[CRISPR-Cas9]レンチウイルスによりCas9およびguideRNAを発現させるシステム Lentiviral CRISPR / Cas9 System
掲載日情報:2015/05/22 現在Webページ番号:53108
レンチウイルスによりCas9およびguideRNAを発現させるCRISPR / Cas9システムです。
※レンチウイルスベクターのウイルスパッケージングはLentiStarter 2.0 Kit (#LV051A-1)がお勧めです。 |
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レンチウイルス発現用CRISPR / Cas9システム製品ラインナップ
Cas9(野生型または変異型)と、導入した任意のガイドRNAを一つのベクターで発現できるオールインワンシステムと、Cas9とガイドRNAをそれぞれのベクターで発現するシステムがあります。
野生型ヒトCas9(hspCas9 wt)発現用 | ||||||
プロモーター | マーカー | Cas9発現用 レンチウイルスベクター |
Cas9発現用 レンチウイルス粒子 |
All-in-one レンチウイルスベクター |
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シングル | CMV | Puro | CASLV100PA-1 | CASLV100VA-1 | CASLV300PA-1 | |
MSCV | Puro | CASLV120PA-1 | CASLV120VA-1 | CASLV320PA-1 | ||
デュアル | CMV | EF1a | copGFP | CASLV105PA-1 | CASLV105VA-1 | |
MSCV | EF1a | copGFP | CASLV125PA-1 | CASLV125VA-1 | ||
変異型(D10A)ヒトCas9(hspCas9(D10A)mut、Nickase)発現用 | ||||||
プロモーター | マーカー | Cas9発現用 レンチウイルスベクター |
Cas9発現用 レンチウイルス粒子 |
All-in-one レンチウイルスベクター |
||
シングル | CMV | Puro | CASLV200PA-1 | CASLV200VA-1 | CASLV400PA-1 | |
MSCV | Puro | CASLV220PA-1 | CASLV220VA-1 | CASLV420PA-1 | ||
デュアル | CMV | EF1a | copGFP | CASLV205PA-1 | CASLV205VA-1 | |
MSCV | EF1a | copGFP | CASLV225PA-1 | CASLV225VA-1 |
ガイドRNA(gRNA)発現用 | ||||
プロモーター | マーカー | gRNA発現用 レンチウイルスベクター |
||
デュアル | EF1a | H1 | Blasticidin R | CASLV500PA-B |
EF1a | H1 | copGFP | CASLV501PA-G | |
EF1a | H1 | RFP | CASLV502PA-R | |
EF1a | U6 | Blasticidin R | CASLV510PA-B | |
EF1a | U6 | copGFP | CASLV511PA-G | |
EF1a | U6 | RFP | CASLV512PA-R |
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プラスミドマップ
Cas9とguide RNAを同時に発現するAll-in-oneタイプのレンチウイルスベクター
Cas9発現用レンチウイルスベクター
Cas9発現用レンチウイルスベクター(デュアルプロモータータイプ)
guide RNA発現用レンチウイルスベクター
■Cas9 Nuclease(D10A)とは
Cas9の変異体D10Aは、Nickaseとして機能することが報告されています*1。
Cas9(D10A)は、野生型Cas9のようにDNA二本鎖を切断せず、一本鎖のみを切断しニックを入れます。
そのため、二本鎖切断により引き起こされるDNA修復機構NHEJ(非相同末端再結合)が起こらず、望ましくない領域での遺伝子欠失・挿入やオフターゲット効果を抑制することができます*2。
また、最近ではペアのニックにより、細胞株におけるオフターゲット効果を50~1,500倍まで減少できた例が報告されています*3。
*1Jinek, M., et al., Science, 17, 337(6096), 816~821 (2012).
*2Cong, L., et al., Science, 15, 339(6121), 819~823 (2013).
*3Ran, F. A., et al., Cell, 12, 154(6), 1380~1389 (2013).
