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本物のヒト糞便試料から調製したマイクロバイオーム解析用標準品 ZymoBIOMICS Fecal Reference with TruMatrix Technology

掲載日情報:2021/07/19 現在Webページ番号:68308

健常なヒト成人のドナーから提供された糞便試料中の微生物を不活性化して調製したマイクロバイオーム解析用の標準品(スタンダード)です。次世代シークエンシング(NGS)を用いた微生物叢・微生物相およびメタゲノミクス研究において,信頼性高い標準品として使用できます。
微生物の菌体またはDNAを混合・調製したMicrobial Community Standardシリーズについてはこちらをご覧下さい。
ZymoBIOMICSの全プロセスの製品構成についてはこちらをご覧下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


Fecal ReferenceのDNAプロファイル

本製品のメタゲノミック(DNA)プロファイル解析
本製品からZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit(#D4300)を用いてDNA抽出後,Illumina DNA Prep Kitを用いてショットガンライブラリーを調製し,NovaSeqでシークエンシングを行った。バイオインフォマティクス解析は,Zymo Reseach社のZymoBIOMICS Metagenomics Service Pipelineで行い,Centrifuge(v1.0.4)を用いて分類学上の同定を行った。

Fecal ReferenceのRNAプロファイル

本製品のメタトランスクリプトミック(RNA)プロファイル解析
本製品からZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit(#R2001)を用いてRNA抽出後,Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (#R3003)を用いてライブラリーを調製し,HiSeqでシークエンシングを行った。バイオインフォマティクス解析は,Zymo Reseach社のZymoBIOMICS Metatranscriptomics Service Pipelineで行い,Centrifuge(v1.0.4)を用いて分類学上の同定を行った。


特長

  • 健常なヒト成人のドナーから提供された糞便から,The BioCollective社のTruMatrixテクノロジーにより調製されており,細菌,真菌,古細菌を含む数百種の微生物が含まれた実際の便の多様性を再現しています。
  • 製品はDNA / RNA Shieldにより病原体が完全に不活性化されています。また,保管中に微生物のプロファイルが変わることもなく,凍結融解サイクルによる劣化から保護されています。
  • マザーロットのサイズが極めて大きく(数百万preps分),組成のばらつきを最小限に抑えるために均質化されており,すべてのマイクロバイオーム研究者にとっての信頼できる標準品となります。
  • マイクロバイオーム研究で,一連の実験における一貫性の確認と,他者の研究との比較を可能にします。
  • ターゲット,メタゲノミック,メタトランスクリプトミックシークエンシングを用い,深い読み取り深度でプロファイル解析が行われています。

核酸抽出時のバイアスを最小限に抑えるために,DNA抽出にはZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit(#D4300)を,RNA抽出にはZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit(#R2001)を使用することをお勧めします。


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製品仕様

  • 濃度:10 mg Faces (wet weight) / 1 ml product
  • Total DNA濃度:6μg DNA / 1 ml product
  • Total RNA濃度:11μg RNA / 1 ml product

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再現性の確認

Fecal ReferenceのDNA解析の再現性

本製品のメタゲノミック(DNA)解析時の再現性
本製品からZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit(#D4300)を用いてDNA抽出後,Illumina DNA Prep Kitを用いてショットガンライブラリーを調製し,NovaSeqでシークエンシングを行った。バイオインフォマティクス解析は,Zymo Reseach社のZymoBIOMICS Metagenomics Service Pipelineで行い,Centrifuge(v1.0.4)を用いて分類学上の同定を行った(実施回数6回)。


Fecal ReferenceのRNA解析の再現性

本製品のメタトランスクリプトミック(RNA)解析時の再現性
本製品からZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit(#R2001)を用いてRNA抽出後,Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit (#R3003)を用いてライブラリーを調製し,HiSeqでシークエンシングを行った。バイオインフォマティクス解析は,Zymo Reseach社のZymoBIOMICS Metatranscriptomics Service Pipelineで行い,Centrifuge(v1.0.4)を用いて分類学上の同定を行った(実施回数5回)。


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価格

[在庫・価格 :2021年07月23日 20時05分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
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納期 文献数
ZymoBIOMICS Fecal Reference with TruMatrix Technology Kit (10 preps)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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保存条件 法規備考
掲載カタログ

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ZymoBIOMICS Fecal Reference with TruMatrix Technology Kit (10 preps)

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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