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がん関連遺伝子84種の発現量をqPCRで同時解析 Cancer Diseases SignArray

掲載日情報:2019/07/12 現在Webページ番号:64973

特定のカテゴリーに関連する84種の遺伝子発現量をqPCRで同時解析できるSignArrayの中から,がん(Cancer Diseases)関連遺伝子解析用の製品をご紹介します。
本製品は,各ウェルに各因子に対するqPCR用プライマーが添加されているプレート製品です。合成したcDNAと専用のqPCR用マスターミックス(別売り)を混合後,各ウェルに添加してqPCRを行います。
腫瘍転移関連遺伝子の「EMT / EndMT SignArray」は,こちらをご覧下さい。
※ qPCR用マスターミックスは,別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenをご使用下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


特長

  • 関連84遺伝子と,ノーマライズ用8遺伝子,品質管理用4遺伝子(計96遺伝子)の発現量をわずか3時間で一度に解析できます(384プレート製品は,96遺伝子×4セット)。
  • イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としたプライマーデザインにより,ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅できるため,高感度かつ高い特異性で測定を行えます。
  • SignArrayと,専用のqPCR用マスターミックス(Perfect Master Mix SYBR Green)は,それぞれのqPCR装置に最適化された製品があり,簡便かつ高い信頼性で測定を行えます。
  • AnyGenes社Webより,解析用ソフトウェア(Microsoft Excel対応)を無料でダウンロードでき,得られた結果の解析が容易です。

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プライマーデザインについて

他社製品の多くは,プライマーの標的部位をひとつのエクソン内にデザインしているため,cDNAだけでなく,ゲノムDNAやゲノム中の偽遺伝子も増幅され,感度や特異性に問題が生じます。
一方,SignArrayは,イントロン部分を挟んだ複数エクソンを標的としてデザインしているため,ゲノムDNAを増幅することなくcDNAのみを増幅でき,高感度かつ高い特異性で測定を行えます。

原理

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品質管理

プライマー効率 プライマー効率は,Perfect Master MixSYBR Green(PMS)を使用した厳密な品質検査により100±10%の効率を確認しています。
プライマーの
特異性
厳密なイントロンスパン設計に基づいて,全プライマーについて,融解曲線上の単一ピーク,および予想される分子量における単一ゲルバンドを示すことを確認しています。
再現性 Perfect Master Mix SYBR Green(PMS)は,全シグナル伝達経路研究用SignArrayにおいて,同じcDNAで試験した同じSignArray間の相関関係について検証を実施して,信頼性および再現性を確認しています。

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操作方法概略

  1. 細胞,組織などの生体試料からRNAを抽出する
  2. 逆転写酵素によりcDNAを合成する
  3. cDNAとPerfect Master Mixを混合し,qPCR Master Mixとする。
  4. qPCR Master MixをSignArrayに添加してqPCRを行う。
  5. 解析用ソフトウェアを用いてデータ解析を行う。

本製品にRNA抽出試薬やcDNA合成試薬は含まれていません。


操作方法概略

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解析用ソフトウェアについて

(クリックで開閉します)

AnyGenes社Webより,解析用ソフトウェア(Microsoft Excel対応)を無料でダウンロードでき,得られた結果の解析が容易です。

■ ソフトウェア特長

  • 測定結果から統計データテーブルセットおよびグラフを作成でき,迅速かつ信頼性の高い解析が行えます。
  • ΔCq計算法を用いて解析を行い,選択したハウスキーピング遺伝子を用いてノーマライズします。
  • 同一のExcelワークブック中に存在する最大10種の実験結果について,参照条件(コントロール,キャリブレーター)と比較することができます。
  • 解析結果は,プレゼンテーションや出版に使用できます。
  • 主にMicrosoft Excel 2007以降のバージョンに対応しています。

Microsoft Excel 2007以前のバージョンをご使用された場合には,機能上の問題が生じる可能性があります。



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SignArrayの商品コードについて

SignArrayの商品コードは,以下のように番号づけされています。下記「対応製品一覧表」をご確認の上,お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。

SignArrayおよび別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenは,qPCR装置に応じた製品を取りそろえています。
下記「対応製品一覧表」をご確認の上,お手持ちのqPCR装置に対応した製品を選択し,製品ラインナップの製品固有のコードと組み合わせて,商品コードを組み立てて下さい。
※ qPCR用マスターミックスは,別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenをご使用下さい。

商品コード概略

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製品ラインナップ

商品コードをクリックすると価格表を,Array Listをクリックするとアレイされている84遺伝子のリストをご覧いただけます。

Y「対応製品一覧表」中の各qPCR装置に対応した製品のタイプの4種(A / B / F / R)から選択して置き換えて下さい。

対応製品例:LightCycler 96で,ヒトLiver Cancer 1 SignArrayを用いる場合,SignArrayは#LIC1H1-R2S ,Perfect Master Mix SYBR Greenは#PMS1-W2Sをご使用下さい。
※ qPCR用マスターミックスは,別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenをご使用下さい。

