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RNAバイサルファイト変換から5mC RNA-seq library構築までのall-in-oneキット EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kit (Illumina)

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:65260

RNAバイサルファイト(亜硫酸処理)変換、ライゲーション、洗浄、サイズ選択およびライブラリー増幅までの一連の操作に必要なすべての試薬を含んだキットです。本キットによりRNAのバイサルファイト変換と断片化を同時に行うことができ、少量のバイサルファイト化RNAを用いて非バーコード化(singleplexed)またはバーコード化(multiplexed)ライブラリーを簡便、迅速に構築することができます。

EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kitの操作方法概要 cDNAライブラリー断片のサイズの分布
EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kit (Illumina)の操作方法概要ライブラリー断片のサイズの分布
本キットを用いてマウスRNAの50 ngからポスト-バイサルファイトcDNAライブラリーを調製した。

5-メチルシトシン(5-mC)とは

DNA中の5-メチルシトシン(5-mC)は、DNAメチルトランスフェラーゼによるシトシン環5位の炭素にメチル基の共有結合的付加によって起こります。このよく知られるプロセスは、遺伝子発現抑制と関連し、ヒトでは、5-mCのtRNA、rRNA、mRNAおよび非コードRNA(ncRNA)などの様々なRNA分子で発生することが知られています。

二つの異なるメチルトランスフェラーゼのNSUN2とDNMT2は、真核生物のRNAの5-mC修飾を触媒することが知られています。最近のデータで、RNAのシトシンのメチル化はRNAの安定性やmRNA翻訳など、様々な生物学的プロセス調節に影響することが強く示唆されています。候補部位の大部分(83%)は、mRNA中に見出されました。転写物においては、5-mCはタンパク質コード配列内ではほとんど見られませんが、5 'および3'UTRにおいて多く存在します。vault RNAにおける5-mCの損失は、micro RNAとして機能するアルゴノート関連small RNA断片に異常処理を発生し、NSun2欠損に関連するヒトの疾患の病因につながる可能性があります。


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特長

  • 高感度かつ高効率に非バーコード化(singleplexed)またはバーコード化(multiplexed)ライブラリーを調製でき、5mC RNA-seq libraryが構築できます。
  • 最適化されたRNAバイサルファイト法とアダプター添付により、断片の損失やセクションバイアスを抑制できるため、わずか5 ngのRNAで完全タグ付のcDNAライブラリーが得られます。
  • ゲルフリーの選別、精製により時間を節約でき、誤操作やサンプルの損失を防止できます。
  • 非メチル化シトシンの99.9%以上をウラシルに変換することができます。
  • キットには、RNAのバイサルファイト処理からRNAライブラリー構築までの全ての操作に必要な試薬が含まれています。
  • Ultra HiFi増幅は、最小シークエンシングバイアスと低エラーレートで、バイサルファイト変換RNAの高収率を再現できます。
  • 適応RNA試料:新鮮または凍結組織を含む様々な組織/細胞、生体液、培養細胞由来の全RNA
  • 必要RNA量:5~500 ng(最適RNA量:100~200 ng)
  • 全操作時間:6時間以内

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キット内容

  • Conversion buffer/powder
  • NA binding solution
  • F-spin solumn
  • F-collection tube
  • Desulphonation solution
  • Reaction buffer
  • Reaction enzyme mix
  • Adaptor -A/-B
  • RNA digestion buffer/enzyme
  • MQ binding beads
  • HiFi PCR master mix
  • Primer U/I
  • Elution buffer

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価格

[在庫・価格 :2024年04月19日 09時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
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納期 文献数
EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kit(Illumina)(12 reactions)
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説明文
別包装品 別包装品あり
法規制等 医薬用外劇物
保存条件 室温,4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2019年4月1日号 p.8

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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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