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第3世代ロングリードシークエンシングに適した長鎖DNAを精製するキット Quick-DNA HMW MagBead Kit

掲載日情報:2019/12/13 現在Webページ番号:68155

Zymo Research社DNA精製ロゴ

幅広い試料から最大150 kbの高分子量DNAを抽出する,磁気ビーズベースの精製キットです。第3世代ロングリードシークエンシング(Pacific Biosciences社装置(SMRT Sequencing)およびOxford Nanopore Technologies社装置)によるDNAシークエンシングへの使用に最適です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


quick-dna_hmw_magbead_kitの収量
quick-dna_hmw_magbead_kitで得られたDNAの純度

図1:高収量かつ高純度のDNA精製
本製品およびA社製品を用いて,ヒト血液(200μl),ヒト糞便(25 mg),マウス腸組織(25 mg),ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(#D6300,75μl)からそれぞれDNAを精製し,収量(左)およびA260/230(右)をNanoDrop 2000で評価した(n=2)。本製品で得られたDNAはA260/230:≧1.8の高純度であることが分かる。


特長

  • 独自のRNA除去技術により,高収量かつ高純度のDNAが得られます。
  • 血液,糞便など,抽出が困難な試料からも高純度DNAの精製を行えます。
  • 第3世代ロングリードシークエンシングのプラットフォームで検証されています。

本製品は,血清,血漿,尿試料などからのセルフリーDNA精製には適していません。Quick-cfDNA Serum & Plasma KitまたはQuick-DNA Urine Kitのご使用をお勧めします。


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仕様

適用試料 様々な細胞,固形組織,全血,唾液,生体試料,口腔細胞,唾液スワブ,糞便,マイクロバイオーム試料,DNA / RNA Shield中に保存した試料など
得られるDNAの純度 A260/230:≧1.8
得られたDNAの適用 ロングリードシークエンシング,PCR,エンドヌクレアーゼ消化,サザンブロッティング,ジェノタイピング,NGS,bisulfite変換 など
磁気ビーズのDNA結合能 10μg DNA / 50μl MagBinding beads
得られるDNAのサイズ 最大150 kb(ゲノムDNA,ミトコンドリアDNA)
プラスミド,寄生虫,バクテリア,ウイルス由来のDNAも回収される。
溶出液量 50μl DNA elution buffer / 33μl MagBinding beads

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操作方法概略

quick-dna_hmw_magbead_kitの操作方法概略

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使用例

quick-dna_hmw_magbead_kitから精製した長鎖DNAの評価

図2:様々な試料から精製した長鎖DNAの評価
本製品を用いてHeLa細胞(106 cells),マウス筋肉,脳,肝臓組織(各25 mg),ヒト・マウス全血,ヒト唾液(各200μl),およびDNA / RNA Shield(#R1100)中に保存した唾液スワブからそれぞれDNAを精製し,Agilent 2200 TapeStationでDNA鎖長を評価した(n=2)。得られたDNAは>60 kbの高分子量であることが分かる。


quick-dna_hmw_magbead_kitから精製した長鎖DNA

図3:ロングリードシークエンシングに適した長鎖DNA
本製品を用いてE. coli培養液(グラム陽性菌,~108 cells),L. monocytogenes培養液(グラム陰性菌,~108 cells),ヒト糞便(50 mg),ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(#D6300,75μl)からそれぞれDNAを精製し,Femto Pulse System(Agilent社)でDNA鎖長を評価した(n=2)。


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キット内容

各キットコンポーネント名をクリックすると,単品の価格表をご覧いただけます。