Antibody Array／Cytokine Array／Protein Array Selection Guide 抗体アレイ／タンパク質アレイ製品選択ガイド（RayBiotech社）

RayBiotech社では、抗体アレイ／サイトカインアレイ／プロテインアレイ（Antibody Array / Cytokine Array / Protein Array）を取り扱っています。蛍光スキャナーを使うガラススライドのタイプや、化学発光を検出する特殊な機器を必要としないメンブレンタイプ、定性的に解析するタイプや定量的な解析が行えるタイプなど、多数のシリーズがあります。それぞれのアレイの概要をまとめましたので、目的に合った製品の選択にお役立て下さい。

※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

項目をクリックすると製品の詳細、図をクリックすると拡大図をご覧いただけます。

※ アレイ解析専用ソフトウェア（無償）ご希望の方は、アレイ製品の商品コードを確認の上、テクニカルサポート（試薬担当）までお問い合わせ下さい。

品名をクリックすると製品の詳細、商品コードをクリックすると直接価格表がご覧いただけます。

RTK, EGFR, MAPK, AKT Pathwayなどのリン酸化タンパクを検出するアレイです。詳細は「Phosphorylation Antibody Array」をご覧下さい。

幅広い種類のヒトタンパク質における糖化プロファイル,タンパク質-糖鎖間の相互作用,グリコシル化などを一斉に解析することのできるガラススライドアレイです。蛍光スキャナーを使用して半定量が行えます。詳細は「Human Glycosylation Antibody Arrayシリーズ」をご覧下さい。

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マウスまたはラットイムノグロブリン（Ig）のサブクラスおよび軽鎖の種類を迅速に同定できる、1ステップの抗体アレイです。抗体産生ハイブリドーマのスクリーニング、モノクローナル抗体のアイソタイプ同定、免疫疾患研究などに有用です。詳細は「Rapid Mouse/Rat Ig Isotyping Array」をご覧下さい。

測定したい因子から抗体アレイ製品を検索できるツールArray Pickerをお使いいただくと、簡単に目的の製品を検索できます。
使用方法についてはこちらをご覧下さい。

ご希望の製品が見つからない場合や探しにくい場合は、当社テクニカルサポート（試薬担当）までお問い合わせ下さい。
また、抗体アレイの受託作製サービスも承ります。詳細についてはこちらをご覧下さい。

Q-1. 定量（quantitative）と半定量（semi-quantitative）の違いは何ですか?

A-1. 定量的データは分析物の実際の濃度（pg/mlなど）で、半定量的データは比較される2種類以上の試料の相対的な変化です。

Q-2. メンブレンベースとガラススライドベースのアレイの違いは何ですか?

A-2.ガラススライドとメンブレンベースのアレイには、いくつかの違いがあります。主な違いは、使用される検出の種類です。RayBiotech社のガラススライドベースのアレイは蛍光を使用し、互換性のあるレーザースキャナが必要です（互換性のある/推奨レーザースキャナのリストについては、次の答えの下のリンクを参照して下さい）。メンブレンベースのアレイは、ほとんどのウエスタンブロットイメージングシステムで検出できる化学発光を使用しています。

ガラススライドベースに必要な試料量は、メンブレンベースよりも少ないです。ガラススライドは70μl～100μlを必要としますが、メンブレンは希釈後に少なくとも1 mlを必要とします。

最後に、ガラススライドベースのアレイの価格は一般的に安いです。

Q-3. アレイを処理するにはどのような機器が必要ですか?

A-3.メンブレンベースのアレイでは、X線フィルム開発、CCDカメラ、ゲルドキュメンテーションシステムなどの化学発光イメージングシステムが必要です。Li-Cor OdysseyやTyphoonシステムなどの近赤外小麦粉を使用したイメージングシステムも、メンブレンアレイと非常によく適合します。
ガラススライドベースのアレイには、遺伝子マイクロアレイレーザースキャナが必要です。仕様と互換性のあるレーザースキャナのリストは、RayBiotech社 ガラススライド抗体アレイの対応スキャナーをご覧下さい。

Q-4. アレイに使用できる試料の種類は何ですか？

A-4.RayBiotech社のアレイのほとんどは、任意の生物学的試料を使用できます。これには、細胞培養培地、細胞ライセート、組織ライセート、およびすべての精製体液（血清、血漿、尿、脳脊髄液、BAL、唾液、涙など）が含まれます。
例外は、ライセートおよび非血清／血漿に限られているLシリーズ製品です。膜結合レセプターを検出するリン酸化アレイは、細胞および組織ライセートでの使用に対してのみ測定できます。
一般に、可溶性の非変性タンパク質を含む無細胞抽出物は、RayBiotech社のアレイで測定できる可能性があります。

Q-5. 試料の準備方法を教えて下さい。

A-5. 試料準備のヒントは、Tips on Sample Preparationをご参照下さい。

Q-6. アレイのポジティブとネガティブのコントロールとは何ですか?

