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ヒトRegulatory RNA（eRNAおよびRegulatory LncRNA）をリアルタイムPCRにより定量解析するためのプライマーセット Regulatory RNA qPCR Array
掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：63195
Regulatory RNA（eRNAおよびRegulatory LncRNA）をリアルタイムPCRにより定量解析するためのプライマーセットです。
機能が報告されているRegulatory RNAのうち、上位89種類のRegulatory RNAを検出することができます。
※System Biosciences社は、本製品のほかにもLncRNAをリアルタイムPCRで定量するためのプライマーセットを取りそろえています。
疾病に関連する83種類のLncRNAを定量するプライマーセット
追加しました。
- eRNA（Enhancer RNA）およびRegulatory LncRNA（Regulatory Long non-coding RNA）について
- Regulatory RNA qPCR Arrayの特長
- 検出可能なRegulatory RNA（eRNAおよびRegulatory LncRNA）
- Regulatory RNA qPCR Arrayの使用例
- Regulatory RNA qPCR Arrayのキット内容
- Regulatory RNA qPCR Arrayの価格
eRNA（Enhancer RNA）およびRegulatory LncRNA（Regulatory Long non-coding RNA）について
生体内におけるRegulatory RNA（non coding RNA、非翻訳RNA）の発現異常は、がんや疾患に相関することが報告されており、Regulatory RNAには短鎖の「エンハンサー由来RNA」と長鎖の「Regulatory Long non-coding RNA」が存在します。
エンハンサー由来RNA（Enhancer RNA、eRNA）の特長
- 鎖長：50～2,000 nt
- 活性化したエンハンサー領域から転写された短鎖RNAです。
- 1D eRNAと2D eRNAの2種類のエンハンサー由来RNAが存在します。
- 1D eRNA（単方向性RNA）：5'はcap形成せず、3'はpolyA修飾された状態で存在します。
- 2D eRNA（双方向性RNA）：5'はcap形成した状態で存在します。
Regulatory Long non-coding RNA（LncRNA）
- 鎖長：＞200 nt
- 5'はcap形成し、3'はpolyA修飾された状態で存在します。
追加しました。
Regulatory RNA qPCR Arrayの特長
- 本製品で検出可能な89種類のRegulatory RNA（eRNAおよびRegulatory LncRNA）はすべて論文でアノテーションされています。
- 各Regulatory RNAに対するプライマーは、複数の細胞・組織試料を用いてバリデーション済みです。
- キットにはレファレンス用のコントロールプライマーが付属し（GAPDH、Actin、U6、18SrRNA用プライマー）、コントロールを任意に選択することができます。
- キットにはcDNA合成およびPCRを20回行うのに十分な量の試薬が含まれています。
追加しました。
検出可能なRegulatory RNA（eRNAおよびRegulatory LncRNA）
青色：eRNA検出用プライマー
緑色：Regulatory LncRNA検出用プライマー
黒色：コントロールRNA（GAPDH、Actin、U6、18SrRNA）検出用プライマー
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
| A | 4q32e | ACSL1e | AZIN1e | CA12e | Lnc-PERP-1 | Lnc-KLF14-1 | Linc-LAMA4-3 | Lnc-LYZL2-1 | Linc-LAMA4-2 | Lnc-LCP2-1:1 | Lnc-FABP5-2:1 | Lnc-TMTC3-6:2 |
| B | Lnc-IER3-5:2 | Lnc-C21orf33-1 | ERBS3/SBNO2e | Epha4e | FKBP5e | FOXC1e | GREB1e | IL1be | IL6e | IRS2e | KLF6e | KLK3e |
| C | MARCKSe | miR-200be | Nanoge | NKX31e | NRIP1e | P2RY2e | P53BER2 | P53BER4 | PCBP1e | PGRe | PLZFe | Pou5f1e |
| D | Ppap2be | SIAH2e1 | SLC30A4e | SMAD7e | SOCS3e | SOX2e | TFF1e | TNFSF8e | Wnt-8be | XBP1e | CBR3-AS1 | CCAT1-L |
| E | CD48-AS- | CTBP1-AS | DBE-T | ERIC | FIRRE | GAPlinc | HAS2-AS1 | HOTTIP | iL7-mflncRNA | Lnc_DC | lncRNA-508851 | lncRNAATB |
| F | LOC100132354 | MRUL | ncRNAa1-sameas FAl1 | ncRNAa2 | ncRNAa3 | ncRNAa4 | ncRNAa5 | ncRNAa6 | ncRNAa7 | ncRuPAR | NONCO2077 | NONCO261 |
| G | NONCO2807 | NONCO2823 | NONCO2913 | NONCO526 | OIP5-mf | Paupar | PCAT-1 | PCGEM1 | PCNAAS1 | PINT | PRNCR1 | RPLP0P2 |
| H | SENCR | SPRY4-IT1 | LncR1 | Thril | AS1 | BRD4 | FOXO3 | Actin | GAPDH | U6 | 18S rRNA | control |
追加しました。
Regulatory RNA qPCR Arrayの使用例
キットに付属のプライマーセットを用いて、リアルタイムPCRによりRegulatory RNAを増幅し、解離曲線を作製した。
Regulatory RNA qPCR Assay Performance
