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リアルタイムPCRで疾患関連LncRNAを解析するためのプライマーセット Disease-Related Human LncRNA Profiler

掲載日情報:2013/02/13 現在Webページ番号:5639

神経変性から癌まで各種疾患に関与する83種類のLncRNA(長鎖非翻訳RNA)をリアルタイムPCRで定量解析するためのプライマーセットです。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
がんおよび幹細胞に関連した90種類のLncRNAをリアルタイムPCRで定量するためのcDNAの調製用試薬およびプライマーセットLncRNA Profiler qPCR Array Kitについては,フナコシホームページをご覧下さい。

特  長

  • 細胞周期,分化,自己再生,アポトーシスなどの様々な過程におけるLncRNAの関与の解析に有用です。
  • 特定のリアルタイムPCR装置に合わせた3種類のフォーマットの製品があり(下表参照),それぞれのプライマーを分注した96ウェルプレートが2枚含まれます。
  • #RA920D-1は,任意のリアルタイムPCR装置で使用できるフォーマットであり,96ウェルプレートのそれぞれのウェルに,PCR20回分のプライマーが分注されています。ヌクレアーゼフリーの蒸留水で溶解後,必要量をお手持ちのプレートに加えて下さい。
  • 検出できるLncRNAの詳細およびデータ解析に便利なソフトウェアは,System Biosciences社ホームページの各製品ページにある『Literature』からダウンロードできます。

各LncRNAの詳細情報は,LncRNAデータベースをご覧下さい。
本製品に,cDNA合成用試薬およびSYBR(R) Green master mixは含まれていません。別途ご用意下さい。

本製品の感度

ヒトES細胞から精製したtotal RNAをそれぞれの量用いて,本キットで各LncRNAを解析した。

本製品の再現性

2種類の細胞(HT1080細胞,293T細胞)から精製したRNAについて,二人の研究者(A,B)が本キットを用いて解析を行い,Ct値を求めた。

本製品の特異性

本製品を用いてリアルタイムPCRを行い,それぞれのLncRNAについて解離曲線を作製した。特異的に増幅していることがわかる。
下の画像は,それぞれのLncRNAを逆転写したものの電気泳動像。

2種類の細胞(HT1080細胞,293T細胞)から精製したRNAについて,本キットを用いて解析を行い,Ct値を求めた。

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検出可能なLncRNA

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 21A AAA1 aHIF AK023948 ANRIL anti-NOS2A BACE1AS BC017743 BC043430 BC200 BCMS BIC
B CCND1 ANCR CMPD DD3 DGCR5 DISC2 DLG2AS EGO GAS5 GOMAFU H19 H19-AS HAR1A
C HAR1B HOTAIR HOTAIRM1 HOTTIP HOXA1AS AA489505 HOXA3AS BI823151 HOXA3AS BE873349 HOXA6AS AK092154 HOXA11AS HULC IPW IGF2AS
D KRASP1 L1PA16 LIT LOC285194 LUST LincRNA-
VLDLR
LincRNA-SFMBT2 MALAT1 MEG3 MER11C NEAT1 NCRMS
E NDM29 PANDA PAR5 PCAT-1 PCAT-14 PCAT-29 PCAT-32 PCAT-43 PCGEM1 PR-AT2 PRINS PSF inhibiting RNA
F PTENP1 RMRP ROR SAF SCA8 Sox2OT SRA ST7OT1 ST7OT2 ST7OT3 ST7OT4 Telomerase RNA
G TMEVPG1 TU_001762 9 TUG1 UCA1 WT1-AS Y1 Y3 Y4 Y5 ZEB2NAT 7SK Negative control
H 7SL scRNA 5.8S rRNA U87 scaRNA U6 smRNA ACTB B2M PGK1 GAPDH HPRT1 RPL1A RPL13A GDC

表中,赤色の網かけ部分はコントロール。
GDC(Genomic DNA Control)は,ゲノムDNA混入の確認用。

商品コード 測定
回数
プレートの
枚数
対応したリアルタイムPCR装置
RA920A-1 2回 2枚 ABI:7000, 7300, 7500, 7900HT
RA920B-1 2回 2枚 ABI:7500 Fast, 7900HT Fast, StepOnePlus
RA920C-1 2回 2枚 Bio-Rad:Opticon/Opticon2, Chromo-4, iCycler, MyiQ, iQ5, CFX96
Eppendorf:MasterCycler ep RelPlex
RA920D-1 20回 1枚 任意の装置

[在庫・価格 :2021年06月14日 16時51分現在]

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Disease-Related LncRNA Profiler Pre-Printed 96 well Primer Set, for ABI7000, 7300, etc (2profiles)
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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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