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トランスラトーム/de novoプロテオーム解析用キット AHARIBO RNA Kit / AHARIBO Protein Kit

掲載日情報:2019/12/19 現在Webページ番号:68157

独自のRibo-MINATI技術により,翻訳複合体のプルダウンを行うキットです。トランスラトーム解析用のAHARIBO RNA Kitと,de novoプロテオーム解析用のAHARIBO Protein Kitがあります。それぞれのキットを用いることで,少量の試料から迅速に,さまざまな生物学的条件における翻訳/タンパク質合成の動的変化を検出することができます。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


トランスラトームおよびde novoプロテオームとそれらの解析について

トランスラトーム(Translatome)は,単一の細胞内である瞬間または条件で翻訳に使用されるRNAの全体を指します。一次転写物全体を指すトランスクリプトーム(Transcriptome)よりも,新規合成されたタンパク質全体(de novoプロテオーム)との相関性が高く,ある遺伝子の発現レベル推定時により正確な値が得られます。

従来のトランスラトーム解析法としてポリソームプロファイリングやアフィニティ精製後のRNA-seqが,de novoプロテオーム解析法としてpSILACやPUNCH-Pなどのアフィニティ精製後のLC-MSがあります。しかしながら,いずれも手間を要する手法であり,また得られた結果もmRNAとタンパク質レベルの相関関係は比較的乏しくなっています。

Ribo-MINATI技術は,トランスラトームおよびde novoプロテオーム解析において信頼できる結果をもたらす手法です。


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Ribo-MINATI技術について

Ribo-MINATI(Minimally Invasive Non-canonical Amino acid Tagging and Isolation of Ribosomes)技術は,リボソームに結合した新生ペプチド鎖内にアミノ酸類似体であるL-azidohomoalanine(AHA)を取り込ませた後に,抗体を用いずに翻訳複合体のプルダウンを行う手法です。

Ribo-MINATI技術について

培養細胞にAHAを添加した後,翻訳中のリボソーム上の新生ペプチドをブロックする独自の小分子(sBlock)を加えて,細胞を溶解します。
AHA標識された新生ペプチド鎖と独自のスマートビーズをクリックケミストリーにより結合させることにより,活性リボソーム複合体を分離する際のタグとして使用します。
リボソーム複合体に結合したRNAおよび新生ペプチドを分離・精製し,下流の解析に用います。
タグとしてアミノ酸類似体であるAHAを用いるため,培養細胞に安全に供給され,タンパク質合成中に新生ペプチドへ迅速かつ高感度に,非毒性,非放射性の非常に小さなアジド部分からなる標識をもたらします。


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Memo:Immagina BioTechnology社のリボソーム解析用製品群について


Immagina BioTechnology社のリボソーム解析用製品群について

RiboLaceおよびCircAID-p-seq Kitの詳細については,それぞれ該当のページをご覧下さい。


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特長

AHARIBO RNA Kit

  • 本キットでリボソーム複合体および結合RNAを分離した後,RNA精製をし,RNA-seq解析を行うことで,トランスラトーム解析を行えます。
  • タンパク質をコードしたRNA,リボソーム関連の調節RNA,非コードで翻訳に関連するRNAの3種類を濃縮できることが示されました。
  • マウス胚性幹細胞の神経分化の動的変化において,本キットで同定されたトランスラトームはTotal RNAよりも,それぞれのタンパク質レベルに対して高い相関を示しました。

AHARIBO Protein Kit

  • 本キットでリボソーム複合体および新生ペプチド鎖を分離した後,ペプチドを消化し,LC-MS解析を行うことで,de novoプロテオーム解析を行えます。
  • マウス胚性幹細胞の神経分化の動的変化において,本キットで同定されたde novoプロテオームは総タンパク質よりも,それぞれのmRNAレベルに対して高い相関を示しました。

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キット内容

キット名 AHARIBO
RNA Kit
AHARIBO
Protein Kit
商品コード AHA003-R AHA003-P
W-buffer
sBeads
dBeads
Washing solution
Urea washing solution
AHA
Lysis buffer
Ligand
L-Leucine
sBlock

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価格

[在庫・価格 :2021年03月01日 17時51分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
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  • 法規制等
納期 文献数
AHARIBO RNA, 6tests Kit
3~4週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
翻訳複合体のプルダウンを行い,翻訳に関与するRNAを単離するキット。トランスラトーム(Translatome)解析に有用。
法規制等
保存条件 4℃ 法規備考
掲載カタログ

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翻訳複合体のプルダウンを行い,新生ペプチドを単離するキット。de novoプロテオーム解析に有用。
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[在庫・価格 :2021年03月01日 17時51分現在]

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AHARIBO RNA, 6tests Kit

文献数:0

説明文 翻訳複合体のプルダウンを行い,翻訳に関与するRNAを単離するキット。トランスラトーム(Translatome)解析に有用。
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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