各ライブラリーはノーマライズせずに等量(各2 μl)でプールし、MiSeq Reagent Kit v3(イルミナ社、600サイクル)を用いてシークエンシングした。
異なるDNA試料量でも同程度のリード数が得られていることが分かる。


シリーズ製品一覧

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。
Quick-16S NGS Library Prep Kitの詳細についてはこちらをご覧下さい。
表中のガイド資料をクリックするとプレートセットアップまたは96試料以上をシークエンシングする場合のガイドがpdfでご覧になれます。

製品名 Quick-16S Plus
NGS Library Prep Kit
(V3-V4, UDI)
Quick-16S Plus
NGS Library Prep Kit
(V4)
Quick-ITS Plus
NGS Library Prep Kit
Quick-16S
NGS Library Prep Kit
他社製品
商品コード #D6421-PS1 ~ #D6421-PS8 #D6430-PS1 ~ #D6430-PS4
#D6432
#D6424-PS1 ~
#D6424-PS4

#D6426
#D6400#D6410
特 長迅速にライブラリーを調製できる。
各ライブラリーを等量プーリングする。
柔軟なプライマーセットとワークフロー。
PCRのサイクル数をコントロールすることで、PCRキメラを最小限に抑えることができる。
プライマーセットのカバー範囲が狭い。
インデックス
プライマーのタイプ
Unique Dual Index(UDI)Dual IndexDual Index
操作時間30 min1.5 h≧4 h
操作手順1回のPCRで標的配列の増幅とバーコード配列の付加を行う。 標的配列の増幅、未反応プライマーの酵素分解、バーコード配列の付加の各ステップを別個に行う。 標的配列の増幅、磁気ビーズを用いた核酸精製、バーコード配列の付加の各ステップを別個に行う。
DNA試料量≦100 ng5~20 ng/μl1~50 ng
ノーマライズの手法自動的にノーマライズされるため不要。
必要に応じて定量的PCRも可能。
定量的PCRで定量後にノーマライズ。ゲル電気泳動またはBioanalyzerで定量後にノーマライズ。
ライブラリーに
含まれる超可変領域
V3-V4領域V4領域ITS領域V1-V2 Primer Set
V3-V4 Primer Set
V4領域(V4 Kit)
ITS領域(ITS Kit)
解析に適した生物種細菌、古細菌細菌、古細菌真菌類細菌、古細菌細菌、古細菌(V4 Kit)
真菌類(ITS Kit)
ガイド資料

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特長

  • 独自のEqualase qPCR premixとインデックスプライマーの使用により、1回のPCRのみで標的配列の増幅とバーコード配列の付加が行われます。
  • Quick-16S Plus Kit(V3-V4, UDI)および(V4)は、インデックスプライマーが分注されているプレートにEqualase qPCR premixもあらかじめ分注されており、操作がより簡便になっています。
  • 各ライブラリーの定量・ノーマライズ操作が不要となり、等量のPCR産物をプールするだけです。
  • 自動分注装置による完全自動化も可能です。
  • 定量的PCRによる、微生物のコピー数の絶対定量が行えます(オプション)。

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本キットと既存法の操作法比較

本キット既存法
PCR(標的配列の増幅・バーコード配列の付加)標的配列のPCRによる増幅
磁気ビーズキットによる核酸精製
各ライブラリーを等量プーリングPCRによるバーコード配列の付加
磁気ビーズキットによる核酸精製
ライブラリーの最終精製各ライブラリーを定量・ノーマライズ後に
プーリング
  
トータルの操作時間:30分トータルの操作時間:4時間


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使用例

PCRキメラの抑制

Quick-16S-Plus-PCRキメラの抑制

DNA試料/微生物試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4, UDI)(#D6421-PS1 ~ #D6421-PS8)またはイルミナ社の16SプロトコルでPCRを行った場合のPCRキメラ生成の比較

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは、糞便、土壌試料由来のDNAを用いて、Equalase qPCR Premixを用いた1-Step PCR(Quick-16S Plus Kit)またはイルミナ社の16Sプロトコルでそれぞれ42サイクルのPCRを行った。キメラ配列の予測はUCHIMEを用いて行った。
本キットでは、PCRサイクル数の調整をすることなく、PCRキメラが最大70%抑制されていることが示された。


Quick-ITS-Plus-PCRキメラの抑制

DNA試料/微生物試料からQuick-ITS Plus NGS Library Prep Kit(D6424-PS1 ~ #D6424-PS4, #D6426)またはイルミナ社のMetagenomicプロトコルでPCRを行った場合のPCRキメラ生成の比較

