二本鎖DNAの断片化からライブラリー作製まで3時間で行えます！ sparQ DNA Frag & Library Prep Kit
掲載日情報：2024/11/25 現在Webページ番号：67879
二本鎖DNAを断片化し、Illumina社次世代シークエンサー（NGS）の解読にそのまま使用できるDNAライブラリー作製キットです。2ステップの簡便な操作で、2.5時間以内に構築できます。
※ あらかじめ断片化された二本鎖DNAからIllumina社次世代シークエンサー（NGS）にそのまま使用できるDNAライブラリーを作製する場合は、sparQ DNA Library Prep Kit（#95191）をご利用下さい。
※ 解析にはIllumina社の次世代シークエンサーが別途必要です。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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特長
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操作方法概略
- 二本鎖DNAの断片化、5’-リン酸化による末端修復および3’-dA-tailを付加する。
- アダプターを付加した後、精製する（必要な場合は更にPCR増幅を行い、精製する）。
※ 得られた産物は、Illumina社次世代シークエンシング（NGS）にそのまま用いることができる。
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使用例
本製品と他社ライブラリー作製キットのNGSライブラリー収量の比較
DNA断片のサイズの調整
左：フラグメントサイズの調整
本製品を用いて100 ngのヒトゲノムDNAを、異なるインキュベーション時間（3～18分）で断片化を行った後、精製したDNAを、Agilent High Sensitivity DNA Kitを用いて解析した。
右：DNA量と所要断片化時間
目的のDNA断片のサイズとDNA量をグラフに当てはめることで、適切なインキュベーション時間を求めることができる。
幅広いGC含量における読み取り深度の比較
本製品および他社の断片化およびライブラリー作製キットを用いて、1 ngまたは100 ngの微生物ゲノムDNAを用いてライブラリーを作製し、Illumina社MiSeqでシークエンシングを行った。各製品におけるGC含量のバイアスに対する読み取り深度の均一性を、幅広いGC含量においてノーマライズした読み取り深度と比較した。その結果、本製品を用いて調製したライブラリーは、Covaris社の機械的せん断法により調製した一般的な増幅ライブラリーと同様の高性能を示した。
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ビデオチュートリアル
下記画像をクリックするとsparQ DNA Frag & Library Prep Kitのビデオチュートリアルをご覧になれます（英語版、約12分のvimeo動画）。
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アプリケーションノート
Quantabio社が提供する技術情報です。クリックするとpdfファイルまたはエクセルファイルがダウンロードできます。
- Quality Control for PCR-Free WGS Libraries: A Guideline for TapeStation® Analysis of PCR-Free Library Preparation with Y-Shaped Adapters
- Increased control over longer DNA fragmentation patterns using lower temperature with sparQ DNA Frag & Library Prep Kit
- Poster: Streamlined and high accuracy whole genome and transcription sequencing using Singular Genomics G4™ platform and Quantabio sparQ library prep kits
- Rapid 16S Metagenomic Library Preparation for Oxford Nanopore Technologies (ONT)® Platform
- sparQ UDI Adapters sequences
- Optimization Guide
- Set-up Guide Using sparQ Adapter Barcode
- Single-tube solutions to streamline DNA library preparation and improve sequencing results while lowering costs
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キット内容
- DNA frag & polishing enzyme mix
- DNA frag & polishing buffer
- DNA frag enhancer solution
- DNA ligase
- DNA rapid ligation buffer
- HiFi PCR master mix
- Primer mix
※ キットにはアダプター付加誤およびPCR増幅後のDNA精製に必要なSPRIビーズは含まれていません。別途ご用意下さい。sparQ PureMag Beadsの使用をお奨めします。 ※ キットにはアダプターヌクレオチド：sparQ UDI Adaptersは含まれていません。別途ご用意下さい。
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価格
[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
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sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (24reactions) |
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sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (96reactions) |
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (24reactions)
文献数： 2
- 商品コード：95194-024
- メーカー：QTB
- 包装：1kit
- 価格：¥84,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 幅広い濃度の二本鎖DNAの断片化からライブラリー作成までを３時間で行えるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年10月1日号 p.14
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| 製品記事 | |||
| 関連記事 | 次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (96reactions)
文献数： 2
- 商品コード：95194-096
- メーカー：QTB
- 包装：1kit
- 価格：¥331,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 幅広い濃度の二本鎖DNAの断片化からライブラリー作成までを３時間で行えるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2021年10月1日号 p.14
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関連製品
sparQ PureMag Beads
[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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sparQ PureMag Beads |
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sparQ PureMag Beads |
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sparQ PureMag Beads |
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
sparQ PureMag Beads
文献数： 0
- 商品コード：95196-005
- メーカー：QTB
- 包装：5ml
- 価格：¥59,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 4℃,凍結禁止 | 法規備考 | |
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sparQ PureMag Beads
文献数： 0
- 商品コード：95196-060
- メーカー：QTB
- 包装：60ml
- 価格：¥216,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。 |
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sparQ PureMag Beads
文献数： 0
- 商品コード：95196-450
- メーカー：QTB
- 包装：450ml
- 価格：ご照会ください
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | 溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。 |
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sparQ UDI Adapters
[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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sparQ UDI Adapters (1-96) |
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]
sparQ UDI Adapters (1-96)
文献数： 0
- 商品コード：95211-096
- メーカー：QTB
- 包装：1plate
- 価格：¥199,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | Illumina社プラットフォーム用のNGS（次世代シークエンシング）ライブラリーのデュアルインデックスアダプター。sparQ DNA library prep kits(#95191-024), sparQ DNA Frag & Library Prep Kit(#95194-024)との使用を推奨。 |
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
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| 品名 | 製品概要 |
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| sparQ DNA Library Prep Kit | あらかじめ断片化した二本鎖DNAからIllumina社次世代シークエンサー（NGS）の解読に使用するDNAライブラリーを、2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット |
| sparQ HiFi PCR Master Mix | 次世代シークエンシングに使用するDNAライブラリーを、高い効率およびフィデリティ、低いバイアスで増幅できるPCRマスターミックス |
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