HOME> 試薬> 遺伝子工学> PCR・シークエンシング> シークエンシング> Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit

rRNAを除去したTotal RNAのライブラリー構築キット Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit

掲載日情報:2020/03/10 現在Webページ番号:68149

rRNAとグロビンmRNAを除去(枯渇)したTotal RNAのライブラリーを,バイアスなく,正確かつ迅速・簡便に構築できるキットです。RNAライブラリー構築までを行えるTotal RNA Library Kitと,rRNAとグロビンmRNAを除去した一本鎖cDNA調製までを行うUniversal cDNA Kitがあります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


様々な試料由来RNAからのrRNAの効率的な除去

図1:様々な試料由来RNAからのrRNAの効率的な除去
様々な試料由来のRNAについて,rRNA除去/未除去試料からライブラリーを構築し,ペアエンドシークエンス後,アノテーションを行った。


特長

  • コードRNA・非コードRNA双方を含む完全なトランスクリプトームのRNAライブラリーを構築できます。
  • プローブを用いない独自のRiboFree Universal Depletion技術により,すべての生物種のRNAから,rRNAとグロビンmRNAを酵素的に除去します(図1参照)。
  • rRNA除去時のバイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できます(図2参照)。
  • 他社製品と比べて操作ステップ数が少なく,またほとんどの試薬がマスターミックスになっているため,ピペッティングの手間を大幅に減らします(表参照)。
  • 各反応後に,キットに含まれる磁性ビーズを用いて簡便に核酸精製を行えます。
  • 全血,末梢白血球,FFPE試料などから精製したRNAを用いてのライブラリー構築も可能です。
  • 構築したライブラリーはストランド特異的で,Read1 配列は元のRNAに対するアンチセンスになります。
  • 構築したライブラリーは,Illuminaのすべてのシークエンシングプラットフォームと互換性があります。

長鎖非コードRNA(lncRNA),イントロンRNA,核小体RNA(snoRNA),および分解されたpoly(A)テールを有するmRNAも含まれます。


目次に戻る

仕様

用いる試料 RNA
用いるRNAの量 100 ng~5μg(推奨量:500 ng)
用いるRNAの品質 A260 / A280 ≧1.8, A260 / A230 ≧1.8,DNAおよびPCR阻害物質を含まない。
操作時間 3.5時間:Total RNA Library Kit(RNA試料からライブラリー構築まで)
1.5時間:Universal cDNA Kit(RNA試料から一本鎖cDNA調製まで)

目次に戻る

操作方法概略

Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kitの操作方法概略

目次に戻る

他社製品との比較

Zymo-Seq
RiboFree Total RNA
Library Kit
A社 B社
rRNAの除去法 RiboFree
Universal Depletion
プローブ法 Poly(A)配列による
プルダウン
ストランド特異的
操作時間
(rRNA除去を含む)
3.5時間 >9.5時間 8.5時間
操作の
総ステップ数
51 151 127
1つのキットで
すべての生物種由来
RNAへ対応
× ×
必要な試薬がキットに
すべて含まれている
× ×


rRNA除去時に影響を受ける遺伝子の数

rRNA除去_非除去の比較

図2:rRNA除去時に影響を受ける遺伝子の数
Universal Human Reference RNAに ERCC Spike-In Mix 1(共にThermo Fisher Scientific社)を添加したものを試料として,それぞれのキットでrRNA除去/未除去試料からライブラリーを構築し,ペアエンドシークエンス後,比較を行った。
rRNA除去時に影響を受ける遺伝子の数が,本製品はB社製品の1/35であることが示された。


目次に戻る

キット内容

各キットコンポーネント名をクリックすると,単品の価格表をご覧いただけます。

キット名 Zymo-Seq RiboFree
Total RNA Library Kit
Zymo-Seq RiboFree
Universal cDNA Kit
(12 preps)
(12 preps) (96 preps)
商品コード R3000 R3003 R3001
R1 / R2 reagent
D1 / D2 reagent
D3 stop reagent
L1 / L2 / L3 reagent
ZymoTaq PreMix
Zymo-Seq UDI primer set
(Indexes 1-12)
Zymo-Seq UDI primer set
(Indexes 1-96)
Select-a-Size MagBead set
(concentrate & buffer)
Zymo-Seq wash buffer
DNA elution buffer
DNase / RNase-free water

磁気ビーズスタンドが別途必要です。PCR Strip MagStand (#3DP-1002)のご使用をお勧めします。


目次に戻る

価格

[在庫・価格 :2020年07月09日 16時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (12 preps)
- 0
説明文
rRNAとグロビンmRNAを除去(枯渇)したTotal RNAライブラリーを迅速かつ簡便に構築できるキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 4℃,-80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.12

製品記事
関連記事
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (96 preps)
10日程度  0
説明文
rRNAとグロビンmRNAを除去(枯渇)したTotal RNAライブラリーを迅速かつ簡便に構築できるキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事
Zymo-Seq RiboFree Universal cDNA Kit (12 preps)
10日程度  0
説明文
Total RNAライブラリー作製用のrRNAとグロビンmRNAを除去した一本鎖cDNA調製するキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

[在庫・価格 :2020年07月09日 16時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (12 preps)

文献数:0

  • 商品コード:R3000
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥193,000
  • 在庫:2個
  • 納期:-
  • 法規制等:

説明文 rRNAとグロビンmRNAを除去(枯渇)したTotal RNAライブラリーを迅速かつ簡便に構築できるキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 4℃,-80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.12

製品記事
関連記事

Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (96 preps)

文献数:0

  • 商品コード:R3003
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥1,320,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 rRNAとグロビンmRNAを除去(枯渇)したTotal RNAライブラリーを迅速かつ簡便に構築できるキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

Zymo-Seq RiboFree Universal cDNA Kit (12 preps)

文献数:0

  • 商品コード:R3001
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1kit
  • 価格:¥97,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 Total RNAライブラリー作製用のrRNAとグロビンmRNAを除去した一本鎖cDNA調製するキット。すべての生物種および試料から精製したRNAを用いて,バイアスがなく,正確なRNAライブラリーを構築できる。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事


■ 関連製品

[在庫・価格 :2020年07月09日 16時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
PCR Strip MagStand
10日程度  0
説明文
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事
Zymo-Seq UDI Primer Set (Indexes 1-12)
10日程度  0
説明文
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事
Zymo-Seq UDI Primer Plate (Indexes 1-96)
10日程度  0
説明文
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

[在庫・価格 :2020年07月09日 16時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

PCR Strip MagStand

文献数:0

  • 商品コード:3DP-1002
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1piece
  • 価格:¥11,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

Zymo-Seq UDI Primer Set (Indexes 1-12)

文献数:0

  • 商品コード:D3008
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1set
  • 価格:¥38,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

Zymo-Seq UDI Primer Plate (Indexes 1-96)

文献数:0

  • 商品コード:D3096
  • メーカー:ZYR
  • 包装:1plate
  • 価格:¥97,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:10日程度 
  • 法規制等:

説明文 Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitのIndex primer setの別売品。
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事
関連記事

目次に戻る

お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。