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エピジェネティック制御関連遺伝子84種の発現量をqPCRで同時解析 Epigenetics Regulation SignArray

掲載日情報:2020/04/03 現在Webページ番号:68098

特定のカテゴリーに関連する84種の遺伝子発現量をqPCRで同時解析できるSignArrayの中から,エピジェネティック制御関連遺伝子解析用の製品をご紹介します。
本製品は,各ウェルに各因子に対するqPCR用プライマーが添加されているプレート製品です。合成したcDNAと専用のqPCR用マスターミックス(別売り)を混合後,各ウェルに添加してqPCRを行います。
qPCR用マスターミックス(Perfect Master Mix SYBR Green)は、ご使用のqPCR装置に併せてお選び下さい。 AnyGenes では、SignArrayと同社のPerfect Master Mix SYBR Green を併せてご使用いただくことを強く推奨しております。他社の試薬と組み合わせて使用し、結果に不具合などが生じた場合、補償の対象外となる可能性があります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


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MEMO エピジェネティック制御とがんについて

エピジェネティック制御とがんについて (クリックで開閉します)

エピジェネティクスは,遺伝子配列改変無しでの発現産物修飾により起こります。最も重要な出来事は,CpGアイランドでのDNAメチル化と,ヒストンの翻訳後修飾です1)。正常細胞において,これらの修飾は遺伝子発現調節をもたらし,そのメカニズムにはDNA methyltransferase,Histone deacetylase,Histone acetyltransferase,Sirtuin,Aurora kinaseなどといった多くの因子が関与します2, 3)。これらすべての因子が相互に作用して遺伝子発現を調節し,とりわけ全能性細胞の分化をもたらします3)


模式図

成体幹細胞の機能のエピジェネティック制御
(画像出典:参考文献4)

一方,がんにおいて,腫瘍細胞はエピジェネティクス因子を自らに有利になるように調節します。このメカニズムにより,遊走,浸潤,細胞増殖といった通常は不活性となっているシグナル伝達経路に関与する遺伝子の転写活性化が起されます5)。これらの活性化は,腫瘍抑制遺伝子および細胞周期チェックポイントなどの局所的なDNA過剰メチル化を伴う,全体的なDNA低メチル化によりもたらされます。染色体をより利用しやすくするために,ヒストンも修飾されます5)。エピジェネティックな出来事は,細胞の発がんや,転移過程における新しい組織への細胞浸潤に強く関与しています。

参考文献

  1. Kinnaird, A., et al., Nature, 16, 694~707 (2016)
    "Metabolic control of epigenetics in cancer."
  2. Chen, Q.W., et al., Oncology Reports, 31, 523~532 (2014)
    "Epigenetic regulation and cancer (Review)"
  3. Cohen, I., et al., Genes & Cancer, 2 (6), 631~647 (2011)
    "Histone Modifiers in Cancer: Friends or Foes?"
  4. Avgustinova, A., et al., Nat. Rev. Mol. Cell. Biol., 17, 194~200 (2016)
    "Epigenetic control of adult stem cell function."
  5. Sharma, S., et al., Carcinogenesis, 31 (1), 27~36 (2010)
    "Epigenetics in cancer."

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特長

  • 関連84遺伝子と,ノーマライズ用8遺伝子,品質管理用4遺伝子(計96遺伝子)の発現量をわずか3時間で一度に解析できます(384プレート製品は,96遺伝子×4セット)。
  • イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としたプライマーデザインにより,ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅できるため,高感度かつ高い特異性で測定を行えます。
  • SignArrayと,専用のqPCR用マスターミックス(Perfect Master Mix SYBR Green)は,それぞれのqPCR装置に最適化された製品があり,簡便かつ高い信頼性で測定を行えます。
  • AnyGenes社Webより,解析用ソフトウェア(Microsoft Excel対応)を無料でダウンロードでき,得られた結果の解析が容易です。

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プライマーデザインについて

他社製品の多くは,プライマーの標的部位をひとつのエクソン内にデザインしているため,cDNAだけでなく,ゲノムDNAやゲノム中の偽遺伝子も増幅され,感度や特異性に問題が生じます。一方,SignArrayは,イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としてデザインしているため,ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅でき,高感度かつ高い特異性で測定を行えます。

原理

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品質管理

プライマー効率 プライマー効率は,Perfect Master MixSYBR Green(PMS)を使用した厳密な品質検査により100±10%の効率を確認しています。
プライマーの
特異性
厳密なイントロンスパン設計に基づいて,全プライマーについて,融解曲線上の単一ピーク,および予想される分子量における単一ゲルバンドを示すことを確認しています。
再現性 Perfect Master Mix SYBR Green(PMS)は,信頼性および再現性が得られることを確認するため,全シグナル伝達経路研究用SignArrayにおいて,同じcDNAで試験した同じSignArray間の相関関係について検証を実施しています。

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操作方法概略

操作方法概略

  1. 細胞,組織などの生体試料からRNAを抽出する
  2. 逆転写酵素によりcDNAを合成する
  3. cDNAとPerfect Master Mixを混合し,qPCR Master Mixとする。
  4. qPCR Master MixをSignArrayに添加してqPCRを行う。
  5. 解析用ソフトウェアを用いてデータ解析を行う。

