84種の遺伝子の発現量をqPCRで同時解析 SignArray
掲載日情報：2024/01/31 現在Webページ番号：68100
SignArrayは、特定のカテゴリーに関連する84種の遺伝子発現量をqPCRで同時解析できます。本製品は、各ウェルの各因子に対するqPCR用プライマーが添加されているプレート製品です。合成したcDNAと専用のqPCR用マスターミックス*1（別売り）を混合後、各ウェルに添加してqPCRを行います。
各種シグナルパスウェイ、発生・分化、細胞死、免疫機能、がん、疾患に関連した幅広いカテゴリーの製品を取りそろえています。
また、AnyGene社では、お客様の目的に合った遺伝子を選んでSignArrayを作製する☞ カスタム対応および、バイオマーカーの探索・検証のために、SignArrayを用いての☞ qPCRおよびバイオマーカーの発現解析のコンプリートなサービスをご提供しています。
＊1 qPCR用マスターミックス（Perfect Master Mix SYBR Green）は、ご使用のqPCR装置に対応した製品をお選び下さい（☞ 製品選択ガイド）。AnyGenes社では、SignArrayと同社のPerfect Master Mix SYBR Greenを併せてご使用いただくことを強く推奨しています。他社の試薬と組み合わせて使用し、結果に不具合などが生じた場合、補償の対象外となる可能性があります。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
）
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特長
- 関連84遺伝子と、ノーマライズ用8遺伝子、品質管理用4遺伝子（計96遺伝子）の発現量をわずか3時間で一度に解析できます（384プレート製品は、96遺伝子×4セット）。
- イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としたプライマーデザインにより、ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅できるため、高感度かつ特性の高い測定を行えます。
- SignArrayと、専用のqPCR用マスターミックス（Perfect Master Mix SYBR Green）は、それぞれのqPCR装置に最適化された製品があり、簡便かつ特性の高い測定を行えます。
- ☞ AnyGenes社Webサイトより、解析用ソフトウェア（Microsoft Excel対応）を無料でダウンロードでき、得られた結果の解析が容易です。
プライマーデザインについて
他社製品の多くは、プライマーの標的部位をひとつのエクソン内にデザインしているため、cDNAだけでなく、ゲノムDNAやゲノム中の偽遺伝子も増幅され、感度や特異性に問題が生じます。
一方、SignArrayは、イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としてデザインしているため、ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅でき、高感度かつ特性の高い測定を行えます。
品質管理
| プライマー効率 | 
図をクリックすると拡大します（ |
プライマー効率は、Perfect Master MixSYBR Green（PMS）を使用した厳密な品質検査により100±10％の効率を確認しています。 |
|---|---|---|
| プライマーの特異性 | 
図をクリックすると拡大します（ |
厳密なイントロンスパン設計に基づいて、全プライマーについて、融解曲線上の単一ピーク、および予想される分子量における単一ゲルバンドを示すことを確認しています。 | 再現性 | 
図をクリックすると拡大します（ |
Perfect Master Mix SYBR Green（PMS）は、信頼性および再現性が得られることを確認するため、全シグナル伝達経路研究用SignArrayにおいて、同じcDNAで試験した同じSignArray間の相関関係について検証を実施しています。 |
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製品ラインナップ
ウェブ記事番号をクリックすると製品の詳細をご覧いただけます。
| SignArrayの種別 | 研究分野 | Web記事番号 |
|---|---|---|
| Adipogenesis SignArray | 脂質生成関連 | 64915 |
| Alzheimer's Disease SignArray | アルツハイマー型認知症関連 | 65907 |
| Angiogenesis SignArray | 血管新生因子関連 | 69142 |
| Antiviral Response SignArray | 抗ウイルス応答因子関連 | 67231 |
| Apoptosis SignArray | アポトーシス因子関連 | 68089 |
| Cancer Diseases SignArray | がん関連 | 64973 |
| EMT / EndMT SignArray | 腫瘍転移関連 | 68099 |
| Epigenetics Regulation SignArray | エピジェネティック制御関連 | 68098 |
| HIF-1 Signaling Pathway SignArray | 低酸素誘導因子関連 | 69113 |
| Immune checkpoints SignArray | 免疫チェックポイント関連遺伝子 | 69104 |
