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多数の細胞・オルガノイド試料から迅速・簡便にNGSライブラリーを調製できるキット MERCURIUS DRUG-seq Library Preparation Kit

掲載日情報:2024/07/09 現在Webページ番号:71769

哺乳動物細胞やオルガノイドの多数の試料からRNAを抽出することなく、3' mRNAシークエンシング用NGSライブラリーを迅速・簡便に調製するキットです。BRB-seq Technologyを用いて、逆転写のステップでcDNAに固有のバーコード配列を組み込むため、以降のステップは1本のチューブに多数の試料をプールして操作することができます。 使用対象のNGS機器は、イルミナ社のシステムとElement Biosciences社のAVITIシステムです。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

MERCURIUS DRUG-seq Library Preparation Kitについて

標準的なRNA-seqはまず個々の試料からRNAを抽出し、RNA試料ごとにNGS用のライブラリー調製を行います。このような手法では、多数の試料解析に時間と労力を要します。しかし、本キットはBRB-seq Technology(Bulk RNA Barcoding and sequencing Technology)*1に基づいた3'mRNA-seq法を用いており、時間と労力を抑えたハイスループット化が可能です。
本キットには、哺乳動物細胞あるいはオルガノイド/スフェロイド試料に最適化された溶解試薬および逆転写反応試薬が含まれているため、RNA抽出操作が必要ありません。cDNA合成にバーコード付きプライマーを用いて各試料に対してタグ付加を行うことで、それ以降のステップは1本のチューブにプールして実施することができます(BRB-seq Technology*1)。そのため、複数の薬剤や実験条件で処理された数百のバルクRNA試料は、1つのライブラリーを調製するだけで解析が可能になります。

*1 BRB-seq technologyの詳細についてはこちらをご覧下さい。

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操作方法概略

操作法概略

各細胞を溶解し、BRB-seq oligoを用いて96あるいは384ウェルプレートで逆転写反応を行い、一本鎖cDNAを合成します。この反応で、各試料に対して固有のバーコード配列をcDNA鎖に組込み、以降のステップは1本のチューブにプールして、二本鎖cDNAの合成、タグ付加、増幅操作とNGSライブラリーの調製反応を行います。


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特長

  • 最適化された細胞溶解条件および効率的な逆転写反応により、RNA抽出をすることなくライブラリー調製ができます。
  • BRB-seq法により逆転写反応後の試料を1本のチューブでまとめて処理することが可能なため、操作時間および手間を大幅に省くことができ、迅速に3'mRNA-seq用ライブラリーが構築できます。
  • さまざまな試料数に応じたキットがあります(96、96×4、384、384×4 reactions)。
  • 哺乳類動物細胞およびオルガノイド/スフェロイド用の製品があります。

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DRUG-seq Library Preparation Kitのラインナップ

キット名をクリックすると、該当製品の価格表にページ内ジャンプします。

キット名 DRUG-seq Kit Organoid DRUG-seq Kit
適用試料 哺乳類動物細胞 オルガノイド/スフェロイド
反応に必要な試料量(/well)*2 2,000~50,000 細胞 2,000~50,000 細胞

*2 プールする試料数やウェル数によって変化します。実際に必要な量は各製品のデータシートをご確認下さい。


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使用実績がある細胞(DRUG-seq Kit)

細胞名 由来種 由来組織
A375 ヒト 皮膚、悪性黒色腫
GM12878 PBMC、リンパ芽球系
H295R 副腎、がん腫
HAP1 KBM-7細胞株由来慢性骨髄性白血病
hASC 患者由来脂肪間質細胞
hASC-Adipocytes hASCから分化させた脂肪細胞
HEK293 腎臓胚
HeLa 子宮頸部、腺がん
HepG2 肝臓、がん
Huh7 肝臓、がん
iNeurons iPS細胞から分化させた神経細胞
MCF-7 乳房、腺がん
PANC-1 膵臓、がん
U2OS 骨、骨肉腫

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使用例(DRUG-seq Kit)

本製品を用いたライブラリー調製

操作法概略

DRUG-seq Kitを用いて384試料から調製したライブラリーのシークエンシングを行った。検出された遺伝子数については、図中に示したそれぞれのCPM(counts per million)の閾値を超えている場合に検出されたと見なす。各試料において概ね均一に12,000以上の遺伝子が検出された。平均リード数:150万。


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価格

DRUG-seq Kit(哺乳動物細胞用)

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※1回の注文につき15万円の輸送費が別途必要となります。輸送費は品数に依らず一律です。 多数の細胞試料からRNA精製不要で3'mRNA-seqライブラリーを調製するキット(イルミナ用およびAVITI用)。多検体のライブラリー調製をまとめて1本のチューブ内で実施でき、操作の手間を大幅に削減する。
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Organoid DRUG-seq Kit(オルガノイド/スフェロイド用)

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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