本製品にRNA抽出試薬やcDNA合成試薬は含まれていません。









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解析用ソフトウェアについて

解析用ソフトウェアについて (クリックで開閉します)

AnyGenes社Webより,解析用ソフトウェア(Microsoft Excel対応)を無料でダウンロードでき,得られた結果の解析が容易です。

特長

  • 測定結果から統計データテーブルセットおよびグラフを作成でき,迅速かつ信頼性の高い解析が行えます。
  • ΔCq計算法を用いて解析を行い,選択したハウスキーピング遺伝子を用いてノーマライズします。
  • 同一のExcelワークブック中に存在する最大10種の実験結果について,参照条件(コントロール,キャリブレーター)と比較することができます。
  • 解析結果は,プレゼンテーションや出版に使用できます。
  • 主にMicrosoft Excel 2007以降のバージョンに対応しています。

Microsoft Excel 2007以前のバージョンをご使用された場合には,機能上の問題が生じる可能性があります。

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測定対象の遺伝子リスト

ヒト,マウス,ラットのそれぞれの動物種に対して,2種類のEpigenetic Regulation Arrayを取り揃えています。以下は,ヒトのEpigenetic Regulation Arrayの測定対象の遺伝子リストです。製品の分類でマウスおよびラットのEpigenetic Regulation Arrayの測定対象の遺伝子リストもご覧いただけます。

ヒトEpigenetic Regulation Array 1(#ER1Hx-xxx)

BAZ1A BAZ1B BAZ2A BAZ2B BPTF BRD1 BRD2 BRD3 BRD4 BRD7 BRD8 BRDT
BRPF1 BRPF3 BRWD1 BRWD3 WDR11 ACTL6A ARID2 GADD45B SATB1 SMARCC2 YY1 SMARCA1
RB1 CTCF CBX1 CBX3 CBX4 CBX5 CBX6 CBX7 CBX8 CDYL CDYL2 CHD1
CHD2 CHD3 CHD4 CHD5 CHD6 CHD7 CHD8 CHD9 KDM1A KDM4A KDM4E KDM5B
KDM5C KDM6B DNMT1 DNMT3A DNMT3B TET2 ATF2 CⅡTA CSRP2BP ESCO1 ESCO2 HAT1
KAT2A KAT2B KAT5 KAT6A KAT6B KAT7 KAT8 NCOA1 NCOA3 NCOA6 RBBP4 RBBP7
HDAC1 HDAC10 HDAC11 HDAC2 HDAC3 HDAC4 HDAC5 HDAC6 HDAC7 HDAC8 HDAC9 ASH1L

ヒトEpigenetic Regulation Array 2(#ER2Hx-xxx)

CARM1 DOT1L EHMT2 KMT2A KMT2C PRMT1 PRMT2 PRMT3 PRMT5 PRMT6 PRMT7 PRMT8
SETDB2 SMYD3 SUV39H1 ARID1B ASH2L ATF7IP ATM BCORL1 CBX2 CREBBP EHMT1 EZH1
EZH2 HSPA1A JARID2 KDM4B KDM6A KMT2D MEN1 PRDM1 PRKCA RBBP5 SIRT1 SMARCB1
TRRAP WDR5 AURKA AURKB AURKC NEK6 PAK1 RPS6KA3 RPS6KA5 DZIP3 MYSM1 RNF20
UBE2A UBE2B USP16 USP21 USP22 ING1 ING2 ING3 ING4 ING5 RING1 HINFP
MBD1 MBD2 MBD4 MECP2 MBD3 MTA1 MTA2 NAB2 SPEN NSD1 PHF1 PHF13
PHF2 PHF21A PHF3 PHF5A ASXL2 BCOR BMI1 CTBP1 CTBP2 PHC3 SUZ12 TRIM27

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製品ラインナップ

製品の分類

「遺伝子リスト」のイメージをクリックすると,各種Epigenetic Regulation Arrayで測定できる遺伝子リストをご覧いただけます。

製品の種類 Epigenetic Regulation Array 1(ER1) Epigenetic Regulation Array 2(ER2)
動物種 H:Human M:Mouse R:Rat H:Human M:Mouse R:Rat
測定できる遺伝子の種類 遺伝子リスト 遺伝子リスト 遺伝子リスト 遺伝子リスト 遺伝子リスト 遺伝子リスト

製品一覧

SignArrayおよび別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenは,下記「対応製品一覧表」をご確認の上,お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。●をクリックすると,対応する製品の価格表をご覧いただけます。

会社名 qPCR装置名 SignArray 96 SignArray 384 Perfect Master Mix
SYBR Green(別売品
ER1 ER2 ER1 ER2
H M R H M R H M R H M R 96 wells 384 wells
Roche LightCycler 96
LightCycler 480
Applied Biosystems
(Thermo Fisher Scientific)
Step One Plus Real-Time System
ABI 5700 / 7000 / 7300 / 7700
ABI 7500 (Standard block)
ABI 7500 (Fast block)
ABI 7900 HT (Standard block)
ABI 7900 HT (Fast block)
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Standard block)
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Fast block)
Bio-Rad iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MyiQ2
Chromo4, Opticon, Opticon2, CFX Connect, CFX96
CFX384
Eppendorf Mastercycler ep realplex 2 / 2S / 4 / 4S
Stratagene
(Agilent)
Mx3000P, Mx3005P, Mx4000, AriaMx
Techne Quantica, PrimeQ