| Long Non Cording RNA（LncRNA） SignArray | 長鎖非コードRNA | 67232 |
| Oxidative Stress SignArray | 酸化ストレス関連 | 68097 |
※ 上記製品以外のSignArray製品については、メーカーサイトの☞ Signaling Pathways（SignArray System）をご覧いただくか、下図の各カテゴリーをクリックしてご覧下さい。また☞ Excelファイル形式で製品リストを確認することができます。
なお、お客様の目的に合った遺伝子を選んでSignArrayを作製する☞ カスタム対応も承ります。
SignArray製品ラインナップ
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製品選択ガイド
SignArrayおよび別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenは、qPCR装置に応じた製品を取りそろえています。☞ 対応製品一覧表をご確認の上、お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。
※ qPCR用マスターミックス（Perfect Master Mix SYBR Green）は、ご使用のqPCR装置に併せてお選び下さい。
SignArrayの商品コードは、以下のように番号付けされています。☞ 対応製品一覧表または☞ Compatibility between AnyGenes SignArray system and qPCR instrumentsをご確認の上、お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。
対応製品例
LightCycler 96で、ヒトAdipogenesis SignArrayを用いる場合、SignArrayは#ADI1H1-R2S、Perfect Master Mix SYBR Greenは#PMS1-W2Sをご使用下さい。
対応製品一覧表
商品コードをクリックすると、価格表をご覧いただけます。
| 会社名 | qPCR装置名 | SignArrrays ※ qPCR装置指定コード(Y) |
Perfect Master Mix SYBR Green | ||
|---|---|---|---|---|---|
| 2×96 plates | 2×384 plates | 2×96 plates | 2×384 plates | ||
| Roche | LightCycler 96 | R | － | PMS1-W2S | － |
| LightCycler 480 | R | R | PMS1-W2S | PMS2-W2S | |
| Applied Biosystems （Thermo Fisher Scientific） |
Step One Plus Real-Time System | F | － | PMS1-R2S | － |
| ABI 5700 / 7000 / 7300 / 7700 | A | － | PMS1-R2S | － | |
| ABI 7500(Standard block) | A | － | PMS1-LR2S | － | |
| ABI 7500(Fast block)*2 | F | － | PMS1-LR2S | － | |
| ABI 7900 HT(Standard block) | A | A | PMS1-R2S | PMS2-R2S | |
| ABI 7900 HT(Fast block)*2 | F | A | PMS1-R2S | PMS2-R2S | |
| ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System(Standard block) | A | A | PMS1-LR2S | PMS2-LR2S | |
| ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Fast block)*2 | F | A | PMS1-LR2S | PMS2-LR2S | |
| Bio-Rad | iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MyiQ2 | A | － | PMS1-F2S | － |
| Chromo4, Opticon, Opticon2, CFX Connect, CFX96 | B | － | PMS1-W2S | － | |
| CFX384 | － | A | － | PMS2-W2S | |
| Eppendorf | Mastercycler ep realplex 2 / 2S / 4 / 4S | A | － | PMS1-W2S /PMS1-R2S | － |
| Stratagene （Agilent） | Mx3000P, Mx3005P, Mx4000, AriaMx | A | － | PMS1-LR2S | － |
| Techne | Quantica, PrimeQ | A | － | PMS1-F2S | － |
＊2 対応したキット（#ADI1XX-F2S）を用いた場合でも、Fast Modeでの使用には適していません。
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操作方法概略
SignArrayのワークフロー
- 細胞、組織などの生体試料からRNAを抽出する*3。
