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エピジェネティック制御関連遺伝子84種の発現量をqPCRで同時解析 Epigenetics Regulation SignArray

掲載日情報：2020/04/03 現在Webページ番号：68098

エニージーンズ /
AnyGenes SARL
[メーカー略称：ANY]

特定のカテゴリーに関連する84種の遺伝子発現量をqPCRで同時解析できるSignArraysの中から、エピジェネティック制御関連遺伝子解析用の製品をご紹介します。
本製品は、各ウェルに各因子に対するqPCR用プライマーが添加されているプレート製品です。合成したcDNAと専用のqPCR用マスターミックス（別売り）を混合後、各ウェルに添加してqPCRを行います。
※ SignArraysの詳細、およびその他の製品ランナップについては、☞ SignArraysをご覧下さい。
※本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


SignArrays外観

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SignArrays外観イメージ

SignArrays 96 wellプレートのqPCR用プライマー配置例

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SignArrays 96 wellプレートのqPCR用プライマー配置例

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エピジェネティック制御とがんについて

エピジェネティクスは、遺伝子配列改変無しでの発現産物修飾により起こります。最も重要な出来事は、CpGアイランドでのDNAメチル化と、ヒストンの翻訳後修飾です1。正常細胞において、これらの修飾は遺伝子発現調節をもたらし、そのメカニズムにはDNA methyltransferase、Histone deacetylase、Histone acetyltransferase、Sirtuin、Aurora kinaseなどといった多くの因子が関与します2, 3。これらすべての因子が相互に作用して遺伝子発現を調節し、とりわけ全能性細胞の分化をもたらします3。


生体幹細胞の機能のエピジェネティック制御模式図

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生体幹細胞の機能のエピジェネティック制御（画像出典：参考文献4）

一方、がんにおいて、腫瘍細胞はエピジェネティクス因子を自らに有利になるように調節します。このメカニズムにより、遊走、浸潤、細胞増殖といった通常は不活性となっているシグナル伝達経路に関与する遺伝子の転写活性化が起されます5。これらの活性化は、腫瘍抑制遺伝子および細胞周期チェックポイントなどの局所的なDNA過剰メチル化を伴う、全体的なDNA低メチル化によりもたらされます。染色体をより利用しやすくするために、ヒストンも修飾されます5。エピジェネティックな出来事は、細胞の発がんや、転移過程における新しい組織への細胞浸潤に強く関与しています。

参考文献

  1. Kinnaird, A., et al., "Metabolic control of epigenetics in cancer.", Nature, 16(11), 694～707 (2016). [PMID：27634449]
  2. Chen, Q.W., et al.,"Epigenetic regulation and cancer (Review)", Oncology Reports, 31(2), 523～532 (2014). [PMID：24337819]
  3. Cohen, I., et al., "Histone Modifiers in Cancer: Friends or Foes?", Genes & Cancer, 2 (6), 631～647 (2011). [PMID：21941619]
  4. Avgustinova, A., et al., "Epigenetic control of adult stem cell function.", Nat. Rev. Mol. Cell. Biol., 17(10), 643～658 (2016). [PMID：27405257]
  5. Sharma, S., et al., "Epigenetics in cancer.", Carcinogenesis, 31(1), 27～36 (2010). [PMID：19752007]

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特長

  • 関連84遺伝子と、ノーマライズ用8遺伝子、品質管理用4遺伝子（計96遺伝子）の発現量をわずか3時間で一度に解析できます（384プレート製品は、96遺伝子×4セット）。
  • イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としたプライマーデザインにより、ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅できるため、高感度かつ高い特異性で測定を行えます。
  • SignArraysと、専用のqPCR用マスターミックス（Perfect Master Mix SYBR Green）は、それぞれのqPCR装置に最適化された製品があり、簡便かつ高い信頼性で測定を行えます。
  • ☞ AnyGenes社Webサイトより、解析用ソフトウェア（Microsoft Excel対応）を無料でダウンロードでき、得られた結果の解析が容易です。

※ qPCR用マスターミックス（Perfect Master Mix SYBR Green）は、ご使用のqPCR装置に併せてお選び下さい。AnyGenes では、 SignArraysと同社のPerfect Master Mix SYBR Green を併せてご使用いただくことを強く推奨しております。他社の試薬と組み合わせて使用し、結果に不具合などが生じた場合、補償の対象外となる可能性があります。
※ 本製品にRNA抽出試薬やcDNA合成試薬は含まれていません。

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測定対象の遺伝子リスト

ヒト、マウス、ラットのそれぞれの動物種に対して、2種類のEpigenetic Regulation Arrayを取り揃えています。以下は、ヒトのEpigenetic Regulation Arrayの測定対象の遺伝子リストです。☞ 製品の分類でマウスおよびラットのEpigenetic Regulation Arrayの測定対象の遺伝子リストもご覧いただけます。

ヒトEpigenetic Regulation Array 1（#ER1Hx-xxx）

BAZ1A BAZ1B BAZ2A BAZ2B BPTF BRD1 BRD2 BRD3 BRD4 BRD7 BRD8 BRDT
BRPF1 BRPF3 BRWD1 BRWD3 WDR11 ACTL6A ARID2 GADD45B SATB1 SMARCC2 YY1 SMARCA1
RB1 CTCF CBX1 CBX3 CBX4 CBX5 CBX6 CBX7 CBX8 CDYL CDYL2 CHD1
CHD2 CHD3 CHD4 CHD5 CHD6 CHD7 CHD8 CHD9 KDM1A KDM4A KDM4E KDM5B
KDM5C KDM6B DNMT1 DNMT3A DNMT3B TET2 ATF2 CⅡTA CSRP2BP ESCO1 ESCO2 HAT1
KAT2A KAT2B KAT5 KAT6A KAT6B KAT7 KAT8 NCOA1 NCOA3 NCOA6 RBBP4 RBBP7
HDAC1 HDAC10 HDAC11 HDAC2 HDAC3 HDAC4 HDAC5 HDAC6 HDAC7 HDAC8 HDAC9 ASH1L

