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非変性アガロースゲルでのRNA電気泳動が簡単に行えるバッファーとマーカーのセット DynaMarker® RNA High for Easy Electrophoresis

掲載日情報:2017/08/28 現在Webページ番号:898

変性アガロースゲルだけでなく非変性アガロースゲルでのRNA電気泳動を容易にする独自のローディングバッファーと,RNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)のセットです。

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特長

  • 添付の RNA Loading Buffer AG+にホルムアルデヒドを加えるだけで,ホルムアルデヒド変性ゲルのみならず,1×TAE や 0.5×TBEの非変性ゲルでのRNA電気泳動が容易にできます。
  • DynaMarker® RNA High AGNは DynaMarker® RNA High と同種類の, 200, 500, 1,000, 1,500, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 8,000塩基のRNAから構成されています。
  • 各バンドのRNA濃度は0.1μg/μlに調製されているため,バンドの濃淡の比較によって試料 NAの量が概算できます。
DynaMarker RNA High for Easy Electrophoresisの電気泳動図

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ゲルローディング液の調製法

  1. 本製品の RNA Loading Buffer AG+とホルムアルデヒドを混合し,ホルムアルデヒド添加RNA Loading Buffer AG+を作製する。
  2. 作製したホルムアルデヒド添加RNA Loading Buffer AG+をDynaMaker® RNA High AGN または RNA 試料と混合し,熱処理して,電気泳動に供する。

本製品には含まれていません。

ホルムアルデヒド変性アガロースゲルと非変性アガロースゲルとの比較

DynaMarker® RNA High AGN(0.45μg/well:左端)と,ヒト組織全RNA(0.4μg/well)を,RNA loading buffer AG+(ホルムアルデヒド添加済み)で調製した後,各アガロースゲルで電気泳動を行った。変性ゲルおよび非変性ゲルのいずれでも同様の泳動パターンを示した。

  • ホルムアルデヒド変性アガロースゲル:1×MOPS, 1%アガロース
  • 非変性アガロースゲル:1×TAE, 1.3%アガロース

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キット内容

  • RNA loading buffer AG+
  • DynaMarker® RNA High AGN(約25ローディング分)

[在庫・価格 :2021年09月18日 00時14分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
DynaMarker, RNA High for Easy Electrophoresis
2~3週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
非変性アガロースゲルでの電気泳動にも使用可能なRNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)。RNA断片のサイズ:200, 500, 1,000, 1,500, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 8,000 base,形状:溶液,容量:25μg/28μl,セット内容:DynaMarker RNA High AGN(0.9 mg/ml),RNA loading buffer AG+(1 ml)
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年5月1日号 p.25
ニュース2021年2月15日号 p.26

製品記事 バイオダイナミクス研究所 製品特集
RNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)選択ガイド
関連記事

[在庫・価格 :2021年09月18日 00時14分現在]

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DynaMarker, RNA High for Easy Electrophoresis

文献数:0

説明文 非変性アガロースゲルでの電気泳動にも使用可能なRNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)。RNA断片のサイズ:200, 500, 1,000, 1,500, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 8,000 base,形状:溶液,容量:25μg/28μl,セット内容:DynaMarker RNA High AGN(0.9 mg/ml),RNA loading buffer AG+(1 ml)
法規制等
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掲載カタログ ニュース2021年5月1日号 p.25
ニュース2021年2月15日号 p.26

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お客様ご使用例
様々なRNA サンプルのサイズ確認・解析に

東京工業大学・情報生命博士教育院特任助教黒川裕美子先生

黒川裕美子先生

細胞内の解析をしていると,研究テーマが意外な分野と繋がることがある。数年前,ふとしたきっかけで急にRNAの解析をすることになった。これまでDNA結合タンパク質の解析をメインにしていたため,DNAの扱いには慣れていたが,どうしてもRNAとなるとハードルが高い。昔と違い,今は簡便な精製キットやin vitro 転写キットのおかげで高純度なRNAが簡単に調製できる。
しかし,問題はその後である。調製したRNAのサイズを正確に調べるためには変性条件が必要であり,ホルムアルデヒド入りのアガロースゲルを用いた電気泳動をする必要がある。吸引毒性のあるホルムアルデヒドの使用は,取り扱いや使用後の処理に注意が必要であり,正直なところ多用は避けたい。泳動バッファーも普段使わないMOPSバッファーを調製し,かつ,RNAの分解にも注意が必要である。うん,やっぱりRNA実験はやめよう。いやちょっと待って,もしかしたら大発見の可能性も,そういえば先週届いたフナコシニュースに確か…
そうして出会ったのがこのDynaMarker® RNA High for Easy Electrophoresis(BioDynamics Laboratory社)だった。
ホルムアルデヒドを付属のRNA Loading Buffer AG+と使う分だけ混合し,RNAマーカーやRNAサンプルに加えて熱処理するだけ。あとはDNA実験のときと同じようにいつものアガロースゲルでいつものTAEバッファーで電気泳動。そんな巧い話があるかと最初は半信半疑だったが,実際のデータを見てもらえば一目瞭然。分離もクリアで泳動もシャープなRNAマーカーによってtotal RNA やin vitro転写で合成したRNA断片のサイズまで正確に同定できている。使用するホルムアルデヒドもごくごく少量。これを知ったおかげで,実験のフットワークが軽くなり,臆することなくRNA実験ができるようになった。おかげで現在までにいくつかの新しい知見が得られている。またこの実験以外にも普段のノーザンブロッティングにも使用している。安全性を考えると学生実験では特にお勧めしたいイチオシの製品だ。

■実験方法

  1. 18S rRNA の部位特異的な機能を解析するため,in vitro転写で各領域のRNA 断片を合成
  2. 精製後の各RNA断片をDynaMarker® RNA High for Easy Electrophoresisを用いてアガロースゲル電気泳動
  
写真1. in vitro転写で合成した18S rRNAの各領域断片の電気泳動 写真2. 大腸菌と分裂酵母それぞれから精製したtotal RNA の電気泳動
in vitro 転写で合成した18S rRNAの各領域断片の電気泳動 大腸菌と分裂酵母それぞれから精製したtotal RNAの電気泳動

関連製品

  • 200 〜 8,000 baseのRNA断片で構成された変性アガロースゲル電気泳動用RNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)です。
  • 各RNA断片は,マーカー 1 μlあたり,約 0.1 μgに調製されています。

[在庫・価格 :2021年09月18日 00時14分現在]

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詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
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  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
DynaMarker, RNA High
2~3週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
RNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)。ミニゲル約120レーン分。形状:溶液,RNA断片のサイズ:200, 500, 1,000, 1,500, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 8,000 base,容量:50μg/56μl(0.9 mg/ml)
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年4月15日号 p.23
ニュース2019年5月1日号 p.27

製品記事 DynaMarker(R) RNA Ladder Marker
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[在庫・価格 :2021年09月18日 00時14分現在]

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DynaMarker, RNA High

文献数:0

説明文 RNA分子量ラダーマーカー(RNA Ladder Marker)。ミニゲル約120レーン分。形状:溶液,RNA断片のサイズ:200, 500, 1,000, 1,500, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 8,000 base,容量:50μg/56μl(0.9 mg/ml)
法規制等
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年4月15日号 p.23
ニュース2019年5月1日号 p.27

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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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