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【ゲノム編集】ドナーDNAの設計オンラインツール Edit-R HDR Donor Designer

掲載日情報:2019/10/29 現在Webページ番号:65186

Horizon Discovery社のWebサイトでの本記事掲載製品の検索方法はこちら!

guide RNAによるゲノム編集ツール CRISPR-Cas9特集

ヒト・マウス・ラットの遺伝子について,ドナーDNAの設計ができるHorizon Discovery社のオンラインツールです。
ガイドRNA配列を入力し,切断位置および挿入する配列を指定すると配列が自動的に設計され,Web上で引き続き注文いただけます。

一本鎖DNAドナーオリゴの設計

Edit-R HDR Donor Designer - oligo

Horizon Discovery社のご注文Webサイト ⇒ 「Edit-R HDR Donor Designer - oligo」

  • 目的の塩基配列(長さ50 nt 以下)を挿入・欠失・置換するための一本鎖DNA ドナーオリゴを設計できるオンラインツールです。
  • 編集領域が再切断される可能性がある場合,ガイドRNA の認識領域またはPAM 配列にサイレント変異を導入した配列を表示します。

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ドナープラスミド作製時に必要なホモロジーアームPCRプライマーの設計

Edit-R HDR Donor Designer - plasmid

Horizon Discovery社のご注文Webサイト ⇒ 「Edit-R HDR Donor Designer - plasmid」

  • ドナープラスミド作製時に必要なホモロジーアームPCR プライマーの配列を設計できるオンラインツールです。
  • ドナープラスミドを使用して,蛍光レポーター遺伝子あるいは塩基配列(長さ50 nt 以上)を挿入する場合にご使用いただけます。

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操作方法概略(Edit-R HDR Donor Designer – oligo)

Edit-R HDR Donor Designer

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ガイドRNA・Cas9ヌクレアーゼ・ドナーDNAの選択ガイド

■遺伝子ノックイン&塩基配列の挿入・欠失・置換用
下表を参考にして実験目的に合ったガイドRNA・Cas9ヌクレアーゼ・ドナーDNAを選択して下さい。ドナーDNAの設計には,Horizon Discovery社のWebサイトのEdit-R HDR Donor Designerの使用により,ヒト・マウス・ラットの遺伝子について,ドナーDNAの設計を直感的で簡便に行うことができます。
細胞への試薬の導入にトランスフェクション試薬を使用する場合は,こちらを参照して下さい。

  一本鎖DNAドナーオリゴを使用して塩基配列
(長さ50 nt以下)を挿入・欠失・置換する場合
ドナープラスミドを使用して,蛍光レポーター遺伝子あるいは
塩基配列(長さ50 nt以上)を挿入する場合
ガイドRNA 以下から適切な製品を選択して下さい。

CRISPR Design Tool でカスタム設計したcrRNA/sgRNA
Edit-R CRISPR(knockout)crRNA
Edit-R tracrRNA(Edit-R crRNAと組み合わせて使用)
Edit-R CRISPR(knockout)Lentiviral sgRNA
Cas9ヌクレアーゼ 以下から適切な製品を選択して下さい。

● 発現用プラスミド  ● mRNA  ● タンパク質  ● 発現用レンチウイルスベクター ⇒ 製品記事はこちら
ドナーDNA 下図ワークフロー ステップ③で作製した一本鎖DNAドナーオリゴ ● 下図ワークフロー ステップ③で作製したホモロジーアームPCRプライマー
Edit-R HDR Plasmid Donor Kit

■ドナーDNA設計ワークフロー

ガイドRNA配列の決定 Horizon Discovery社のWebサイトCRISPR Design Toolでカスタム設計。あるいは,デザイン済みガイドRNA(knockout用)から選択
矢印 一本鎖DNAドナーオリゴを使用して塩基配列(長さ50 nt以下)を挿入・欠失・置換する場合 ドナープラスミドを使用して,蛍光レポーター遺伝子あるいは塩基配列(長さ50 nt以上)を挿入する場合
切断したいゲノム
矢印
Edit-R HDR Donor Designer - oligoに,ステップ①で決定したガイドRNA配列を入力し,切断位置および挿入・欠失・置換する配列を設計 Edit-R HDR Donor Designer - plasmidに,ステップ①で決定したガイドRNA配列を入力し,挿入位置を決定
ドナーDNAの設計 ステップ②で設計した一本鎖DNAドナーオリゴの配列が自動で設計されるので注文へ ステップ②で決定した遺伝子挿入位置を反映した,ドナープラスミド作製時に必要なホモロジーアームPCRプライマーの配列が自動で設計されるので注文へ

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ご注文方法

Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには,事前にユーザー登録が必要です。

初めてご注文いただくお客様はユーザー登録・ご注文方法の詳細をこちらでご覧下さい。

ユーザー登録済みのお客様はID(メールアドレス)とパスワードで,Horizon Discovery社のWebサイトトップページでログインして,製品を検索・ご指定の上ご注文下さい。

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関連製品

蛍光レポーター(EGFP,mKate2)遺伝子,あるいはお客様の希望するカスタム配列(別途ご用意下さい)をゲノムのターゲット部位に導入するために用いるドナープラスミドを,迅速かつ高効率で構築するキットです。

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