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EpiNext ISAC-seqシリーズ
クロマチンアクセシビリティのゲノムワイド解析に有用です! EpiNext ISAC-seqシリーズ
掲載日情報:2026/06/19 現在Webページ番号:73320
クロマチンアクセシビリティのゲノムワイド解析に有用なEpiNext ISAC-seqシリーズをご紹介します。以下の製品ラインナップを取りそろえています。
- EpiNext ISAC-seq Kit:組織・細胞試料からin situアクセシブルクロマチン(ISAC)を調製した後、ライブラリー調製を行える全工程対応のキット。
- EpiNext ISAC Preparation Kit:ISAC調製までを行えるキット。調製したISACは、リアルタイムPCR解析やライブラリー調製に使用できる。
- EpiNext ISAC Library Preparation Kit:お客様が調製したISACから精製した切断DNAより、ライブラリー調製を行えるキット。
また、関連製品として、qPCRによりわずか1.5時間で遺伝子特異的なオープンおよびクローズドクロマチン状態を迅速に定量化するEpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kitも取りそろえています。
追加しました。
ISAC-seqおよびATAC-seqについて
ISAC-seq(in situ Accessible Chromatin Sequencing)は、EpigenTek社が開発した新しい手法で、クロマチンアクセシビリティ解析を大幅に向上させ、ATAC-seqが有する制限事項への対応を図ります。
ISAC-seqとATAC-seqの比較
| 手法 | ISAC-seq | ATAC-seq* |
|---|---|---|
| 操作に要するステップ数 | 全38ステップ | 50ステップ以上 |
| 細胞の直接使用 | 可能 | 可能 |
| 必要な細胞数(目安) | 50,000 cells | 50,000 cells |
| ライブラリー調製に用いる手法 | ライゲーション+PCR | PCR |
| プロトコル所要時間 | 1時間40分 | 2~10時間 |
| 配列によるバイアス | 低い | 比較的高い |
| カバレッジ数(アクセシブル部位) | 多い | 少ない |
* 他社製品のプロトコルをもとに比較表を作成しています。
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製品ラインナップ
商品コードをクリックすると、各製品の価格表をご覧いただけます。
| 品名 | 製品概要 | 商品コード |
|---|---|---|
| EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit |
・組織・細胞試料からin situアクセシブルクロマチン(ISAC)を調製した後、Illuminaプラットフォームのライブラリー調製を行える全工程対応のキット。 ・クロマチンアクセシビリティ(オープン/クローズドクロマチンのプロファイリング)およびヌクレオソーム/転写因子の位置推定を、次世代シーケンス(NGS)によりゲノムワイドに解析できる。 |
P-1073 |
| EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit |
・組織・細胞試料からISAC調製までを行えるキット。 ・調製したISACは、リアルタイムPCRによる遺伝子特異的解析や、NGSによるゲノムワイド解析に使用できる。 |
P-1072 |
| EpiNext ISAC Library Preparation Kit |
・お客様が調製したISACから精製した切断DNAより、Illuminaプラットフォームのライブラリー調製を行えるキット。 ・微量DNA試料からでも迅速なライブラリー調製を行え、ゲノムワイド解析を行える。 |
P-1057 |
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EpiNext ISAC-seq Kit(#P-1073)の特長
- 迅速なプロトコル:わずか1時間40分で完了します。
- トランスポザーゼによるバイアスの回避:配列特異的な切断およびGC/ATバイアスを回避します。
- 配列依存性の低い結合:アクセシブルなクロマチン領域のカバレッジを向上させます。
- 高いコスト効率:従来のアッセイと比べて、反応あたりのコストを低減します。
- シームレスな解析:標準的なChIP-seqバイオインフォマティクス解析法に対応しています。
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操作方法概略
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使用例
図1. EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit(#P-1073)で調製したライブラリーの特性評価
30,000 cellsのMCF-7細胞からクロマチンをin situで切断し、本キットを用いてDNAライブラリーを調製した。調製したライブラリーをBioanalyzerで解析した。典型的なライブラリーでは、上記のエレクトロフェログラムに示すように、400 bp付近にピークを持つ断片が含まれている。
図2. EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit(#P-1072)で調製したISACの特性評価
本キットを用いて、30,000 cellsのMCF-7細胞からin situアクセシブルクロマチンを調製した。得られたアクセシブルクロマチンからDNAを精製し、リアルタイムPCR解析およびライブラリー調製に使用した。
A. 恒常的に発現または抑制されている標的遺伝子の近位プロモーター領域について、ポジティブコントロール(GAPDH)およびネガティブコントロール(HBB)プライマー、さらにEpiQuik Quantitative PCR Fast Kit (#P-1029) を用いて増幅を実施した。
・ピンク(HBB)および緑色(GAPDH)のライン:キットに含まれるCEM(Cleavage Enzyme Mix)で処理済み
・青色(HBB)および茶色(GAPDH)のライン:CEM未処理
GAPDHではCEM処理群と未処理群のCt値の差は>1,500%であり、オープンクロマチン領域であることを示す。一方、HBBではCEM処理群と未処理群のCt値の差は<400%であり、比較的クローズドなクロマチン領域であることを示す。
B. 調製したライブラリーをBioanalyzerで解析した。典型的なライブラリーでは、上記のエレクトロフェログラムに示すように、400 bp付近にピークを持つ断片が含まれている。
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キット内容
| 品名 | EpiNext ISAC-seq Kit | EpiNext ISAC Preparation Kit | EpiNext ISAC Library Preparation Kit | |
|---|---|---|---|---|
| 商品コード | P-1073 | P-1072 | P-1057 | |
| キット 内容 |
PB (Permeabilization buffer) | ● | ● | - |
| PIC (Protease inhibitor cocktail) | ● | ● | - | |
| NDE (Nuclear digestion enhancer) | ● | ● | - | |
| CEM (Cleavage enzyme mix) | ● | ● | - | |
| CSS (Cleavage stop solution) | ● | ● | - | |
| Proteinase K | ● | ● | - | |
| PDB (Protein digestion buffer) | ● | - | - | |