Fast blockにおいて,対応したキット(Type F,#xxxx1-F2S)を用いた場合でも,Fast Modeでの使用には適していません。

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ご注文方法

ご注文の際には専用注文書に必要事項をご記入の上,販売店担当者にお渡し下さい。
詳細は,当社受託・特注品業務担当(TEL:03-5684-1645,FAX:03-5684-6539,e-mail:jutaku@funakoshi.co.jp)までお問い合わせ下さい。

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価格

ヒトEpigenetic Regulation Array 1

[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R
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ヒトエピジェネティック制御関連遺伝子84種の発現をqPCRで解析するアレイ。解析用ソフトをメーカーWebから無料でダウンロードできる(詳細は製品紹介ページをご覧下さい)。お手持ちのqPCR装置に適合するANY社qPCRマスターミックスを別途お求め下さい。
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ヒトエピジェネティック制御関連遺伝子84種の発現をqPCRで解析するアレイ。解析用ソフトをメーカーWebから無料でダウンロードできる(詳細は製品紹介ページをご覧下さい)。お手持ちのqPCR装置に適合するANY社qPCRマスターミックスを別途お求め下さい。
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R

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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type F

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  • 商品コード:ER1H1-F2S
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type A

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  • 商品コード:ER1H1-A2S
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type B

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  • 商品コード:ER1H1-B2S
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(384x2) type R

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  • 商品コード:ER1H2-R2S
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Human Epigenetic Regulation 1 SignArray(384x2) type A

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  • 商品コード:ER1H2-A2S
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ヒトEpigenetic Regulation Array 2

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Human Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R
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Human Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R

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  • 商品コード:ER2H1-R2S
  • メーカー:ANY
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  • 商品コード:ER2H1-F2S
  • メーカー:ANY
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  • 商品コード:ER2H1-A2S
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  • 商品コード:ER2H1-B2S
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R

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  • 商品コード:ER1M1-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type F

文献数:0

  • 商品コード:ER1M1-F2S
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  • 包装:1kit
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type A

文献数:0

  • 商品コード:ER1M1-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type B

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  • 商品コード:ER1M1-B2S
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(384x2) type R

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  • 商品コード:ER1M2-R2S
  • メーカー:ANY
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Mouse Epigenetic Regulation 1 SignArray(384x2) type A

文献数:0

  • 商品コード:ER1M2-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
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マウスEpigenetic Regulation Array 2

[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R
3週間程度  0
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[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R

文献数:0

  • 商品コード:ER2M1-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type F

文献数:0

  • 商品コード:ER2M1-F2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type A

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  • 商品コード:ER2M1-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
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  • 納期:3週間程度 
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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type B

文献数:0

  • 商品コード:ER2M1-B2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(384x2) type R

文献数:0

  • 商品コード:ER2M2-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
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  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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Mouse Epigenetic Regulation 2 SignArray(384x2) type A

文献数:0

  • 商品コード:ER2M2-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥142,000
  • 在庫:無(未発注)
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ラットEpigenetic Regulation Array 1

[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Rat Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R
3週間程度  0
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3週間程度  0
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[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Rat Epigenetic Regulation 1 SignArray(96x2) type R

文献数:0

  • 商品コード:ER1R1-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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文献数:0

  • 商品コード:ER1R1-F2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
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文献数:0

  • 商品コード:ER1R1-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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文献数:0

  • 商品コード:ER1R1-B2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
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  • 商品コード:ER1R2-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥142,000
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文献数:0

  • 商品コード:ER1R2-A2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥142,000
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ラットEpigenetic Regulation Array 2

[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Rat Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R
3週間程度  0
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※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

Rat Epigenetic Regulation 2 SignArray(96x2) type R

文献数:0

  • 商品コード:ER2R1-R2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥80,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:3週間程度 
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文献数:0

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  • 価格:¥142,000
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Perfect Master Mix SYBR Green

[在庫・価格 :2020年06月01日 19時51分現在]

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Perfect Master Mix SYBR Green x2 for SignArrays 96 system
3週間程度  0
説明文
ANY社SignArrays 96 System用のqPCRマスターミックス。対応するqPCR装置をご確認下さい。
法規制等
保存条件 -20℃,暗所保存 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年3月15日号 p.17
ニュース2019年12月15日号 p.18

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EMT / EndMT SignArray
Apoptosis SignArray
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Perfect Master Mix SYBR Green x2 for SignArrays 96 system

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  • 商品コード:PMS1-W2S
  • メーカー:ANY
  • 包装:1kit
  • 価格:¥38,000
  • 在庫:無(未発注)
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  • 商品コード:PMS2-W2S
  • メーカー:ANY
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