ヒトEpigenetic Regulation Array 2（#ER2Hx-xxx）

CARM1 DOT1L EHMT2 KMT2A KMT2C PRMT1 PRMT2 PRMT3 PRMT5 PRMT6 PRMT7 PRMT8
SETDB2 SMYD3 SUV39H1 ARID1B ASH2L ATF7IP ATM BCORL1 CBX2 CREBBP EHMT1 EZH1
EZH2 HSPA1A JARID2 KDM4B KDM6A KMT2D MEN1 PRDM1 PRKCA RBBP5 SIRT1 SMARCB1
TRRAP WDR5 AURKA AURKB AURKC NEK6 PAK1 RPS6KA3 RPS6KA5 DZIP3 MYSM1 RNF20
UBE2A UBE2B USP16 USP21 USP22 ING1 ING2 ING3 ING4 ING5 RING1 HINFP
MBD1 MBD2 MBD4 MECP2 MBD3 MTA1 MTA2 NAB2 SPEN NSD1 PHF1 PHF13
PHF2 PHF21A PHF3 PHF5A ASXL2 BCOR BMI1 CTBP1 CTBP2 PHC3 SUZ12 TRIM27


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製品ラインナップ

製品の分類

遺伝子リストのイメージをクリックすると、各種Epigenetic Regulation Arrayで測定できる遺伝子リスト（pdf）をご覧いただけます。

製品の種類 Epigenetic Regulation Array 1（ER1） Epigenetic Regulation Array 2（ER2）
動物種 H：Human M：Mouse R：Rat H：Human M：Mouse R：Rat
測定できる遺伝子の種類 Epigenetic Regulation Array 1（ER1）遺伝子リストHuman Epigenetic Regulation Array 1（ER1）遺伝子リストMouse Epigenetic Regulation Array 1（ER1）遺伝子リストRat Epigenetic Regulation Array 2（ER2）遺伝子リストHuman Epigenetic Regulation Array 2（ER2）遺伝子リストMouse Epigenetic Regulation Array 2（ER2）遺伝子リストRat

製品一覧

SignArraysおよび別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenは、下記「対応製品一覧表」をご確認の上、お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。●をクリックすると、対応する製品の価格表をご覧いただけます。

px;
会社名 qPCR装置名 SignArrays 96 SignArrays 384 Perfect Master Mix
SYBR Green（別売品）
ER1 ER2 ER1 ER2
H M R H M R H M R H M R 96 wells 384 wells
Roche LightCycler 96 ● ● ● ● ● ● － ● －
LightCycler 480 ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●
Applied Biosystems
（Thermo Fisher Scientific）		 Step One Plus Real-Time System ● ● ● ● ● ● － ● －
ABI 5700 / 7000 / 7300 / 7700 ● ● ● ● ● ● － ● －
ABI 7500 (Standard block) ● ● ● ● ● ● － ● －
ABI 7500 (Fast block)＊ ● ● ● ● ● ● － ● －
ABI 7900 HT (Standard block) ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●
ABI 7900 HT (Fast block)＊ ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Standard block) ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Fast block)＊ ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●
Bio-Rad iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MyiQ2 ● ● ● ● ● ● － ● －
Chromo4, Opticon, Opticon2, CFX Connect, CFX96 ● ● ● ● ● ● － ● －
CFX384 － ● ● ● ● ● ● － ●
Eppendorf Mastercycler ep realplex 2 / 2S / 4 / 4S ● ● ● ● ● ● － ● －
Stratagene
（Agilent）		 Mx3000P, Mx3005P, Mx4000, AriaMx ● ● ● ● ● ● － ● －
Techne Quantica, PrimeQ ● ● ● ● ● ● － ● －

＊ Fast blockにおいて、対応したキット（Type F、#xxxx1-F2S）を用いた場合でも、Fast Modeでの使用には適していません。


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ご注文方法

ご注文の際には☞ 専用注文書に必要事項をご記入の上、販売店担当者にお渡し下さい。
詳細は、当社受託・特注品業務担当（TEL：03-5684-1645、FAX：03-5684-6539、e-mail：jutaku@funakoshi.co.jp）までお問い合わせ下さい。

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カスタム SignArrays作製受託サービス

SignArraysは、お客様の目的に合った遺伝子を選んで SignArraysを作製できるカスタム対応が可能です。
下記の項目などについてご選択の上、お問い合わせ下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

ご選択いただく項目例

  • 遺伝子の種類と数
  • プレート形状：96 platesまたは384 plates
  • 動物種：ヒト、マウス、またはラット
  • qPCR装置名（会社名）
  • Perfect Master Mix中に含まれるReference Dyeの種類

など。詳細はメーカーサイトのカスタム SignArrays作製用専用申込書☞ Personalized AnyGenes SignArraysをご覧下さい。

ご注文方法

ご依頼内容に応じてお見積もりします。詳細は、受託・特注品担当（☞ jutaku@funakoshi.co.jp）までお問い合わせ下さい。

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お問い合わせ先

（テクニカルサポート 試薬担当）

reagent@funakoshi.co.jp

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。

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