| DPS (DNA purification solution) | ● | ● | - | |
| DNA binding beads | ● | ● | - | |
| Elution buffer | ● | ● | ● | |
| Q-End polishing buffer | ● | - | ● | |
| Q-End polishing enzyme mix | ● | - | ● | |
| Ligation buffer | ● | - | ● | |
| T4 DNA ligase | ● | - | ● | |
| Adaptors | ● | - | ● | |
| MQ binding beads | ● | - | ● | |
| HiFi PCR master mix | ● | - | ● | |
| Universal primer | ● | - | ● | |
| Index primer 1 | ● | - | ● | |
※ その他の必要な試薬・装置類は、各製品のマニュアルをご確認下さい。
追加しました。
価格
EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
|
EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit(12 reactions) |
|
0 | |||
|
EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit(24 reactions) |
|
0 | |||
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit(12 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1073-12
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥152,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
EpiNext In Situ Accessible Chromatin Sequencing (ISAC-seq) Kit(24 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1073-24
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥252,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
|
EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit(24 reactions) |
|
0 | |||
|
EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit(48 reactions) |
|
0 | |||
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit(24 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1072-24
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥64,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
EpiNext In Situ Accessible Chromatin (ISAC) Preparation Kit(48 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1072-48
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥89,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
EpiNext ISAC Library Preparation Kit
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
|
EpiNext ISAC Library Preparation Kit(24 reactions) |
|
0 | |||
|
EpiNext ISAC Library Preparation Kit(48 reactions) |
|
0 | |||
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
EpiNext ISAC Library Preparation Kit(24 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1057-24
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥177,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
EpiNext ISAC Library Preparation Kit(48 reactions)
文献数: 0
- 商品コード:P-1057-48
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥303,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
追加しました。
関連製品
EpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kit
リアルタイムPCRを用いて各種生体試料から遺伝子特異的なクロマチンアクセシビリティ解析を行うために最適化された試薬をそろえたキットです。ヌクレオソームおよび転写因子の位置決定にも利用することができます。オープンクロマチンおよびクローズドクロマチンを迅速に検出できる、コスト効率に優れた有用なツールです。
[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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EpiQuik Chromatin Accessibility Kit (48 assays) |
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15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 :2026年06月19日 13時55分現在]
EpiQuik Chromatin Accessibility Kit (48 assays)
文献数: 15
- 商品コード:P-1047-48
- メーカー:EPG
- 包装:1kit
- 価格:¥152,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
| 説明文 | |||
|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 4℃,-20℃,暗所保存 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2022年11月1日号 p.21 ニュース2021年3月15日号 p.20
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| 製品記事 | EpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kit |
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追加しました。
製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。