All primers have been validated by using total RNAs from several cell lines and tissues such as HEK293, HT1080, MCF7 (human breast cancer cell line), human fibroblast cells, human fetal brain, human adult brain, iPSC cells, and neural precursor cells (NPCs). All primers in the assay show a single peak during our dissociation melt analysis. Shown below are representative peaks for several eRNAs and controls.
がん細胞から精製したRNAを用いて、Regulatory RNAの発現量を解析した。
Profile Regulatory RNAs in Cancer
Regulatory RNAs or eRNAs are aberrantly expressed in cancer cells, disease or during development. There is a significant over expression of regulatory RNAs in cancer cells compared to normal cells. The figure to the right shows representative eRNAs and LncRNAs that are significantly up regulated in cancer cells. RNA from HFF (normal) and HT1080 (cancer) cells were purified, converted to cDNA and the cDNA was profiled for expression across the regulatory RNA profiler.
エキソソームから精製したRNAを用いて、Regulatory RNAの発現量を解析した。
Detect Regulatory RNAs Exosomes
Expression of regulatory RNAs in patient biofluids was explored using serum exosome studies. Exosomes are nano-sized vesicles secreted by all cell types that transport RNAs between cells. These vesicles are present in biofluids such as serum. Exosomes were isolated from human serum using SBI's ExoQuick (cat # EXO5A-1) and exoRNA was isolated using SeraMir Kit (cat # RA800A-1). Exosomal RNA was converted to cDNA using the RNA-Quant kit (cat # RA430A-1). Expression in exosomes was profiled using the regulatory RNA qPCR array and data normalized to the geometric mean of the plate signals. Sample qPCR data are shown to the right.
追加しました。
Regulatory RNA qPCR Arrayのキット内容
- polyA polymerase buffer
- polyA polymerase
- MnCl2
- ATP
- Oligo dT adaptor
- Reverse transcriptase buffer
- Reverse transcriptase
- Dithiothreitol (DTT)
- dNTP mix
- Random primer mix
- Array primers, dried down in primer plate
- RNase-free water
※別途、SYBR® Green Master Mixが必要です。
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Regulatory RNA qPCR Arrayの価格
[在庫・価格 ：2025年04月26日 00時00分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Regulatory RNA qPCR Profiler(20reactions) |
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本製品は取扱中止になりました | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2025年04月26日 00時00分現在]
Regulatory RNA qPCR Profiler(20reactions)
文献数： 0
- 商品コード：RA950A-1
- メーカー：SBI
- 包装：1kit
- 本製品は取扱中止になりました
| 説明文 | |||
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| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 法規備考 | ||
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | |||
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[在庫・価格 ：2025年04月26日 00時00分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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RNA-Quant cDNA Synthesis Kit (20reactions) |
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[在庫・価格 ：2025年04月26日 00時00分現在]
RNA-Quant cDNA Synthesis Kit (20reactions)
文献数： 0
- 商品コード：RA430A-1
- メーカー：SBI
- 包装：1kit
- 価格：¥158,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 | |||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 | RNA-Quant cDNA Synthesis Kit |
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追加しました。
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