A-6.ポジティブコントロールのスポットは、標準化された量のビオチン化IgGです。これらは、シグナルの正規化、検出ステップの監視、およびアレイ画像の向きに役立つ目的で使用されます。
ネガティブコントロールのスポットはバッファーだけでスポットされているため、シグナルを出すものではありません。ネガティブコントロールのスポットは、バックグラウンドの減算に使用されます。

「blank」とラベル付けされたアレイマップ上の領域は空です（何もスポットされていません）。ネガティブコントロールとblankの両方のスポットは、同様の強度値を与える必要があり、どちらかがバックグラウンドを表すために使用することができます。

Q-7. アレイからデータを抽出するにはどうすればよいですか?

A-7.メンブレンアレイの場合、データ収集はあらゆる密度測定ソフトウェアによって達成できます。CCDカメラベースのイメージングシステムは、通常、内蔵の密度測定ソフトウェアアプリケーションを搭載しています。または、NIH (Image J)を通じて利用可能な無料の濃度測定プログラムがあり、こちらでダウンロードすることができます。Image Jの使用方法の詳細については、こちらを参照して下さい。

ガラススライドベースのアレイの場合、データ抽出はレーザースキャナに関連付けられたソフトウェアアプリケーションによって行われます。

※ アレイ解析専用ソフトウェア（無償）ご希望の方は、アレイ製品の商品コードを確認の上、テクニカルサポート（試薬担当）までお問い合わせ下さい。

Q-8. アレイデータを正規化する方法は？

A-8.正規化は、アレイ上のポジティブコントロールのスポットのシグナル強度の差を考慮して、アレイ間のデータ（すなわち、異なる試料）を比較するために使用されます。ポジティブコントロールは、固体支持体に結合されたビオチン化抗体の量であるため、これを行うことができます。これらの各スポットからのシグナル量は、1）その抗体に結合したレポーター（ストレプトアビジンHRPまたはストレプトアビジン - フルオール）の量、および2）露光時間（化学発光検出用）に依存します。

これらの要因はアレイ上の各スポットのシグナル強度に比例して影響するため、アレイ間のポジティブコントロールのシグナルの差は、それらのアレイ上の他のスポット間の差を正確に反映します。

1つのアレイは、他のアレイのシグナルが正規化される「reference array」として定義する必要があります。どのアレイをreference arrayにするかを定義するのは研究者次第です。

正規化された値は、次のように計算できます。
X（nY） = X（Y） x P1/P（Y）
P1 = reference array上のポジティブコントロールのスポットの平均シグナル密度
P（Y） = アレイ Y のポジティブコントロールのスポットの平均シグナル密度
X（Y） = 試料"Y"のアレイ上の特定のスポットのシグナル密度
X（nY）= 試料"Y"のアレイ上の特定のスポット "X" の正規化された値
RayBiotech社の解析ソフトウェア ツールは、正規化を自動的に実行できることに注意して下さい。

※ アレイ解析専用ソフトウェア（無償）ご希望の方は、アレイ製品の商品コードを確認の上、テクニカルサポート（試薬担当）までお問い合わせ下さい。

Q-9. アレイの感度は？

A-9.感度データ:
Quantibodyアレイ：こちらからダウンロードすることができます。

ヒトサイトカイン抗体アレイ：こちらからダウンロードすることができます。

マウスサイトカイン抗体アレイ：こちらからダウンロードすることができます。

Q-10. 必要なスライドの枚数は？

A-10.下記資料をご参照下さい。
Quantibody Standard Optionsからダウンロードすることができます。

Q-11. ガラススライドアレイを使用したいが、レーザースキャナがない場合はどうしたらいいですか?

A-11.当社受託サービスにて承ります。ご注文方法、お見積りなどの詳細は、当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。
また、抗体アレイの受託作製サービスも承ります。詳細についてはこちらをご覧下さい。