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少量のDNA試料からも作製できるNGSライブラリー調製キット sparQ DNA Library Prep Kit

掲載日情報：2024/11/25 現在Webページ番号：67711

クォンタバイオ /
Quantabio
[メーカー略称：QTB]

断片化した二本鎖DNAからIllumina社次世代シークエンサー（NGS）の解析に使用するDNAライブラリーを、2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキットです。
※ 二本鎖DNAの断片化からライブラリー作製まで3時間で行えるsparQ DNA Frag & Library Prep Kitについてはこちらをご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


DNAライブラリーの収量比較

使用例1　他社DNAライブラリー作製キットとの収量の比較
Covaris社装置で平均250 bpにせん断したDNA試料1 ngまたは100 ngを用いて、本製品（橙）および他社製品（青、赤）によるライブラリー作製を行い、 PCR増幅をそれぞれ6サイクル、13サイクル行って得られたDNAライブラリーの収量を比較した。


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特長

  • ステップ数が少ないため、移し替えなどの操作による試料のロスが抑えられます。
  • 操作はわずか2.5時間以内に完了します。
  • PCR増幅を行わない場合は100 ngのDNAから、PCR増幅を行う場合には250 pgのDNAから作製することができ、少量のDNAから得られるライブラリーの収量を増大できます（使用例2参照）。
  • 構築が困難な配列を含む領域の読み取り深度を向上させ、バイアスを抑えた結果が得られます（使用例3参照）。
  • 適応試料量：0.25～1,000 ng DNA

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操作方法概略

操作方法概略
  1. 断片化DNAの末端修復を行い、dA-tailを付加する。
  2. アダプターを付加し、精製する（必要な場合はPCR増幅を行い、精製する）。

※ 最終産物は、次世代シークエンシングに直接用いることができる。


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使用例

使用例2：PCR増幅無しでも高収量でライブラリー調製が可能

PCR増幅を行わなかったライブラリーの定量

Covaris社装置でせん断したさまざまな量のDNA試料を用いて本製品でライブラリー調製を行い、その際にアダプター付加後のPCR増幅を行わなかった。得られたライブラリーを蛍光法で定量した。


使用例3：AT/GC領域の違いによる読み取り深度の比較

AT-richまたはGC-rich領域の読み取り深度比較

本製品（橙）および他社製品（青、赤）を使用して得られたライブラリーを使用して次世代シークエンシング解析を行い、AT-richまたはGC-rich領域の読み取り深度を比較した。


使用例4：幅広いGC含量のDNA試料からのライブラリー調製

中GC含有試料からのライブラリー調製
低GC含有試料からのライブラリー調製

高GC含有試料からのライブラリー調製

さまざまなGC含量のDNA試料100 ngから本製品でライブラリー調製を行った。アダプター付加後にsparQ HiFi PCR Master MixでPCR増幅を行った場合（橙）およびPCR増幅を行わなかった場合（青）で読み取り深度を比較した。標的ゲノムのGC含量分布をグレーの線で示した。



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ビデオチュートリアル

下記画像をクリックするとsparQ DNA Library Prep Kitのビデオチュートリアルをご覧になれます（英語版、約10分）。

sparQ DNA Library Prep Kitのビデオチュートリアル


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アプリケーションノート

Quantabio社が提供する技術情報です。クリックするとpdfファイルまたはエクセルファイルがダウンロードできます。

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キット内容

  • DNA polishing enzyme mix
  • DNA polishing buffer
  • DNA ligase
  • DNA rapid ligation buffer
  • HiFi PCR master mix
  • Primer mix

※ キットにはアダプター付加後およびPCR増幅後のDNA精製に必要なSPRIビーズは含まれていません。別途ご用意下さい。sparQ PureMag Beadsの使用をお奨めします。また、sparQ PureMag Beadsを用いたDNAクリーンアップとサイズセレクションに関するアプリケーションノート（英語版、3ページ）についてはこちらをご覧下さい。
※ キットにはアダプターオリゴヌクレオチド：sparQ UDI Adaptersは含まれていません。別途ご用意下さい。


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価格

[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
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sparQ DNA Library Prep Kit (24reactions)
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 2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 5
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説明文
極微量な断片化した二本鎖DNAから，DNAライブラリーを2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.16

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極微量な断片化した二本鎖DNAから，DNAライブラリーを2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。
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掲載カタログ ニュース2021年10月1日号 p.14

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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]

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sparQ DNA Library Prep Kit (24reactions)

文献数： 5

説明文 極微量な断片化した二本鎖DNAから，DNAライブラリーを2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。
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文献数： 5

説明文 極微量な断片化した二本鎖DNAから，DNAライブラリーを2ステップの簡便な操作で迅速に作製できるキット。作製したライブラリーは，Illumina社次世代シークエンサー（NGS）での解析に使用可能。
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[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]

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sparQ PureMag Beads
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溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。
法規制等
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溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。
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溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。
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文献数： 0

説明文 溶液からDNA/RNAの精製とサイズ選択が可能な磁気ビーズ。磁気ビーズの比率に応じて，回収するフラグメントの長さを調整することが可能。次世代シークエンシング(NGS)用ライブラリーの調製に有用。
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sparQ UDI Adapters

[在庫・価格 ：2025年04月25日 16時15分現在]

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sparQ UDI Adapters (1-96)
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説明文
Illumina社プラットフォーム用のNGS（次世代シークエンシング）ライブラリーのデュアルインデックスアダプター。sparQ DNA library prep kits(#95191-024), sparQ DNA Frag & Library Prep Kit(#95194-024)との使用を推奨。
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sparQ UDI Adapters (1-96)

文献数： 0

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説明文 Illumina社プラットフォーム用のNGS（次世代シークエンシング）ライブラリーのデュアルインデックスアダプター。sparQ DNA library prep kits(#95191-024), sparQ DNA Frag & Library Prep Kit(#95194-024)との使用を推奨。
法規制等
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お問い合わせ先

（テクニカルサポート 試薬担当）

reagent@funakoshi.co.jp

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