- 逆転写酵素によりcDNAを合成する*3。
- cDNAとPerfect Master Mixを混合し、qPCR Master Mixとする。
- qPCR Master MixをSignArrayに添加してqPCRを行う。
- 解析用ソフトウェアを用いてデータ解析を行う。
＊3 本製品にRNA抽出試薬やcDNA合成試薬は含まれていません。
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解析用ソフトウェアについて
☞ AnyGenes社Webサイトより、解析用ソフトウェア（Microsoft Excel対応）を無料でダウンロードでき、得られた結果の解析が容易です。
特長
- 測定結果から統計データテーブルセットおよびグラフを作成でき、迅速かつ信頼性の高い解析が行えます。
- ΔCq計算法を用いて解析を行い、選択したハウスキーピング遺伝子を用いてノーマライズします。
- 同一のExcelワークブック中に存在する最大10種の実験結果について、参照条件（コントロール、キャリブレーター）と比較することができます。
- 解析結果は、プレゼンテーションや出版に使用できます。
- 主にMicrosoft Excel 2007以降のバージョンに対応しています。
※ Microsoft Excel 2007以前のバージョンをご使用された場合には、機能上の問題が生じる可能性があります。
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カスタムSignArray作製受託サービス
SignArrayは、お客様の目的に合った遺伝子を選んでSignArrayを作製するカスタム対応を承ります。
下記の項目などについてご選択の上、お問い合わせ下さい。
ご選択いただく項目例
- 遺伝子の種類と数
- プレート形状：96 platesまたは384 plates
- 動物種：ヒト、マウス、またはラット
- qPCR装置名（会社名）
- Perfect Master Mix中に含まれるReference Dyeの種類
など。詳細はメーカーサイトのカスタムSignArray作製用専用申込書（☞ Personalized AnyGenes SignArray）をご覧下さい。
ご注文方法
ご依頼内容に応じてお見積もりします。詳細は、☞ 受託・特注品担当（jutaku@funakoshi.co.jp）までお問い合わせ下さい。
カスタムSignArrayの使用文献の一例
- Velázquez, A.M., et al., "KHK, PNPLA3 and PPAR as Novel Targets for the Anti-Steatotic Action of Bempedoic Acid.″ Biomedicines, 10(7), 1517(2022). PMID:35884822
- Tétu, P., et al., "FGF2 Induces Resistance to Nilotinib through MAPK Pathway Activation in KIT Mutated Melanoma.″ Cancers (Basel), 12(5), 1062(2020). PMID:32344828
- de Moura, R.C., et al., "Intermittent Versus Continuous Dosing of MAPK Inhibitors in the Treatment of BRAF-Mutated Melanoma.″ Transl. Oncol., 13(2), 275(2020). PMID:31874374
- Louveau, B., et al., "Baseline Genomic Features in BRAFV600-Mutated Metastatic Melanoma Patients Treated with BRAF Inhibitor + MEK Inhibitor in Routine Care.″ Cancers (Basal), 11(8), 1203(2019). PMID:31426590
- Buart, S., et al., "Transcriptional response to hypoxic stress in melanoma and prognostic potential of GBE1 and BNIP3.″ Oncotarget, 8(65), 108786(2017). PMID:29312568
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バイオマーカー発現解析受託サービス
AnyGenes社では、バイオマーカーの探索・検証のために、独自のSignArrayを用いてのqPCRおよびバイオマーカーの発現解析のコンプリートなサービスをご提供しています。機器や試薬を購入する必要はありません。組織、細胞株、RNAなど、様々な生物学的試料を分析でき、以下の目的などに最適です。
- バイオマーカーの同定とバイオマーカーの検証
- 遺伝子発現のプロファイリング
- DNAマイクロアレイの検証
- 医薬品開発の基礎研究（分子作用機序、毒性、代謝など）
得られた結果は、直感的なツールに基づくデータ分析により、プレゼンテーションに最適なグラフ、広域な範囲に渡るレポートおよび比較結果としてご提供します。
詳細は、☞ 受託・特注品担当（jutaku@funakoshi.co.jp）までお問い合わせ下さい。
受託解析フローの一例
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。