黒ボク土からも高収率でDNAを抽出! Extrap Soil DNA Kit Plus Ver.2
掲載日情報:2021/04/01 現在Webページ番号:64530
Extrap Soil DNA Kit Plusは、土壌、活性汚泥などの広範な環境試料から高純度の微生物DNAを抽出・精製するキットです。環境試料に存在する微生物の群集構造解析やリアルタイム定量PCRなどのアプリケーションに適しています。
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特長
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操作方法概略
細胞破砕(ビーズビーティング) | |
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(1) Bead tubeに土壌試料0.5g、Extraction buffer、Lysis solutionを添加し、ビーズビーティング*3(30~45秒間)。 | |
(2) 遠心(5分)、上清採取。 | |
↓ | |
タンパク質除去 | |
(3) PP solutionを添加し、遠心(5分)、上清採取 | |
↓ | |
磁気ビーズによる精製 | Maelstrom Switch 8 による自動化が可能*2 |
(4) MBs solution、Binding solutionを添加し、撹拌(2分)、集磁、上清廃棄。 | |
(5) Washing solutionを添加し、撹拌、集磁、上清廃棄。 | |
(6) 70%エタノールを添加し、撹拌、集磁、上清廃棄。 | |
↓ | |
DNA溶出 | |
(7) 風乾後、溶出液を添加し、65℃で5~10分加温。 | |
(8) 集磁、上清採取 → total DNA。 |
*2 自動化の例はこちらをご覧下さい。
*3 ビーズビーティングには、FastPrep24 Instrumentなどのビーズ式破砕装置(試料・細胞破砕装置)をご使用下さい。また、ボルテックスアダプター(Voltex Adapter for Voltex-Genie 2(キアゲン社製))を装着したボルテックスミキサーでも破砕可能です。
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使用例
DNA抽出効率の比較
一般的にDNA抽出が困難とされる土壌について他社キットとの比較試験を実施した。Extrap Soil DNA Kit Plus Ver2と他社キット3種について7種の土壌でDNA抽出を行った結果、すべての土壌において、他社製品と同等以上の測定値が得られた。Extrap Soil DNA Kit Plus Ver2は土壌に限らず、多種多様な環境試料から高純度・高収量でDNAを回収することができる。
PCR阻害物質除去効果の比較
土壌種 | Extrap | A社 | B社 | C社 |
---|---|---|---|---|
黒ボク土 火山灰(神奈川県) | 0.6 | 0.2 | 0.1 | 0.8 |
黒ボク土 火山灰(栃木県) | 0.6 | 0.9 | 0.7 | 0.6 |
赤黄色土 非火山灰(山口県) | 0.8 | 0.7 | 0.8 | 0.8 |
灰色低地土 水田(東京都) | 0.9 | 0.1 | 0.4 | 1.1 |
褐色森林土(新潟県) | 1.0 | 1.3 | - | 1.1 |
砂質、川砂(栃木県) | 0.7 | 0.1 | 0.3 | 0.01 |
油汚染土壌 | 0.6 | 0.7 | 1.0 | 0.6 |
平均 | 0.74 | 0.57 | 0.55 | 0.72 |
無希釈DNA試料の定量値÷100倍希釈DNA試料の定量値
PCR阻害がなければ1に近く、値が小さいほどPCR阻害が大きい。0.5以下を赤文字で示した。実験結果より、ExtrapのPCR阻害物質の除去効果は、他社キットと比較して同等以上であることを確認できた。
※ 他の使用例、比較例については、こちらのPDFをご覧下さい。
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キット内容
- Bead tube
- Extraction buffer
- Lysis solution
- PP solution
- MBs solution
- Binding solution(DNA回収用磁気ビーズ)
- Washing solution
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BDL社製品のご案内
それぞれの画像をクリックすると該当製品の詳細をご覧になれます。
RIPA不溶性タンパク質から 温和にタンパク質抽出 |
従来法より優れたパルミトイル化 タンパク質の精製・解析Kit |
泳動中でも!転写後も! 色付きで見やすいタンパク質マーカー |
電気泳動の分離能UP! スピードUP! |
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関連製品:6本のチューブを同時に処理できるマグネティックスタンド
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価格
[在庫・価格 :2025年01月14日 08時35分現在]
詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Extrap Soil DNA Kit Plus Ver.2 (50reactions) |
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[在庫・価格 :2025年01月14日 08時35分現在]
Extrap Soil DNA Kit Plus Ver.2 (50reactions)
文献数: 0
- 商品コード:212-006
- メーカー:BDL
- 包装:1kit
- 価格:¥47,000
- 在庫:3個以上
- 納期:2~3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | 土壌,活性汚泥などの環境試料から微生物DNAを抽出・精製するキット。菌体の破砕法としてビーズビーティングを採用しており,広範な微生物種の細胞を破砕してDNAを得ることができる。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
掲載カタログ |
ニュース2023年2月1日号 p.20 ニュース2023年7月1日号 p.25 ニュース2024年11月15日号 p.6
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製品記事 | JBI社Extrap Soil DNA Kit Plus Ver.2製造元変更のご案内 バイオダイナミクス研究所 製品特集 |
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