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高精度な次世代シークエンサーを用いた微生物相解析(腸内フローラ解析) 次世代シークエンシングによる微生物相解析受託サービス

掲載日情報:2017/01/24 現在Webページ番号:7853

次世代シークエンサーを用いて大量の細菌16S rRNA遺伝子配列を解析し,腸内フローラなどの試料中に存在する細菌の数や種類を詳細に解析する受託サービスです。

特長

  • 高精度な次世代シークエンサーを用いることでマイナーな菌群や,詳細な菌種構成を把握することができます。
  • DNA抽出からデータ解析まで,全工程に対応します。
  • 各検体間の菌群組成,類似性を視覚的に提示します。

秘密保持契約にも対応致します。詳細は,当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。

次世代シーケンス微生物相解析において正確な結果を得るためにはDNA抽出を効率よく行い,かつPCR増幅を正確に行うことが重要となります。DNA抽出には抽出効率の高いDNA抽出キット(Extrap Soil DNA kit Plus ver.2)を使用し,試料中の微生物群のDNAをより多く正確に抽出します。

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解析内容

リード長340 bp,410 bp,430 bpの3つの解析に加え,真菌のメニューをご用意しております。目的に合わせてお選び下さい。

下記以外の領域をご希望の場合はお問い合わせ下さい。

リード長 340 bp 410 bp 430 bp 約230 bp, 450 bp
解析対象 細菌 細菌,古細菌 細菌 真菌
解析領域 V1,V2 V4,V5 V3,V4 ITS1
保証リード数 10,000 リード 10,000 リード 10,000リード *

* 真菌は配列によってはリード数が少なくなる場合があります。

  • DNA抽出
  • NGS(MiSeq)を用いた16S rRNA遺伝子の定量
  • PCR増幅
  • シーケンス解析
  • データ解析

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報告内容

  • 塩基配列データ,相同性検索結果(ヒートマップ),菌群組成グラフ
  • 多様性解析結果(α多様性)

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オプション

多様性解析結果(β多様性),病原性の一次スクリーニング,文献調査

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ご注文方法

詳細は,当社受託・特注品業務担当までお気軽にお問い合わせ下さい。
価格,納期などについては,ご依頼内容に応じて個別にお見積りいたします。

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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。