図:標的部位のアンチセンス鎖に対するguide RNA 1とセンス鎖に対するguide RNA 2を作製し、Cas9(D10A)を用いてペアでニックを入れ、ゲノム編集の効率を向上させる。
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使用例
GFP およびRFP を安定発現するHEK293T 細胞に、MSCV-Cas9-T2A-Puro(#CASLV120VA-1)およびEF1α-Blasticidin-H1-RFP gRNA(#CASLV500PA-B にRFP に対するgRNA 配列を挿入)を導入し、蛍光を観察した。
ヒトiPS 細胞をMSCV-hspCas9-EF1-copGFP レンチウイルス粒子(#CASLV125VA-1) で処理し、6 日間培養後、蛍光を観察した。
MCF-7 乳がん細胞をCMV-hspCas9-T2A-Puro レンチウイルス粒子(#CASLV100VA-1) で処理し、ピューロマイシンで10 日間培養後、顕微鏡で細胞の増殖を観察した。
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FAQ
A-1. 以下の改善点が挙げられます。
1) 形質転換効率をが高いコンピテントセルを使用して下さい。
例:形質転換効率> 1 × 109 CFUs/μg of pUC18 plasmid
2) プラスミドが損傷する可能性があるため、保存したプラスミドの凍結融解は行わないで下さい。プラスミドは、1 ~ 2 週間程度の短期間の冷蔵保存、または反応ごとに別チューブに分注し、- 20℃での保存をお勧めします。
※ 上記の方法で解決できない場合は、当社テクニカルサポート(試薬担当)までお問い合わせ下さい。
A-2. 作製したgRNA の切断効率の予測はできないため、最適な結果を得るために、2 種類以上のgRNA コンストラクトの作製をお勧めします。
A-3. 以下の点が原因として考えられます。
1) HEK293T 細胞の密度が高すぎる、または低すぎるため、トランスフェクション効率が低くなった可能性があります。トランスフェクションの際に、プレート中の細胞密度が50 ~ 80%になるように調節して下さい。
2) 293T 細胞の品質が悪かったため、偽ウイルス粒子の産生が不十分であった可能性があります。以下の点を参考に、生育条件の最適化を行って下さい。
・増殖培地を再確認して下さい。
・細胞の継代数が20 回以上でないことを確認して下さい。
・細胞がマイコプラズマ感染していないことを確認して下さい。
・ 細胞を増殖させすぎていないか確認して下さい(培養を対数増殖期に維持するため、細胞密度を90%以上にしないようにして下さい)。
3) 偽ウイルス粒子を含む細胞培養上清の回収タイミングが早すぎた、または遅すぎた可能性があります。培養上清は少なくとも2 度回収して下さい(トランスフェクション後48 時間および72 時間の時点)。回収した上清を合わせて、ウイルスの濃縮を行って下さい。PEG 沈殿によるウイルス粒子濃縮用試薬 PEG-it reagent(#LV810A-1, #LV825A-1)の使用をお勧めします。
4) 使用しているCas9/Nickase レンチベクターが、パッケージング効率の限界に近づいている可能性があります。
レンチウイルスシステムにおけるパッケージングでは、レンチベクターの5'LTR-3'LTR 間は8.5 kb までが限界です(Cas9/Nickase ベクターは8 kb までが限界)。cDNA インサートのサイズが2 kb 以上になると、パッケージング効率は著しく低下します(Cas9/Nickase ベクターでは、4 kb までのインサートサイズをパッケージング可能)。3 kb を組み込んだ場合は、1 kb の場合に比べ、パッケージング効率が1/10 以下になることがあります。これを回避するためには、パッケージングする細胞のプレート数を増やして、十分量のCas9/nickase ウイルスを得られるようにして下さい。
A-4. 下記のような原因が考えられます。
1) 標的細胞での形質導入効率が低かった可能性があります。特定の細胞(初代細胞、幹細胞、浮遊細胞など)においては、形質導入は必ずしも高効率ではありません。そのような場合は、30 ~ 50の高い感染多重度(MOI)での感染や、Spin-Inoculation による強制的ウイルス感染をお勧めします。またT 細胞などの細胞型では、効率的な形質導入のために、G0 期から人工的に刺激を与える必要がある場合もあります。
2) gRNA のデザインにミスがあった可能性があります。設計上の規則に従って正確にオリゴDNA を合成したかどうか再確認して下さい。
3) 標的DNA 配列に変異の可能性があります。
標的DNA 配列に変異があった場合、gRNA 配列の認識に影響を与え、切断の失敗につながります。予め標的DNA 配列の変異の存在を知ることは難しいですが、もし何度も切断が失敗するようであれば、他のgRNA 配列を使用するか、gRNA 設計前に標的ゲノム配列の検証が必要です。
4) アッセイ前の時間の長さに問題がある可能性があります。DNA 標的の切断に際し、感染後最低でも72 時間経過後にアッセイを始めることを推奨しています。しかし、場合によっては、十分な切断の効果を見るため、感染後7 ~ 10 日間待った方が良いこともあります。
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セーフハーバー(AAVS1)ノックイン用
セーフハーバー(AAVS1)に対するガイドRNA、hspCas9(野生型)、Puromycin耐性遺伝子が組み込み済みのレンチウイルスベクター/レンチウイルス粒子です。
[在庫・価格 :2025年01月24日 19時35分現在]
詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||
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CMV-hspCas9-T2A-Puro-H1-AAVS1 gRNA SmartNuclease Lentivector Plasmid |
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0 | |||
CMV-hspCas9-T2A-Puro-H1-AAVS1 gRNA SmartNuclease Pre-Packaged Lentiviral Particles [>10^6 IFUs] |
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0 | |||
[在庫・価格 :2025年01月24日 19時35分現在]
CMV-hspCas9-T2A-Puro-H1-AAVS1 gRNA SmartNuclease Lentivector Plasmid
文献数: 0
- 商品コード:CASLV601PA-1
- メーカー:SBI
- 包装:10μg
- 価格:¥225,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
CMV-hspCas9-T2A-Puro-H1-AAVS1 gRNA SmartNuclease Pre-Packaged Lentiviral Particles [>10^6 IFUs]
文献数: 0
- 商品コード:CASLV601VA-1
- メーカー:SBI
- 包装:2x25μl
- 価格:¥150,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:カルタヘナ該当品
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[在庫・価格 :2025年01月24日 19時35分現在]
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文献数: 0
- 商品コード:LV810A-1
- メーカー:SBI
- 包装:100ml
- 価格:¥80,000
- 在庫:無(発注済)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | レンチウイルスのポリエチレングリコール(PEG)沈殿による濃縮を簡便に行える試薬。本製品100 mlで400 mlの培養上清からウイルス濃縮が行える。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 4℃ | 法規備考 | |
掲載カタログ |
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- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | レンチウイルスのポリエチレングリコール(PEG)沈殿による濃縮を簡便に行える試薬。本製品100 mlで400 mlの培養上清からウイルス濃縮が行える。 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 4℃ | 法規備考 | |
掲載カタログ |
ニュース2024年1月合併号 p.23
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