二本鎖DNAの断片化からライブラリー作製まで3時間で行えます！ sparQ DNA Frag & Library Prep Kit
掲載日情報：2024/01/30 現在Webページ番号：67879
二本鎖DNAを断片化し、Illumina社次世代シークエンサー（NGS）の解読にそのまま使用できるDNAライブラリー作製キットです。2ステップの簡便な操作で、3時間以内に構築できます。
※ あらかじめ断片化された二本鎖DNAからIllumina社次世代シークエンサー（NGS）にそのまま使用できるDNAライブラリーを作製する場合は、sparQ DNA Library Prep Kit（#95191）をご利用下さい。
※ 解析にはIllumina社の次世代シークエンサーが別途必要です。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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特長
- ステップ数が少ないため、移し替えなどの操作による試料のロスが抑えられます。
- 試料を過度の断片化から保護するユニークな酵素混合物を用いています。
- 断片化におけるDNA断片のサイズの調整が可能で、かつ再現性に優れています。
- 構築の困難な配列を含む領域のcoverageを向上させ、バイアスを抑えた結果が得られます。
- PCR増幅を行わない場合は100 ngのDNAから、PCR増幅を行う場合には1 ngのDNAから作製することができ、少量のDNAから得られるライブラリーの収量を増大できます。
- 適応試料量：1 ng～1μg DNA
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製品ラインナップ
商品コードをクリックすると価格表をご覧いただけます。
| 品名 | 商品コード | 包装 |
|---|---|---|
| sparQ DNA Frag & Library Prep Kit - 24 | 95194-024 | 24 reactions |
| sparQ DNA Frag & Library Prep Kit - 96 | 95194-096 | 96 reactions |
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操作方法概略
- 二本鎖DNAの断片化、5’-リン酸化による末端修復および3’-dA-tailを付加する。
- アダプターを付加した後、精製する（必要な場合は更にPCR増幅を行い、精製する）。
※ 得られた産物は、Illumina社次世代シークエンシング（NGS）にそのまま用いることができる。
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使用例
使用例 1. 本製品と他社ライブラリー作製キットのNGSライブラリー収量の比較
本製品と他社製品（Supplier B）を用いて、Coriell NA12878由来のゲノムDNA 100 ngから、DNA断面の平均サイズ300 bpのDNAライブラリーを作製した。作製したDNAライブラリーを用いて、PCRにより5サイクルの増幅を実施し、Qubit蛍光定量法により収量を測定した。本製品を用いた場合では、他社製品に比べて高い収量が得られた。
使用例 2. DNA断片のサイズの調整
左：フラグメントサイズの調整
本製品を用いて100 ngのヒトゲノムDNAを、異なるインキュベーション時間（3～18分）で断片化を行った後、精製したDNAを、Agilent High Sensitivity DNA Kitを用いて解析した。
右：DNA量と所要断片化時間
目的のDNA断片のサイズとDNA量をグラフに当てはめることで、適切なインキュベーション時間を求めることができる。
使用例 3. 幅広いGC含量におけるcoverageの比較
本製品および他社断片化およびライブラリー作製キットを用いて、1 ngまたは100 ngの微生物ゲノムDNAを用いてライブラリーを作製し、Illumina社MiSeqでシークエンシングを行った。各製品におけるGC含量のバイアスに対するcoverageの均一性を、幅広いGC含量においてノーマライズしたcoverageのものと比較した。その結果、本製品を用いて調製したライブラリーは、Covaris社の機械的せん断法により調製した一般的な増幅ライブラリーと同様の高性能を示した。
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ビデオチュートリアル
下記画像をクリックするとsparQ DNA Frag & Library Prep Kitのビデオチュートリアルをご覧になれます（英語版、約12分のvimeo動画）。
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キット内容
- DNA frag & polishing enzyme mix
- DNA frag & polishing buffer
- DNA frag enhancer solution
- DNA ligase
- DNA rapid ligation buffer
- HiFi PCR master mix
- Primer mix
※ キットにはアダプター付加誤およびPCR増幅後のDNA精製に必要なSPRIビーズは含まれていません。sparQ PureMag Beadsの使用をお奨めします。 ※ キットにはアダプターヌクレオチド：sparQ UDI Adaptersは含まれていません。別途ご用意下さい。
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アプリケーションノート
Quantabio社が提供する技術情報です。クリックするとpdfファイルがダウンロードできます。
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価格
[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]
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sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (24reactions) |
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sparQ DNA Frag & Library Prep Kit (96reactions) |
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文献数： 2
- 商品コード：95194-024
- メーカー：QTB
- 包装：1kit
- 価格：¥84,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
幅広い濃度の二本鎖DNAの断片化からライブラリー作成までを３時間で行えるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。 |
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| 法規制等 | |||
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- メーカー：QTB
- 包装：1kit
- 価格：¥331,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
幅広い濃度の二本鎖DNAの断片化からライブラリー作成までを３時間で行えるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。 |
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- 商品コード：95196-005
- メーカー：QTB
- 包装：5ml
- 価格：¥59,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。 |
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- メーカー：QTB
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- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
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- 商品コード：95196-450
- メーカー：QTB
- 包装：450ml
- 価格：¥1,056,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
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- 商品コード：95211-096
- メーカー：QTB
- 包装：1plate
- 価格：¥199,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
Illumina社プラットフォーム用のNGS（次世代シークエンシング）ライブラリーのデュアルインデックスアダプター。sparQ DNA library prep kits(#95191-024), sparQ DNA Frag & Library Prep Kit(#95194-024)との使用を推奨。 |
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| sparQ DNA Library Prep Kit - 24 | 95191-024 | 24 reactions | あらかじめ断片化した二本鎖DNAからIllumina社次世代シークエンサー（NGS）の解読に使用するDNAライブラリーを、2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット |
| sparQ DNA Library Prep Kit - 96 | 95191-096 | 96 reactions | |
| sparQ HiFi PCR Master Mix | 95192-050 | 50 reactions | 次世代シークエンシングに使用するDNAライブラリーを、高い効率およびフィデリティ、低いバイアスで増幅できるPCRマスターミックス |
| 95191-096 | 250 reactions（5×1.25 ml） |
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