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardまたは、土壌試料由来のDNAを用いて、Equalase qPCR Premixを用いた1-Step PCR(Quick-ITS Plus Kit)またはイルミナ社のMetagenomicプロトコルでそれぞれ42サイクルのPCRを行った。キメラ配列の予測はUCHIMEを用いて行った。
本キットでは、PCRサイクル数の調整をすることなく、PCRキメラが最大70%抑制されていることが示された。


ライブラリー調製時に生じるバイアス

Quick-16S-Plus-ライブラリー調製時に生じるバイアス

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4, UDI)(#D6421-PS1 ~ #D6421-PS8)を用いてライブラリー調製した場合のバイアス

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。その後シークエンシングを行い、ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。
得られた結果が理論値(Theoretical)に近いことが分かる。


Quick-16S-Plus-ライブラリー調製時に生じるバイアス

DNA試料/微生物試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4, UDI)(#D6421-PS1 ~ #D6421-PS8)を用いてライブラリー調製した場合のバイアス

ZymoBIOMICS microbial community DNA standard、またはZymoBIOMICS microbial community standardから抽出したDNAを用いてライブラリー調製した。その後シークエンシングを行い、ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。
得られた結果がいずれも理論値(Theoretical)に近いことが分かる。



Quick-16S-V4-Plus-ライブラリー調製時に生じるバイアス

様々な量のDNA試料からQuick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4)(#D6430-PS1 ~ #D6430-PS4, #D6432)を用いてライブラリー調製した場合のバイアス

ZymoBIOMICS microbial community DNA standardを0.01~100 ng用いてライブラリー調製した。その後シークエンシングを行い、ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。
得られた結果が理論値(Theoretical)に近いことが分かる。


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キット内容

各キットコンポーネント名をクリックすると、単品の価格表をご覧いただけます。

製品名 Quick-16S
Plus Kit
(V3-V4, UDI)
Quick-16S Plus Kit(V4) Quick-ITS
Plus Kit
reaction数 96 reactions 96 reactions 384 reactions 96 または24
reactions
商品コード #D6421-PS1 ~
#D6421-PS8
#D6430-PS1 ~
#D6430-PS4
#D6432 #D6424-PS1 ~
#D6424-PS4、
#D6426




V3-V4 UDI index primer plate
V4 premix plate
V4 targeted amplification plate
Sequencing primers
(Read1 / 2, Index1(i7) / 2(i5))
Equalase qPCR premix
ITS index primer set
ZymoBIOMICS microbial
community DNA standard
ZymoBIOMICS 16S/ITS
qPCR standard
Select-a-Size MagBead
Select-a-Size MagBead buffer
DNA wash buffer
ZymoBIOMICS DNase /
RNase free water
PCR inactivation solution
Magnetic rod

キットにより内容は異なります。


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価格

Quick-16S Plus Kit(V3-V4, UDI)

[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
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  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 1
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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保存条件 室温,4℃,-20℃,凍結禁止 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年10月15日号 p.25

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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 2
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 3
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 4
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 5
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 6
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 7
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 8
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[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V3-V4 UDI) with Primer Set 1

文献数: 0

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保存条件 室温,4℃,-20℃,凍結禁止 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年10月15日号 p.25

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Quick-16S Plus Kit(V4)

[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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詳細 商品名
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) (96 preps) with Index Primer Set 1
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) (96 preps) with Index Primer Set 2
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) (96 preps) with Index Primer Set 3
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) (96 preps) with Index Primer Set 4
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) - 384 rxns
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) (96 preps) with Index Primer Set 1

文献数: 0

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Quick-ITS Plus Kit

[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit with Primer Set 1 - 96 rxns
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ニュース2022年12月1日号 p.7

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[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit with Primer Set 1 - 96 rxns

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法規制等
保存条件 4℃,-20℃,凍結禁止 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年10月15日号 p.25
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キット別売品

[在庫・価格 :2024年03月29日 15時15分現在]

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納期 文献数
ZymoBIOMICS DNase/RNase Free Water
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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法規制等
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2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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微生物叢(マイクロバイオーム)研究用製品ZymoBOMICS DNA/RNA Kitのキットコンポーネント別売品。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 1
説明文
10種類の微生物(細菌および酵母)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相,微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム)およびメタゲノミクス研究における標準試料(微生物スタンダード)として有用。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年2月1日号 p.11
ニュース2021年10月1日号 p.11

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10種類の微生物(細菌および酵母)から抽出・精製したゲノムDNA混合物。微生物相,微生物叢(マイクロバイオータ,マイクロバイオーム)およびメタゲノミクス研究における標準試料(微生物スタンダード)として有用。
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掲載カタログ ニュース2023年2月1日号 p.11
ニュース2020年2月15日号 p.4

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ZymoBIOMICS DNase/RNase Free Water

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reagent@funakoshi.co.jp

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