SignArray Cancer Diseases 製品固有のコード Human Mouse Rat
96 plates 384 plates 96 plates 384 plates 96 plates 384 plates
Adenocarcinoma 1 ADC1 ADC1H1-Y2S
Array List
ADC1H2-Y2S
Adenocarcinoma 2 ADC2 ADC2H1-Y2S
Array List
ADC2H2-Y2S
Bladder Cancer 1 BLC1 BLC1H1-Y2S
Array List
BLC1H2-Y2S
Bladder Cancer 2 BLC2 BLC2H1-Y2S
Array List
BLC2H2-Y2S
Brain Cancer 1 BRAC1 BRAC1H1-Y2S
Array List
BRAC1H2-Y2S
Brain Cancer 2 BRAC2 BRAC2H1-Y2S
Array List
BRAC2H2-Y2S
Breast Cancer 1 BRC1 BRC1H1-Y2S
Array List
BRC1H2-Y2S BRC1M1-Y2S
Array List
BRC1M2-Y2S
Breast Cancer 2 BRC2 BRC2H1-Y2S
Array List
BRC2H2-Y2S BRC2M1-Y2S
Array List
BRC2M2-Y2S
Cervical Cancer CEC1 CEC1H1-Y2S
Array List
CEC1H2-Y2S
Chronic Lymphocytic Leukemia CLL1 CLL1H1-Y2S
Array List
CLL1H2-Y2S
Colorectal Cancer 1 COC1 COC1H1-Y2S
Array List
COC1H2-Y2S
Colorectal Cancer 2 COC2 COC2H1-Y2S
Array List
COC2H2-Y2S
Endometrial Cancer ENC1 ENC1H1-Y2S
Array List
ENC1H2-Y2S
Head & Neck Cancer 1 HNC1 HNC1H1-Y2S
Array List
HNC1H2-Y2S
Head & Neck Cancer 2 HNC2 HNC2H1-Y2S
Array List
HNC2H2-Y2S
Liver Cancer 1 LIC1 LIC1H1-Y2S
Array List
LIC1H2-Y2S LIC1M1-Y2S
Array List
LIC1M2-Y2S LIC1R1-Y2S
Array List
LIC1R2-Y2S
Liver Cancer 2 LIC2 LIC2H1-Y2S
Array List
LIC2H2-Y2S LIC2M1-Y2S
Array List
LIC2M2-Y2S
Lung Cancer 1 LUC1 LUC1H1-Y2S
Array List
LUC1H2-Y2S
Lung Cancer 2 LUC2 LUC2H1-Y2S
Array List
LUC2H2-Y2S
Lymphoma Cancer 1 LYC1 LYC1H1-Y2S
Array List
LYC1H2-Y2S
Lymphoma Cancer 2 LYC2 LYC2H1-Y2S
Array List
LYC2H2-Y2S
Lymphoma Cancer 3 LYC3 LYC3H1-Y2S
Array List
LYC3H2-Y2S
Melanoma Cancer MEC1 MEC1H1-Y2S
Array List
MEC1H2-Y2S
Myeloma Cancer MYC1 MYC1H1-Y2S
Array List
MYC1H2-Y2S
Ovarian Cancer 1 OVC1 OVC1H1-Y2S
Array List
OVC1H2-Y2S
Ovarian Cancer 2 OVC2 OVC2H1-Y2S
Array List
OVC2H2-Y2S
Pancreatic Cancer PAC1 PAC1H1-Y2S
Array List
PAC1H2-Y2S
Prostate Cancer 1 PRC1 PRC1H1-Y2S
Array List
PRC1H2-Y2S
Prostate Cancer 2 PRC2 PRC2H1-Y2S
Array List
PRC2H2-Y2S
Renal Cancer REC1 REC1H1-Y2S
Array List
REC1H2-Y2S REC1M1-Y2S
Array List
REC1M2-Y2S
Stomach Cancer 1 STC1 STC1H1-Y2S
Array List
STC1H2-Y2S
Stomach Cancer 2 STC2 STC2H1-Y2S
Array List
STC2H2-Y2S
Thyroid Cancer THC1 THC1H1-Y2S
Array List
THC1H2-Y2S


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qPCR装置と対応した製品について

SignArrayおよび別売りのPerfect Master Mix SYBR Greenは,qPCR装置に応じた製品を取りそろえています。下記「対応製品一覧表」をご確認の上,お手持ちのqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。

商品コードをクリックすると,価格表をご覧いただけます。

会社名 qPCR装置名 qPCR装置指定コード(Y) Perfect Master Mix SYBR Green
2×96 plates 2×384 plates 2×96 plates 2×384 plates
Roche LightCycler 96 R PMS1-W2S
LightCycler 480 R R PMS1-W2S PMS2-W2S
Applied Biosystems
(Thermo Fisher Scientific)
Step One Plus Real-Time System F PMS1-R2S
ABI 5700 / 7000 / 7300 / 7700 A PMS1-R2S
ABI 7500(Standard block) A PMS1-LR2S
ABI 7500(Fast block) F PMS1-LR2S
ABI 7900 HT(Standard block) A A PMS1-R2S PMS2-R2S
ABI 7900 HT(Fast block) F A PMS1-R2S PMS2-R2S
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System(Standard block) A A PMS1-LR2S PMS2-LR2S
ViiA7 System, QuantStudio 5 / 6 / 7 / 12K Flex System (Fast block) F A PMS1-LR2S PMS2-LR2S
Bio-RadiCycler iQ, iQ5, MyiQ, MyiQ2 A PMS1-F2S
Chromo4, Opticon, Opticon2, CFX Connect, CFX96 B PMS1-W2S
CFX384 A PMS2-W2S
EppendorfMastercycler ep realplex 2 / 2S / 4 / 4S A PMS1-W2S
/PMS1-R2S
Stratagene (Agilent) Mx3000P, Mx3005P, Mx4000, AriaMx A PMS1-LR2S
Techne Quantica, PrimeQ A PMS1-F2S

対応したキット(#ADI1XX-F2S)を用いた場合でも,Fast Modeでの使用には適していません。

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。